Skip to main content

Table 1 Aberrations of Chr17 as revealed by G-Banding, M-FISH and FISH in nine breast cancer cell lines and a primary culture raised from a triple negative breast carcinoma

From: Unraveling the chromosome 17 patterns of FISH in interphase nuclei: an in-depth analysis of the HER2amplicon and chromosome 17 centromere by karyotyping, FISH and M-FISH in breast cancer cells

Cell lines

Type of rearrangement

MCF7 (ER+/HER2-)

der(6)t(6;17;16)(q25;q21;?)[100],der(17)t(8;17)t(1;8)[100],der(17)t(17;19)(p11.1;p12)[65]

T47D (ER+/HER2-)

dic(9;17)t(9;17)(p12;p13)[100]

ZR-75-1 (ER+/HER2-)

der(11)t(11;17)(p15;q?21)[100],der(11)t(11;17)(p15;q?21)t(11;17)(?;q25)[88],der(17)t(6;17)(p12;p11.2)[100]

BT474 (ER+/HER2+)

der(X)t(X;17)(q13;q11q12)del(X)(p21)hsr(17)(q11q12)x2[39],der(11)t(8;17)(q21.1;q11q12)t(11;17)(p15;q11q12)x2[100],der(11)t(11;17)(q?14;q?11.2)hsr(17)(q11q12)[39],der(11)t(11;17)(q?14;?)t(8;17)(?;q?11.2)hsr(17)(q11q12)x2[57],der(13)t(13;17)(q10;q11q12)t(13;17)(q10;q11q12)hsr(17)(q11q12)x2[87],der(17)t(6;17)(?;p13)t(15;17)(q11.2;q25)hsr(17)(q11q12)x2[96]

MDA-MB361 (ER+/HER2+)

der(8)t(8;17)(p21;q11q12)t(5;17)(?;q11q12)hsr(17)(q11q12)[100],der(8)t(8;17)(p21;q25)t(8;17)(q13;q11.2)[100],der(17)t(6;17)(?;q21)[100],der(17)t(7;17)(?;p13)[100], der(17)t(17;20)(p11.1;?)t(9;20)(?;q13.1)t(5;9)(q14;?)[100], der(17)t(17;21)(q21;q22)[100]

SKBR3 (ER-/HER2+)

der(X)t(X;17)(q21;q?21)hsr(17)(q11q12)x2[79], der(17)t(8;17)(q12;?)dup(17)(?)hsr(17)(q11q12)hsr(17)(q21)[100],der(17)t(8;17)(?;q25)dup(17)(q22q25)[37],der(17)t(8;13;14;17;21)(?;q?;q?;q11q12;?)hsr(17)(q11q21) [42],der(17)t(3;8;13;17;17;20)(?;?;q12;q12;?p;?)[74], der(17;17)t(17;17)(q25;?)dup(17)(q22q25)t(17;20)(?;?)[100]

JIMT-1 (ER-/HER2+)

der(3)t(3;12)(p21;?)t(2;3)(?;q12)t(2;17)(?;q11q12)hsr(17)(q11q12)[100], ,der(8)t(8;17)(q13;q11q12)t(8;17)(q11.1;q12)hsr(17)(q11q12)[100],der(17)t(8;17)(?;p13)[67],der(17)t(17;22)(p13;?)t(17;22)(q11.1;?)[100],der(18)t(17;18)(q12;q21)t(16;17)(q23;q12)[100]

KPL4 (ER-/HER2+)

der(1)t(1;17)(p36.3;q11q12)hsr(17)(q11q12)[100],der(6)t(6;17)(p12;q11.2)t(8;17)(q25;?)[93],der(9;13)t(9;17)(p24;q11q12)t(13;17)(p11.2;q11.2)hsr(17)(q11q12)[100], der(17)t(3;17)(q13;q11)t(6;17)(?;q11)[66.6]

MDA-MB231 (ER-/HER2-)

//

TNBC CASE (ER-/HER2-)

der(17)t(8;17)(q21;p12)[100],der(17)t(16;17)(q11.2;q11.1)[15],der(17)del(17)(p11.2)del(17)(q11.2)[69],der(17)t(17;19)(p11.1;?)[15],der(17)t(17;22)(p11.1;q11.2)[62]

  1. The % of cells for which each abnormality was observed is indicated at the end of each abnormality within square brackets. The number of cells examined for chromosome count was 26 for MCF7 cells; 24 for T47D cells; 10 for ZR-75-1 cells and for BT474 cells; 10 for MDA-MB361 cells; 19 for SKBR3 cell; 18 for JIMT-1 cells; 15 for KPL4 cells, 14 for MDA-MB231 cells and 13 for the triple negative breast cancer case (TNBC).
Back to article page

BMC Cancer

ISSN: 1471-2407

Contact us