Table 2 Candidate genes to discriminate between LUAD and LUSC in terms of gene expression levels, functions or prognosis
| GENE | DEA | Mfuzz cluster | CEMiTool Module | DISEASES | OG | TSG |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MUC5B |
Up (LUAD) Down (LUSC) |
Cl6(LUAD) Cl2(LUSC) | M1(LUAD) | None | None | None |
| HABP2 |
Up (LUAD) Down (LUSC) |
Cl3(LUAD) Cl4(LUSC) | M1(LUAD) | 3.8 | None | None |
| MUC21 |
Up (LUAD) Down (LUSC) | Cl2(LUSC) | M1(LUAD) | 4.0 | None | None |
| KCNK5 |
Up (LUAD) Down (LUSC) |
Cl3(LUAD) Cl2(LUSC) | M1(LUAD) | None | None | None |
| ICA1 |
Up (LUAD) Down (LUSC)a |
Cl6(LUAD) Cl2(LUSC) | M1(LUSC) | 1.9 | None | None |
| CSTA |
Down (LUAD) Up (LUSC) |
Cl4(LUAD) Cl1(LUSC) | M1(LUSC) | 3.5 | None | TSGDB (CST5, CST6) |
| P2RY1 |
Down (LUAD) Up (LUSC) |
Cl4(LUAD) Cl1(LUSC) | M1(LUSC) | 2.2 |
Moonlight (LUSC, P2RY14) COSMIC(P2RY8) | None |
| ANXA8 |
Down (LUAD) Up (LUSC) | Cl5(LUSC) | M1(LUSC) | 2.4 | None | TSGDB (ANXA1, ANXA7) |
| FZD7 | Up (LUSC) |
Cl4(LUAD) Cl1(LUSC) | M2(LUSC) | 3.7 |
ONGENE (FZD2) Moonlight (LUSC, FZD4) | None |
| ITGA6 | Up (LUSC)c |
Cl4(LUAD) Cl1(LUSC) | M1(LUAD) | 4.2 |
ONGENE (ITGA3) Moonlight (LUSC, ITGA8) | TSGDB (ITGA5,ITGA7, ITGAV) |
| CHST7 | Up (LUSC)b |
Cl4(LUAD) Cl1(LUSC) | M2(LUSC) | 1.6 | None | TSGDB (CHST10) |
| ACOX2 | Down (LUSC) | Cl2(LUSC) | M1(LUAD) | 2.2 | None | None |
| ALDOC | Up (LUSC) | Cl1(LUSC) | M1(LUAD) | 3.9 | None | None |
| AQP5 | Down (LUSC) | Cl4(LUSC) | M1(LUAD) | None | None | None |
| ARSE |
Up (LUAD)a Down (LUSC) | Cl2(LUSC) | M1(LUAD) | None | None | None |
| FABP5 |
Down (LUAD) Up (LUSC) |
Cl4(LUAD) Cl5(LUSC) | M1(LUSC) | None | MoonlightL (LUAD,FABP7) | TSGDB (FABP3) |
| SLC2A9 | Down (LUAD)a |
Cl4(DOWN) Cl5(LUSC) | M1(LUSC) | None | None | None |
| NRCAM |
Down (LUAD)a Up (LUSC) | Cl1(LUSC) | M2(LUSC) | 2.6 | Moonlight (LUSC, OCG) | TSGDB |
| AGR2 |
Up (LUAD) Down (LUSC)b | Cl3(LUAD) | M1(LUAD) | 4.1 | None | None |
| SPDEF |
Up (LUAD) Down (LUSC)b |
Cl1(LUAD) Cl2(LUSC) | M1(LUAD) | 3.6 | None | None |