Cell Type | Markers | TIMER2.0 | GEPIA | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
 |  | Correlation | p | Correlation# | p # | Correlation | p |
B cell | CD19 | 0.29 | *** | 0.24 | *** | 0.29 | *** |
CD79A | 0.27 | *** | 0.22 | *** | 0.27 | *** | |
CD79B | -0.23 | *** | -0.27 | *** | -0.21 | *** | |
CD8 + T cell | CD8A | 0.08 | 0.06 | 0.06 | 0.17 | 0.079 | 0.07 |
CD8B | 0.05 | 0.22 | 0.02 | 0.63 | 0.044 | 0.31 | |
DC | CD1C | -0.08 | 0.04 | -0.15 | ** | -0.09 | 0.05 |
CD141 | 0.17 | *** | 0.13 | ** | 0.18 | *** | |
HLA-DPB1 | 0.04 | 0.39 | -0.01 | 0.87 | 0.04 | 0.32 | |
HLA-DQB1 | -0.07 | 0.13 | -0.11 | * | -0.05 | 0.30 | |
HLA-DRA | 0.05 | 0.22 | 0.02 | 0.67 | 0.06 | 0.15 | |
HLA-DPA1 | 0.04 | 0.31 | -0.01 | 0.92 | 0.05 | 0.23 | |
NRP1 | 0.02 | 0.70 | -0.03 | 0.55 | 0.03 | 0.45 | |
ITGAX | 0.18 | *** | 0.19 | *** | 0.17 | *** | |
Monocyte | CD14a | 0.33 | *** | 0.31 | *** | 0.33 | *** |
CD16a | 0.27 | *** | 0.24 | *** | 0.27 | *** | |
CD16b | 0.05 | 0.21 | 0.06 | 0.18 | 0.25 | *** | |
CSF1R | 0.28 | *** | 0.24 | *** | 0.27 | *** | |
TAM | CD80 | 0.23 | *** | 0.22 | *** | 0.25 | *** |
CD11b | 0.25 | *** | 0.23 | *** | 0.25 | *** | |
IL-10 | 0.23 | *** | 0.21 | *** | 0.25 | *** | |
CD86 | 0.23 | *** | 0.21 | *** | 0.23 | *** | |
HLA-G | -0.05 | 0.23 | -0.09 | 0.06 | -0.02 | 0.73 | |
Macrophage | CD68 | 0.38 | *** | 0.39 | *** | 0.33 | *** |
CD11b | 0.25 | *** | 0.23 | *** | 0.25 | *** | |
M1 | NOS2 | -0.15 | *** | -0.20 | *** | -0.12 | ** |
IL-12B | 0.04 | 0.35 | 0.01 | 0.81 | 0.04 | 0.42 | |
HLA-DR | 0.05 | 0.22 | 0.02 | 0.67 | 0.06 | 0.15 | |
IRF5 | 0.06 | 0.14 | 0.07 | 0.14 | 0.06 | 0.19 | |
M2 | ARG1 | -0.02 | 0.59 | 0.01 | 0.90 | -0.07 | 0.10 |
MRC1 | 0.05 | 0.24 | 0.04 | 0.45 | 0.07 | 0.11 | |
CD204 | 0.25 | *** | 0.24 | *** | 0.25 | *** | |
MS4A4A | 0.30 | *** | 0.27 | *** | 0.3 | *** | |
CD163 | 0.34 | *** | 0.33 | *** | 0.41 | *** | |
VSIG4 | 0.43 | *** | 0.43 | *** | 0.44 | *** | |
MDSC | CD11b | 0.25 | *** | 0.23 | *** | 0.25 | *** |
CD33 | 0.17 | *** | 0.14 | *** | 0.16 | *** | |
CAF | PDGFRa | 0.29 | *** | 0.25 | *** | 0.31 | *** |
PDGFRb | 0.01 | 0.78 | -0.03 | 0.47 | 0.03 | 0.44 | |
FSP1 | 0.16 | *** | 0.16 | *** | 0.18 | *** | |
FAP | 0.47 | *** | 0.43 | *** | 0.45 | *** | |
aSMA | 0.03 | 0.50 | -0.01 | 0.80 | -0.01 | 0.90 | |
Th cell | TBX21 | -0.02 | 0.06 | -0.13 | * | -0.07 | 0.10 |
IL2 | 0.15 | *** | 0.12 | * | 0.15 | *** | |
STAT6 | -0.08 | 0.08 | -0.08 | 0.10 | -0.02 | 0.59 | |
IL4 | -0.01 | 0.81 | -0.02 | 0.65 | -0.05 | 0.22 | |
IL5 | -0.05 | 0.23 | -0.05 | 0.28 | -0.10 | * | |
Treg | FOXP3 | 0.35 | *** | 0.34 | *** | 0.35 | *** |
CCR8 | 0.27 | *** | 0.24 | *** | 0.26 | *** | |
TGFB1 | 0.35 | *** | 0.31 | *** | 0.36 | *** | |
IL2RA | 0.41 | *** | 0.41 | *** | 0.43 | *** | |
IL7R | 0.13 | ** | 0.07 | 0.12 | 0.13 | ** | |
T exausted | HAVCR2 LAG3 | -0.07 0.14 | 0.11 *** | -0.09 0.09 | 0.06 0.06 | -0.05 0.12 | 0.25 ** |
CXCL13 | 0.25 | *** | 0.22 | *** | 0.24 | *** | |
LAYN | -0.18 | *** | -0.20 | *** | -0.16 | *** | |
T memory | CCR7 | 0.21 | *** | 0.20 | *** | 0.22 | *** |
MYADM | -0.08 | 0.07 | -0.07 | 0.12 | -0.06 | 0.20 | |
CXCR6 | 0.19 | *** | 0.15 | ** | 0.19 | *** | |
CD69 | 0.07 | 0.10 | 0.02 | 0.65 | 0.08 | 0.09 | |
GZMA | 0.00 | 0.93 | -0.07 | 0.13 | 0.00 | 0.91 | |
GZMK | 0.03 | 0.48 | -0.03 | 0.57 | 0.02 | 0.59 | |
DUSP4 | 0.07 | 0.09 | 0.04 | 0.36 | 0.06 | 0.17 | |
T effector | FGFBP2 | -0.31 | *** | -0.35 | *** | -0.28 | *** |
CX3CR1 | 0.02 | 0.69 | -0.03 | 0.48 | 0.03 | 0.44 | |
T naive | SELL | 0.16 | *** | 0.11 | * | 0.17 | *** |