Table 2 Candidate genes to discriminate between LUAD and LUSC in terms of gene expression levels, functions or prognosis
GENE | DEA | Mfuzz cluster | CEMiTool Module | DISEASES | OG | TSG |
|---|---|---|---|---|---|---|
MUC5B | Up (LUAD) Down (LUSC) | Cl6(LUAD) Cl2(LUSC) | M1(LUAD) | None | None | None |
HABP2 | Up (LUAD) Down (LUSC) | Cl3(LUAD) Cl4(LUSC) | M1(LUAD) | 3.8 | None | None |
MUC21 | Up (LUAD) Down (LUSC) | Cl2(LUSC) | M1(LUAD) | 4.0 | None | None |
KCNK5 | Up (LUAD) Down (LUSC) | Cl3(LUAD) Cl2(LUSC) | M1(LUAD) | None | None | None |
ICA1 | Up (LUAD) Down (LUSC)a | Cl6(LUAD) Cl2(LUSC) | M1(LUSC) | 1.9 | None | None |
CSTA | Down (LUAD) Up (LUSC) | Cl4(LUAD) Cl1(LUSC) | M1(LUSC) | 3.5 | None | TSGDB (CST5, CST6) |
P2RY1 | Down (LUAD) Up (LUSC) | Cl4(LUAD) Cl1(LUSC) | M1(LUSC) | 2.2 | Moonlight (LUSC, P2RY14) COSMIC(P2RY8) | None |
ANXA8 | Down (LUAD) Up (LUSC) | Cl5(LUSC) | M1(LUSC) | 2.4 | None | TSGDB (ANXA1, ANXA7) |
FZD7 | Up (LUSC) | Cl4(LUAD) Cl1(LUSC) | M2(LUSC) | 3.7 | ONGENE (FZD2) Moonlight (LUSC, FZD4) | None |
ITGA6 | Up (LUSC)c | Cl4(LUAD) Cl1(LUSC) | M1(LUAD) | 4.2 | ONGENE (ITGA3) Moonlight (LUSC, ITGA8) | TSGDB (ITGA5,ITGA7, ITGAV) |
CHST7 | Up (LUSC)b | Cl4(LUAD) Cl1(LUSC) | M2(LUSC) | 1.6 | None | TSGDB (CHST10) |
ACOX2 | Down (LUSC) | Cl2(LUSC) | M1(LUAD) | 2.2 | None | None |
ALDOC | Up (LUSC) | Cl1(LUSC) | M1(LUAD) | 3.9 | None | None |
AQP5 | Down (LUSC) | Cl4(LUSC) | M1(LUAD) | None | None | None |
ARSE | Up (LUAD)a Down (LUSC) | Cl2(LUSC) | M1(LUAD) | None | None | None |
FABP5 | Down (LUAD) Up (LUSC) | Cl4(LUAD) Cl5(LUSC) | M1(LUSC) | None | MoonlightL (LUAD,FABP7) | TSGDB (FABP3) |
SLC2A9 | Down (LUAD)a | Cl4(DOWN) Cl5(LUSC) | M1(LUSC) | None | None | None |
NRCAM | Down (LUAD)a Up (LUSC) | Cl1(LUSC) | M2(LUSC) | 2.6 | Moonlight (LUSC, OCG) | TSGDB |
AGR2 | Up (LUAD) Down (LUSC)b | Cl3(LUAD) | M1(LUAD) | 4.1 | None | None |
SPDEF | Up (LUAD) Down (LUSC)b | Cl1(LUAD) Cl2(LUSC) | M1(LUAD) | 3.6 | None | None |