Table 2 Frequency and percentage of laboratories using CE-IVD kits and sequencing-based methods by RAS codon
Exon | KRAS exon 2 | KRAS exon 3 | KRAS exon 4 | NRAS exon 2 | NRAS exon 3 | NRAS exon 4 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Codon | 12 | 13 | 59 | 61 | 117 | 146 | 12 | 13 | 59 | 61 | 117 | 146 |
Total laboratories testing, n (%) | 96 (100) | 96 (100) | 78 (81) | 92 (96) | 86 (90) | 87 (91) | 90 (94) | 90 (94) | 79 (82) | 90 (94) | 73 (76) | 80 (83) |
CE-IVD kit (commercial kit), n (%) | 45 (47) | 46 (48) | 26 (27) | 40 (42) | 31 (32) | 31 (32) | 35 (37) | 35 (37) | 27 (28) | 35 (37) | 26 (27) | 32 (33) |
Cobas KRAS mutation test (Roche) | 11 (12) | 11 (12) | 3 (3) | 11 (12) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) |
Therascreen KRAS/NRAS pyro kit (Qiagen) | 9 (9) | 10 (10) | 10 (10) | 11 (12) | 9 (9) | 9 (9) | 13 (14) | 13 (14) | 9 (9) | 13 (14) | 8 (8) | 9 (9) |
KRAS/NRAS mutation detection kit (EntroGen) | 10 (10) | 9 (9) | 3 (3) | 10 (10) | 9 (9) | 9 (9) | 10 (10) | 10 (10) | 4 (4) | 10 (10) | 5 (5) | 10 (10) |
Therascreen KRAS RGQ PCR kit (Qiagen) | 5 (5) | 6 (6) | 0 (0) | 1 (1) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
KRAS/NRAS StripAssay (ViennaLab) | 2 (2) | 2 (2) | 0 (0) | 1 (1) | 0 (0) | 0 (0) | 2 (2) | 2 (2) | 0 (0) | 2 (2) | 0 (0) | 0 (0) |
Anti-EGFR MoAb response KRAS/NRAS (Diatech) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) |
Therascreen KRAS PCR kit (Qiagen) | 1 (1) | 1 (1) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
KRAS/NRAS LightMix (TIB Molbiol) | 1 (1) | 1 (1) | 0 (0) | 0 (0) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) | 3 (3) |
RAS extension pyro kit (Qiagen) | 2 (2) | 2 (2) | 6 (6) | 2 (2) | 5 (5) | 5 (5) | 2 (2) | 2 (2) | 6 (6) | 2 (2) | 5 (5) | 5 (5) |
KRAS/NRAS gene mutation detection kit (Diatech) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) |
PCR+sequencing or sequencing, n (%) | 29 (30) | 29 (30) | 35 (37) | 33 (34) | 38 (40) | 39 (41) | 37 (39) | 37 (39) | 35 (37) | 38 (40) | 33 (34) | 34 (35) |
Dideoxy (Sanger) sequencing | 14 (15) | 14 (15) | 20 (21) | 18 (19) | 24 (25) | 25 (26) | 22 (23) | 22 (23) | 21 (22) | 22 (23) | 25 (26) | 25 (26) |
Pyrosequencing (Qiagen) | 5 (5) | 5 (5) | 5 (5) | 5 (5) | 4 (4) | 4 (4) | 5 (5) | 5 (5) | 4 (4) | 6 (6) | 1 (1) | 2 (2) |
Ion AmpliSeq - Ion Torrent (Life Technologies) | 9 (9) | 9 (9) | 9 (9) | 9 (9) | 9 (9) | 9 (9) | 9 (9) | 9 (9) | 9 (9) | 9 (9) | 7 (7) | 7 (7) |
The TruSeq Amplicon - Cancer Panel (Illumina) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 1 (1) | 0 (0) | 0 (0) |
Other methods, n (%) | 16 (17) | 15 (16) | 10 (10) | 10 (10) | 10 (10) | 9 (9) | 12 (13) | 12 (13) | 11 (11) | 11 (11) | 8 (8) | 8 (8) |
Multiple methods, n (%) | 6 (6) | 6 (6) | 7 (7) | 9 (9) | 7 (7) | 8 (8) | 6 (6) | 6 (6) | 6 (6) | 6 (6) | 6 (6) | 6 (6) |