Skip to main content

Table 4 Correlation between ITPR1 and related gene markers of immune cells

From: Systematic analysis of the expression and prognostic value of ITPR1 and correlation with tumor infiltrating immune cells in breast cancer

Description Gene markers BRCA BRCA-Basal BRCA-Luminal BRCA-Her2
None Purity None Purity None Purity None Purity
Cor P Cor P Cor P Cor P Cor P Cor P Cor P Cor P
T cell CD3D -0.099 0.000 -0.13 0.000 0.405 0.000 0.165 0.063 -0.043 0.291 -0.032 0.458 -0.128 0.301 -0.154 0.250
CD3E -0.058 0.055 -0.08 0.011 0.416 0.000 0.178 0.045 -0.034 0.399 -0.023 0.6 -0.146 0.239 -0.176 0.186
CD2 -0.056 0.063 -0.076 0.016 0.476 0.000 0.281 0.001 -0.016 0.683 0.002 0.962 -0.151 0.223 -0.217 0.102
CD8 + T cell CD8A 0.004 0.903 -0.012 0.699 0.394 0.000 0.179 0.043 0.012 0.773 0.031 0.475 -0.13 0.292 -0.165 0.216
CD8B -0.102 0.000 -0.127 0.000 0.4 0.000 0.3 0.000 0.01 0.807 0.007 0.869 -0.146 0.237 -0.171 0.201
B cell CD19 -0.122 0.000 -0.145 0.000 0.284 0.000 - 0.99 -0.031 0.446 -0.023 0.587 -0.115 0.356 -0.563 0.000
CD79A -0.089 0.000 -0.11 0.000 0.284 0.000 -0.01 0.914 0.006 0.879 0.022 0.602 -0.123 0.319 -0.11 0.41
Monocyte CD86 0.006 0.843 -0.001 0.976 0.53 0.000 0.362 0.000 0.012 0.757 0.027 0.525 0.084 0.5 0.073 0.587
CD115(CSF1R) 0.134 0.000 0.134 0.000 0.605 0.000 0.472 0.000 0.137 0.000 0.151 0.000 0.097 0.432 0.129 0.336
TAM CCL2 -0.087 0.000 -0.084 0.000 0.4.3 0.000 0.261 0.003 -0.042 0.293 -0.02 0.641 -0.051 0.681 -0.02 0.883
CD68 -0.012 0.681 -0.023 0.466 0.548 0.000 0.389 0.000 -0.062 0.127 -0.061 0.158 0.145 0.242 0.16 0.230
IL10 -0.003 0.918 -0.005 0.883 0.538 0.000 0.402 0.000 -0.02 0.619 -0.013 0.76 0.033 0.792 0.006 0.967
M1 Macrophage IRF5 0.002 0.952 -0.018 0.571 0.393 0.000 0.225 0.011 0 0.997 -0.7 0.865 -0.014 0.911 -0.017 0.899
INOS(NOS2) -0.018 0.544 -0.013 0.693 0.034 0.689 0.088 0.325 0.03 0.45 0.008 0.853 0.157 0.204 0.151 0.257
COX2(PTGS2) 0.007 0.806 0.015 0.636 0.128 0.13 0.202 0.022 0.128 0.001 0.134 0.002 0.185 0.134 0.156 0.242
M2 Macrophage CD163 0.04 0.181 0.035 0.277 0.589 0.000 0.46 0.000 0.076 0.059 0.088 0.041 0.177 0.152 0.207 0.119
VSIG4 0.084 0.000 0.073 0.021 0.511 0.000 0.383 0.000 0.096 0.018 0.093 0.029 0.155 0.211 0.179 0.179
MS4A4A 0.048 0.11 0.041 0.199 0.525 0.000 0.384 0.000 0.032 0.428 0.041 0.34 -0.028 0.82 -0.036 0.787
Neutrophils CD11b(ITGAM) 0.088 0.000 0.083 0.000 0.53 0.000 0.387 0.000 0.031 0.443 0.032 0.461 0.261 0.033 0.316 0.019
CCR7 -0.012 0.69 -0.023 0.465 0.401 0.000 0.156 0.078 0.011 0.79 0.02 0.646 -0.005 0.965 -0.018 0.891
Natural killer cell KIR2DL1 -0.074 0.014 -0.093 0.000 0.188 0.026 0.032 0.717 0.004 0.917 0.002 0.955 -0.077 0.538 -0.083 0.538
KIR2DL3 -0.061 0.043 -0.059 0.065 0.336 0.000 0.191 0.030 -0.027 0.496 0.008 0.86 -0.066 0.595 -0.084 0.532
