Prediction of radiosensitivity and radiocurability using a novel supervised artificial neural network

Zeng, Zihang; Luo, Maoling; Li, Yangyi; Li, Jiali; Huang, Zhengrong; Zeng, Yuxin; Yuan, Yu; Wang, Mengqin; Liu, Yuying; Gong, Yan; Xie, Conghua

doi:10.1186/s12885-022-10339-3

BMC Cancer

Table 1 Comparison of predictive performance of models for SF2 in CCLE and GDSC

From: Prediction of radiosensitivity and radiocurability using a novel supervised artificial neural network

	Methods	Training (RMSE)						Testing (RMSE)
	Methods	Mean	CV1	CV2	CV3	CV4	CV5	Mean	CV1	CV2	CV3	CV4	CV5
CCLE	ANN-SCGP	0.0943	0.1083	0.0805	0.0757	0.1175	0.0893	0.1587	0.1578	0.1733	0.1750	0.1435	0.1441
	ANN	0.0479	0.0681	0.0305	0.0421	0.0501	0.0489	0.1716	0.1671	0.2004	0.1638	0.1621	0.1648
	LM	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	1.9304	0.8530	0.7878	2.6586	1.1412	4.2116
	SVM	0.0342	0.0208	0.0883	0.0208	0.0209	0.0201	0.1986	0.2155	0.2028	0.1826	0.2042	0.1882
	RF	0.0746	0.0694	0.0734	0.0785	0.0738	0.0781	0.1871	0.2087	0.2161	0.1639	0.1848	0.1619
	RSI	0.4186	0.4200	0.4231	0.4137	0.4336	0.4023	0.4167	0.4132	0.3999	0.4386	0.3559	0.4761
	PLS	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.1834	0.1831	0.2114	0.1790	0.1758	0.1676
	LASSO LM	0.1434	0.1627	0.1406	0.1372	0.1825	0.0942	0.1830	0.2068	0.2261	0.1580	0.1889	0.1355
	Elastic Net	0.1402	0.1765	0.1389	0.1082	0.1811	0.0962	0.1870	0.2116	0.2272	0.1687	0.1891	0.1385
GDSC	ANN-SCGP	0.0993	0.0935	0.1017	0.0852	0.1056	0.1104	0.1654	0.2099	0.1845	0.1183	0.1511	0.1628
	ANN	0.0433	0.0431	0.0479	0.0394	0.0524	0.0340	0.1826	0.2224	0.1928	0.1684	0.1771	0.1522
	LM	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	28.4256	41.6402	90.0651	0.9031	8.8523	0.6675
	SVM	0.0604	0.0204	0.0864	0.0869	0.0218	0.0865	0.2020	0.2633	0.2042	0.1539	0.1848	0.2040
	RF	0.0790	0.0697	0.0811	0.0830	0.0825	0.0790	0.2049	0.2697	0.2284	0.1662	0.1603	0.1998
	RSI	0.4437	0.4478	0.4535	0.4428	0.4506	0.4240	0.4412	0.4276	0.4026	0.4485	0.4158	0.5115
	PLS	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.2252	0.2457	0.2116	0.2044	0.2300	0.2345
	LASSO LM	0.2014	0.1977	0.2046	0.2191	0.1857	0.1997	0.2089	0.2578	0.2636	0.1598	0.1620	0.2012
	ElasticNet	0.1843	0.1882	0.2046	0.2237	0.1907	0.1143	0.2128	0.2580	0.2636	0.1646	0.1625	0.2154

ANN Artificial neural networks, LM Linear regression model, SVM Support vector machine, PLS Partial least squares, RF Random forest, RSI Radiosensitivity index in Torres-Roca's study, CV Cross validation, RMSE Root mean squared error

Back to article page

ISSN: 1471-2407

Contact us

Submission enquiries: bmccancer@biomedcentral.com
General enquiries: ORSupport@springernature.com