Systematic analysis of the expression and prognostic value of ITPR1 and correlation with tumor infiltrating immune cells in breast cancer

Han, Bing; Zhen, Fang; Zheng, Xiu-Shuang; Hu, Jing; Chen, Xue-Song

doi:10.1186/s12885-022-09410-w

Table 4 Correlation between ITPR1 and related gene markers of immune cells

From: Systematic analysis of the expression and prognostic value of ITPR1 and correlation with tumor infiltrating immune cells in breast cancer

Description	Gene markers	BRCA				BRCA-Basal				BRCA-Luminal				BRCA-Her2
		None		Purity		None		Purity		None		Purity		None		Purity
		Cor	P	Cor	P	Cor	P	Cor	P	Cor	P	Cor	P	Cor	P	Cor	P
T cell	CD3D	-0.099	0.000	-0.13	0.000	0.405	0.000	0.165	0.063	-0.043	0.291	-0.032	0.458	-0.128	0.301	-0.154	0.250
	CD3E	-0.058	0.055	-0.08	0.011	0.416	0.000	0.178	0.045	-0.034	0.399	-0.023	0.6	-0.146	0.239	-0.176	0.186
	CD2	-0.056	0.063	-0.076	0.016	0.476	0.000	0.281	0.001	-0.016	0.683	0.002	0.962	-0.151	0.223	-0.217	0.102
CD8 + T cell	CD8A	0.004	0.903	-0.012	0.699	0.394	0.000	0.179	0.043	0.012	0.773	0.031	0.475	-0.13	0.292	-0.165	0.216
CD8 + T cell	CD8B	-0.102	0.000	-0.127	0.000	0.4	0.000	0.3	0.000	0.01	0.807	0.007	0.869	-0.146	0.237	-0.171	0.201
B cell	CD19	-0.122	0.000	-0.145	0.000	0.284	0.000	-	0.99	-0.031	0.446	-0.023	0.587	-0.115	0.356	-0.563	0.000
B cell	CD79A	-0.089	0.000	-0.11	0.000	0.284	0.000	-0.01	0.914	0.006	0.879	0.022	0.602	-0.123	0.319	-0.11	0.41
Monocyte	CD86	0.006	0.843	-0.001	0.976	0.53	0.000	0.362	0.000	0.012	0.757	0.027	0.525	0.084	0.5	0.073	0.587
Monocyte	CD115(CSF1R)	0.134	0.000	0.134	0.000	0.605	0.000	0.472	0.000	0.137	0.000	0.151	0.000	0.097	0.432	0.129	0.336
TAM	CCL2	-0.087	0.000	-0.084	0.000	0.4.3	0.000	0.261	0.003	-0.042	0.293	-0.02	0.641	-0.051	0.681	-0.02	0.883
	CD68	-0.012	0.681	-0.023	0.466	0.548	0.000	0.389	0.000	-0.062	0.127	-0.061	0.158	0.145	0.242	0.16	0.230
	IL10	-0.003	0.918	-0.005	0.883	0.538	0.000	0.402	0.000	-0.02	0.619	-0.013	0.76	0.033	0.792	0.006	0.967
M1 Macrophage	IRF5	0.002	0.952	-0.018	0.571	0.393	0.000	0.225	0.011	0	0.997	-0.7	0.865	-0.014	0.911	-0.017	0.899
	INOS(NOS2)	-0.018	0.544	-0.013	0.693	0.034	0.689	0.088	0.325	0.03	0.45	0.008	0.853	0.157	0.204	0.151	0.257
	COX2(PTGS2)	0.007	0.806	0.015	0.636	0.128	0.13	0.202	0.022	0.128	0.001	0.134	0.002	0.185	0.134	0.156	0.242
M2 Macrophage	CD163	0.04	0.181	0.035	0.277	0.589	0.000	0.46	0.000	0.076	0.059	0.088	0.041	0.177	0.152	0.207	0.119
	VSIG4	0.084	0.000	0.073	0.021	0.511	0.000	0.383	0.000	0.096	0.018	0.093	0.029	0.155	0.211	0.179	0.179
	MS4A4A	0.048	0.11	0.041	0.199	0.525	0.000	0.384	0.000	0.032	0.428	0.041	0.34	-0.028	0.82	-0.036	0.787
Neutrophils	CD11b(ITGAM)	0.088	0.000	0.083	0.000	0.53	0.000	0.387	0.000	0.031	0.443	0.032	0.461	0.261	0.033	0.316	0.019
Neutrophils	CCR7	-0.012	0.69	-0.023	0.465	0.401	0.000	0.156	0.078	0.011	0.79	0.02	0.646	-0.005	0.965	-0.018	0.891
Natural killer cell	KIR2DL1	-0.074	0.014	-0.093	0.000	0.188	0.026	0.032	0.717	0.004	0.917	0.002	0.955	-0.077	0.538	-0.083	0.538
