From: AIB1 gene amplification and the instability of polyQ encoding sequence in breast cancer cell lines
Cell linea | amplification | Sequence patterns | Pattern | (Q)n | Frequency |
---|---|---|---|---|---|
MCF-7 | 22.3 | (CAG) 3 CAA(CAG) 9 (CAACAG) 3 (CAACAGCAG) 2 CAA | 1 | 26 | 7/7 |
MCF-7 P19 | 18.7 | (CAG) 3 CAA(CAG) 9 (CAACAG) 3 (CAACAGCAG) 2 CAA | 1 | 26 | 7/9 |
 |  | (CAG)6CAA(CAG)9(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 2 | 29 | 1/9 |
 |  | (CAG)5CAA(CAG)9(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 3 | 28 | 1/9 |
MCF-7 P72 | 22.8 | (CAG) 3 CAA(CAG) 9 (CAACAG) 3 (CAACAGCAG) 2 CAA | 1 | 26 | 5/7 |
 |  | (CAG)3CAA(CAG)8(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 4 | 25 | 1/7 |
 |  | (CAG)3CAA(CAG)7(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 5 | 24 | 1/7 |
LCC1 | 13.5 | (CAG) 3 CAA(CAG) 9 (CAACAG) 3 (CAACAGCAG) 2 CAA | 1 | 26 | 7/9 |
 |  | (CAG)3CAA(CAG)8(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 4 | 25 | 1/9 |
 |  | (CAG)3CAA(CAG)14(CAACAG)2(CAACAGCAG)2CAA | 6 | 29 | 1/9 |
LCC2 | 14.6 | (CAG) 3 CAA(CAG) 9 (CAACAG) 3 (CAACAGCAG) 2 CAA | 1 | 26 | 4/5 |
 |  | CAG(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 7 | 14 | 1/5 |
LCC9 | 15.6 | (CAG) 3 CAA(CAG) 9 (CAACAG) 3 (CAACAGCAG) 2 CAA | 1 | 26 | 7/8 |
 |  | (CAG)3CAA(CAG)2CAA(CAG)9(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 8 | 29 | 1/8 |
LY-2 | 19.9 | (CAG) 3 CAA(CAG) 9 (CAACAG) 3 (CAACAGCAG) 2 CAA | 1 | 26 | 9/10 |
 |  | (CAG)6CAA(CAG)8(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 9 | 28 | 1/10 |
R27 | 19.4 | (CAG) 3 CAA(CAG) 9 (CAACAG) 3 (CAACAGCAG) 2 CAA | 1 | 26 | 8/9 |
 |  | (CAG)3CAA(CAG)8(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 4 | 25 | 1/9 |
MDA-MB435 | 1.3 | (CAG)3CAA(CAG)2CAA(CAG)11(CAACAG)2(CAACAGCAG)2CAA | 10 | 29 | 2/8 |
 |  | (CAG)6CAA(CAG)8(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 9 | 28 | 3/8 |
 |  | (CAG)3CAA(CAG)9(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 1 | 26 | 2/8 |
 |  | (CAG)6CAA(CAG)8(CAACAG)2(CAACAGCAG)2CAA | 11 | 26 | 1/8 |
LCC6 | 2.0 | (CAG)3CAA(CAG)2CAA(CAG)10(CAACAG)2(CAACAGCAG)2CAA | 12 | 28 | 1/9 |
 |  | (CAG)3CAA(CAG)2CAA(CAG)6(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 13 | 26 | 1/9 |
 |  | (CAG)6CAA(CAG)8(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 9 | 28 | 3/9 |
 |  | (CAG)3CAA(CAG)2CAA(CAG)10(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 14 | 30 | 1/9 |
 |  | (CAG)6CAA(CAG)8(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 15 | 28 | 1/9 |
 |  | (CAG)3CAA(CAG)2CAA(CAG)11(CAACAG)2(CAACAGCAG)2CAA | 10 | 29 | 1/9 |
 |  | (CAG)3CAA(CAG)2CAACAGCAA(CAG)8(CAACAG)2(CAACAGCAG)2CAA | 16 | 28 | 1/9 |
ZR-75-1 | 1.5 | (CAG)6CAA(CAG)9(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 2 | 29 | 6/7 |
 |  | (CAG)5CAA(CAG)9(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 3 | 28 | 1/7 |
AK-47 | 1.4 | (CAG)6CAA(CAG)9(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 2 | 29 | 2/8 |
 |  | (CAG)6CAA(CAG)8(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 11 | 28 | 5/8 |
 |  | (CAG)5CAA(CAG)8(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 15 | 27 | 1/8 |
A1N4 | 2.0 | (CAG)6CAA(CAG)9(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 2 | 29 | 20/41 |
 |  | (CAG)4CAA(CAG)9(CAACAG)3(CAACAGCAG)2CAA | 17 | 27 | 21/41 |