KIR2DL4 -0.138 0.000 -0.144 0.000 0.297 0.000 0.121 0.173 -0.049 0.222 -0.037 0.386 -0.06 0.628 -0.073 0.584
KIR3DL1 -0.068 0.024 -0.078 0.013 0.335 0.000 0.19 0.032 -0.006 0.876 0.002 0.962 -0.004 0.973 -0.034 0.799
KIR3DL2 -0.087 0.004 -0.096 0.002 0.31 0.000 0.145 0.102 -0.031 0.446 0.001 0.978 -0.129 0.297 -0.206 0.121
KIR3DL3 -0.063 0.038 -0.072 0.022 0.134 0.115 0.027 0.766 -0.013 0.741 0.009 0.83 -0.161 0.194 -0.166 0.212
KIR2DS4 -0.079 0.008 -0.093 0.003 0.184 0.029 -0.003 0.977 -0.01 0.806 -0.007 0.878 -0.236 0.055 -0.263 0.044
Dendritic cell HLA-DPB1 0.016 0.602 -0.003 0.936 0.44 0.000 0.232 0.008 0.025 0.533 0.027 0.528 -0.063 0.613 -0.1 0.455
HLA-DQB1 0.016 0.602 -0.071 0.026 0.387 0.000 0.211 0.017 -0.019 0.634 -0.013 0.753 -0.088 0.476 -0.102 0.448
HLA-DRA 0.047 0.118 0.041 0.197 0.498 0.000 0.326 0.000 0.039 0.33 0.052 0.228 -0.044 0.722 -0.071 0.596
HLA-DPA1 0.108 0.000 0.114 0.000 0.502 0.000 0.343 0.000 0.08 0.048 0.097 0.024 -0.093 0.454 -0.133 0.319
BDCA-1(CD1C) 0.125 0.000 0.141 0.000 0.347 0.000 0.169 0.056 0.125 0.002 0.146 0.000 0.07 0.572 0.085 0.524
BDCA-4(NRP1) 0.216 0.000 0.213 0.000 0.597 0.000 0.524 0.000 0.066 0.103 0.055 0.203 -0.019 0.878 0.004 0.979
CD11c(ITGAX) -0.005 0.863 -0.011 0.722 0.515 0.000 0.338 0.000 -0.044 0.277 -0.04 0.352 0.055 0.656 0.099 0.461
Helper T cell 1 (TH1) T -bet (TBX21) -0.069 0.022 -0.095 0.003 0.441 0.000 0.247 0.005 -0.002 0.958 0.017 0.691 0.076 0.539 -0.117 0.382
STAT4 0.032 0.293 0.018 0.573 0.548 0.000 0.388 0.000 0.038 0.351 0.041 0.334 -0.191 0.122 -0.223 0.092
STAT1 0.068 0.024 0.061 0.054 0.501 0.000 0.388 0.000 0.03 0.451 0.036 0.398 0.077 0.537 0.007 0.96
IFNG -0.14 0.000 -0.162 0.000 0.359 0.000 0.186 0.036 -0.032 0.423 -0.016 0.705 -0/019 0.88 -0.034 0.798
TNF -0.116 0.000 -0.097 0.002 0.278 0.000 0.167 0.060 0.012 0.773 0.047 0.275 0.019 0.876 0.058 0.663
Regulatory cell (Treg) FOXP3 -0.128 0.000 -0.136 0.000 0.394 0.000 0.175 0.048 -0.11 0.006 -0.101 0.019 -0.12 0.331 -0.176 0.187
CCR8 0.021 0.489 0.022 0.489 0.524 0.000 0.364 0.000 -0.011 0.776 0.002 0.959 0.277 0.024 0.279 0.034
TGFB1 (TGFβ) 0.119 0.000 0.117 0.000 0.513 0.000 0.348 0.000 -0.075 0.061 -0.088 0.041 0.153 0.214 0.161 0.228
T cell exhaustion PD-1 (PDCD1) -0.142 0.000 -0.171 0.000 0.319 0.000 0.087 0.326 -0.054 0.179 -0.04 0.35 -0.098 0.43 -0.093 0.486
CTLA4 -0.179 0.000 -0.199 0.000 0.428 0.000 0.208 0.019 -0.069 0.086 -0.046 0.282 -0.028 0.819 -0.06 0.654
LAG3 -0.241 0.000 -0.248 0.000 0.341 0.000 0.148 0.095 -0.096 0.017 -0.068 0.114 -0.032 0.799 -0.07 0.602
TIM-3 (HAVCR2) 0.047 0.12 0.035 0.264 0.575 0.000 0.426 0.000 -0.015 0.716 -0.015 0.724 0.128 0.302 0.131 0.329
GZMB -0.243 0.000 -0.279 0.000 0.349 0.000 0.144 0.105 -0.09 0.026 -0.085 0.048 -0.093 0.452 -0.111 0.407