	KIR2DL3	-0.061	0.043	-0.059	0.065	0.336	0.000	0.191	0.030	-0.027	0.496	0.008	0.86	-0.066	0.595	-0.084	0.532
	KIR2DL4	-0.138	0.000	-0.144	0.000	0.297	0.000	0.121	0.173	-0.049	0.222	-0.037	0.386	-0.06	0.628	-0.073	0.584
	KIR3DL1	-0.068	0.024	-0.078	0.013	0.335	0.000	0.19	0.032	-0.006	0.876	0.002	0.962	-0.004	0.973	-0.034	0.799
	KIR3DL2	-0.087	0.004	-0.096	0.002	0.31	0.000	0.145	0.102	-0.031	0.446	0.001	0.978	-0.129	0.297	-0.206	0.121
	KIR3DL3	-0.063	0.038	-0.072	0.022	0.134	0.115	0.027	0.766	-0.013	0.741	0.009	0.83	-0.161	0.194	-0.166	0.212
	KIR2DS4	-0.079	0.008	-0.093	0.003	0.184	0.029	-0.003	0.977	-0.01	0.806	-0.007	0.878	-0.236	0.055	-0.263	0.044
Dendritic cell	HLA-DPB1	0.016	0.602	-0.003	0.936	0.44	0.000	0.232	0.008	0.025	0.533	0.027	0.528	-0.063	0.613	-0.1	0.455
	HLA-DQB1	0.016	0.602	-0.071	0.026	0.387	0.000	0.211	0.017	-0.019	0.634	-0.013	0.753	-0.088	0.476	-0.102	0.448
	HLA-DRA	0.047	0.118	0.041	0.197	0.498	0.000	0.326	0.000	0.039	0.33	0.052	0.228	-0.044	0.722	-0.071	0.596
	HLA-DPA1	0.108	0.000	0.114	0.000	0.502	0.000	0.343	0.000	0.08	0.048	0.097	0.024	-0.093	0.454	-0.133	0.319
	BDCA-1(CD1C)	0.125	0.000	0.141	0.000	0.347	0.000	0.169	0.056	0.125	0.002	0.146	0.000	0.07	0.572	0.085	0.524
	BDCA-4(NRP1)	0.216	0.000	0.213	0.000	0.597	0.000	0.524	0.000	0.066	0.103	0.055	0.203	-0.019	0.878	0.004	0.979
	CD11c(ITGAX)	-0.005	0.863	-0.011	0.722	0.515	0.000	0.338	0.000	-0.044	0.277	-0.04	0.352	0.055	0.656	0.099	0.461
Helper T cell 1 (TH1)	T -bet (TBX21)	-0.069	0.022	-0.095	0.003	0.441	0.000	0.247	0.005	-0.002	0.958	0.017	0.691	0.076	0.539	-0.117	0.382
	STAT4	0.032	0.293	0.018	0.573	0.548	0.000	0.388	0.000	0.038	0.351	0.041	0.334	-0.191	0.122	-0.223	0.092
	STAT1	0.068	0.024	0.061	0.054	0.501	0.000	0.388	0.000	0.03	0.451	0.036	0.398	0.077	0.537	0.007	0.96
	IFNG	-0.14	0.000	-0.162	0.000	0.359	0.000	0.186	0.036	-0.032	0.423	-0.016	0.705	-0/019	0.88	-0.034	0.798
	TNF	-0.116	0.000	-0.097	0.002	0.278	0.000	0.167	0.060	0.012	0.773	0.047	0.275	0.019	0.876	0.058	0.663
Regulatory cell (Treg)	FOXP3	-0.128	0.000	-0.136	0.000	0.394	0.000	0.175	0.048	-0.11	0.006	-0.101	0.019	-0.12	0.331	-0.176	0.187
	CCR8	0.021	0.489	0.022	0.489	0.524	0.000	0.364	0.000	-0.011	0.776	0.002	0.959	0.277	0.024	0.279	0.034
	TGFB1 (TGFβ)	0.119	0.000	0.117	0.000	0.513	0.000	0.348	0.000	-0.075	0.061	-0.088	0.041	0.153	0.214	0.161	0.228
T cell exhaustion	PD-1 (PDCD1)	-0.142	0.000	-0.171	0.000	0.319	0.000	0.087	0.326	-0.054	0.179	-0.04	0.35	-0.098	0.43	-0.093	0.486
	CTLA4	-0.179	0.000	-0.199	0.000	0.428	0.000	0.208	0.019	-0.069	0.086	-0.046	0.282	-0.028	0.819	-0.06	0.654
	LAG3	-0.241	0.000	-0.248	0.000	0.341	0.000	0.148	0.095	-0.096	0.017	-0.068	0.114	-0.032	0.799	-0.07	0.602
	TIM-3 (HAVCR2)	0.047	0.12	0.035	0.264	0.575	0.000	0.426	0.000	-0.015	0.716	-0.015	0.724	0.128	0.302	0.131	0.329
	GZMB	-0.243	0.000	-0.279	0.000	0.349	0.000	0.144	0.105	-0.09	0.026	-0.085	0.048	-0.093	0.452	-0.111	0.407

Back to article page

ISSN: 1471-2407

Contact us

Submission enquiries: bmccancer@biomedcentral.com
General enquiries: ORSupport@springernature.com

BMC Cancer

Contact us