From: NF-kappa B genes have a major role in Inflammatory Breast Cancer
GENES | non IBC (n = 22) | IBC (n = 35) | pb | Metastases (n = 24) | pc |
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Upregulated genes in IBC | |||||
CXCL12 | 1,0 (0,3–8,1)a | 6,2 (0,3–1) | 0,0000048 | 1,5 (0,1–20,1) | 0,2 (NS) |
PTGS2/COX2 | 1,0 (0,2–28,7) | 8,1 (0,2–62,6) | 0,000013 | 8,9 (0,1–397,2) | 0,000018 |
CCND2 | 1,0 (0,2–4,8) | 2,8 (0,5–15,3) | 0,000025 | 0,7 (0,1–15,3) | 0,14 (NS) |
MCL1L | 1,0 (0,5–7,8) | 2 (0,6–5,8) | 0,000035 | 1,1 (0,2–4,7) | 0,74 (NS) |
TNFAIP3/A20 | 1,0 (0,4–2,7) | 2,6 (0,3–12,8) | 0,000042 | 0,9 (0,2–9,1) | 0,83 (NS) |
GADD45B | 1,0 (0,1–12,4) | 2,9 (0,1–7,3) | 0,000059 | 1,1 (0,2–7,5) | 0,19 (NS) |
FASLG | 1,0 (0,1–2,5) | 1,8 (0,3–5,6) | 0,00011 | 0,7 (0,1–7,2) | 0,28 (NS) |
CXCL1/GRO1 | 1,0 (0,1–108,7) | 5,8 (0,2–73,4) | 0,00016 | 5,3 (0,1–149,2) | 0,0026 |
MCL1S | 1,0 (0,3–3,1) | 2,5 (0,5–9,2) | 0,00018 | 1,4 (0,3–7,0) | 0,12 (NS) |
NFKB1 | 1,0 (0,4–11,1) | 2,1 (0,2–8,0) | 0,00025 | 0,8 (0,2–2,9) | 0,92 (NS) |
CCND3 | 1,0 (0,5–3,5) | 1,5 (0,7–24,4) | 0,00038 | 0,8 (0,3–3,3) | 0,22 (NS) |
SELE | 1,0 (0,1–3,5) | 3,4 (0,2–212,0) | 0,00053 | 0,7 (0,0–21,7) | 0,15 (NS) |
TNC | 1,0 (0,1–30,3) | 2,9 (0,3–33,4) | 0,00051 | 0,8 (0,1–16,2) | 0,29 (NS) |
VCAM1 | 1,0 (0,4–4,0) | 2,1 (0,9–16,3) | 0,00051 | 1,1 (0,1–7,0) | 0,92 (NS) |
CD40 | 1,0 (0,3–4,0) | 2,7 (0,2–48,0) | 0,00076 | 0,7 (0,1–9,6) | 0,07 (NS) |
CSF1R | 1,0 (0,2–3,8) | 2,1 (0,3–25,4) | 0,0012 | 0,6 (0,1–3,1) | 0,028 |
CD48 | 1,0 (0,06–8,39) | 3,07 (0,05–46,98) | 0,0017 | 0,54 (0,02–6,41) | 0,036 |
TNFSF11/RANKL | 1,0 (0,10–6,0) | 4,2 (0,3–358,3) | 0,0019 | 0,9 (0,1–19,1) | 0,86 (NS) |
IER3L | 1,0 (0,1–4,8) | 2,7 (0,2–19,2) | 0,0022 | 1,1 (0,1–27,6) | 0,80 (NS) |
TNFRSF11A/RANK | 1,0 (0,2–3,4) | 1,7 (0,1–30,1) | 0,003 | 1,2 (0,1–14,2) | 0,66 (NS) |
RELA | 1,0 (0,3–4,5) | 1,3 (0,6–4,5) | 0,0031 | 0,9 (0,3–2,3) | 0,65 (NS) |
CCL2/MCP-1 | 1,0 (0,2–3,6) | 2,1 (0,5–8,0) | 0,0039 | 1,4 (0,1–10,5) | 0,21 (NS) |
IKBKG | 1,0 (0,4–10,2) | 1,4 (0,6–5,2) | 0,0057 | 0,7 (0,2–3,7) | 0,039 |
TNFRSF10B/TRAILR2 | 1,0 (0,2–2,8) | 1,4 (0,3–5,2) | 0,0067 | 1,1 (0,1–12,3) | 0,76 (NS) |
NFKBIB | 1,0 (0,5–6,7) | 1,6 (0,4–7,0) | 0,0074 | 0,8 (0,3–5,3) | 0,58 (NS) |
ICAM1 | 1,0 (0,2–4,3) | 1,9 (0,2–19,0) | 0,0083 | 0,9 (0,1–28,1) | 0,38 (NS) |
CD40LG | 1,0 (0,1–5,0) | 2,6 (0,1–30,3) | 0,0096 | 0,7 (0,1–3,1) | 0,03 |
CSF1 | 1,0 (0,1–3,9) | 1,8 (0,3–11,7) | 0,0096 | 0,6 (0,1–2,9) | 0,044 |
PLAU/UPA | 1,0 (0,2–16,2) | 2,0 (0,4–17,6) | 0,011 | 0,7 (0,1–18,7) | 0,21 (NS) |
NFKB2 | 1,0 (0,3–3,2) | 1,4 (0,4–10,8) | 0,018 | 0,6 (0,2–4,7) | 0,07(NS) |
IL15 | 1,0 (0,00–7,08) | 1,72 (0,12–9,67) | 0,021 | 1,40 (0,06–8,48) | 0,20 (NS) |
GBP1 | 1,0 (0,17–3,71) | 1,35 (0,34–7,06) | 0,032 | 0,78 (0,13–9,64) | 0,99 (NS) |
REL | 1,0 (0,3–3,3) | 1,4 (0,2–6,6) | 0,039 | 0,5 (0,2–1,5) | 0,002 |
SOD2 | 1,0 (0,43–3,89) | 1,34 (0,26–7,96) | 0,042 | 1,16 (0,40–4,01) | 0,38 (NS) |
CHUK | 1,0 (0,4–2,4) | 1,1 (0,5–4,6) | 0,048 | 0,7 (0,2–2,1) | 0,25 (NS) |
Downregulated gene in IBC | |||||
BIRC4/XIAP | 1,0 (0,2–4,0) | 0,6 (0,1–1,7) | 0,026 | 0,9 (0,2–15,0) | 0,56 (NS) |
MKI67 | 1,0 (0,4–2,8) | 1,1 (0,2–9,4) | 0,37 (NS) | 1,1 (0,1–1327,8) | 0,46 (NS) |
ESR1/ERa | 1,0 (0,0–23,2) | 0,2 (0,0–7,9) | 0,070 (NS) | 0,1 (0,0–163,5) | 0,13 (NS) |