A phase I study of hydralazine to demethylate and reactivate the expression of tumor suppressor genes

BMC Cancer

Table 1 Primers and conditions used for MSP.

Primer set	Sense 5'-- 3'	Antisense 5'--- 3'	Size	Annealing
p16 M	TTATTAGAGGGTGGGGCGGATCGC	GACCCCGAACCGCGACCGTAA	150	62°C
p16 U	TTATTAGAGGGTGGGGTGGATTGT	CAACCCCAAACCACAACCATAA	151	62°C
RARβM	TCGAGAACGCGAGCGATTCG	GACCAATCCAACCGAAACGA	146	55.5°C
RARβU	TTGAGAATGTGAGTGATTTGA	AACCAATCCAACCAAAACAA	146	55.5°C
MGMT M	TTTCGACGTTCGTAGGTTTTCGC	AACCAATCCAACCAAAACAA	81	55.7°C
MGMT U	TTTGTGTTTTGATGTTTGTAGGTTT	AACTCCACACTCTTCCAAAAAC	93	55.7°C
FHIT M	TTGGGGCGCGGGTTTGGGTTTTTA	CGTAAACGACGCCGACCCCACTA	74	55.5°C
FHIT U	TTGGGGTGTGGGTTTGGGTTTTTA	CATAAACAACACCAACCCCACTA	74	55.5°C
DAPK M	GGATAGTCGGATCGAGTTAACGT	CCCTCCCAAACGCCGA	98	55.7°C
DAPK U	GGAGGATAGTTGGATTGAGTTAAT	CAAATCCCTCCCAAACACCAA	106	55.7°C
APC M	TATTGCGGAGTGCGGGTC	TCGACGAACTCCCGACGA	100	56°C
APC U	GTGTTTTATTGTGGAGTGTGGGTT	CCAATCAACAAACTCCCAACAA	110	56°C
GSTp1 M	TTCGGGGTGTAGCGGTGGTC	GCCCCAATACTAAATCACGACG	91	56°C
GSTp1 U	GATGTTTGGGGTGTAGTGGTTGTT	CCACCCCAATACTAAATCACAACA	97	56°C
H19 M	TTATAAAATCGAAAATTACGCGCGA	AGATGATTTTCGTGAATTTTGCG	136	55°C
H19 U	TATAATTATAAAATCAAAAATTACA	TTTTAGATGATTTTTGTGAATTTT	145	55°C
ER M	CGGTTGGAGTTTTTGAATCGTTC	CTAGCGTTAACGACGACCG	151	55°C
ER U	ATGAGTTGGAGTTTTTGAATTGTTT	ATAAACCTACACATTAACAACAACCA	158	55°C
Clone 1.2 M	ATGAGTTGGAGTTTTTGAATTGTTT	AATAATAAACGTAACGCCCGCGAAC	258	63°C
Clone 1.2 U	GGTTGTTTGGTTTTTATTGGGATGTTTTT	CCTAAATAATAAACATAACACCCACAAAC	258	63°C

ISSN: 1471-2407