TY - JOUR AU - Dagogo-Jack, I. AU - Shaw, A. T. PY - 2018 DA - 2018// TI - Tumour heterogeneity and resistance to cancer therapies JO - Nat Rev Clin Oncol VL - 15 UR - https://doi.org/10.1038/nrclinonc.2017.166 DO - 10.1038/nrclinonc.2017.166 ID - Dagogo-Jack2018 ER - TY - JOUR AU - Haber, D. A. AU - Gray, N. S. AU - Baselga, J. PY - 2011 DA - 2011// TI - The evolving war on Cancer JO - Cell. VL - 145 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2011.03.026 DO - 10.1016/j.cell.2011.03.026 ID - Haber2011 ER - TY - JOUR AU - Turner, N. C. AU - Reis-Filho, J. S. PY - 2012 DA - 2012// TI - Genetic heterogeneity and cancer drug resistance JO - Lancet Oncol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1016/S1470-2045(11)70335-7 DO - 10.1016/S1470-2045(11)70335-7 ID - Turner2012 ER - TY - JOUR AU - Levine, A. J. AU - Jenkins, N. A. AU - Copeland, N. G. PY - 2019 DA - 2019// TI - The roles of initiating Truncal mutations in human cancers: the order of mutations and tumor cell type matters JO - Cancer Cell VL - 35 UR - https://doi.org/10.1016/j.ccell.2018.11.009 DO - 10.1016/j.ccell.2018.11.009 ID - Levine2019 ER - TY - JOUR AU - Kent, D. G. AU - Green, A. R. PY - 2017 DA - 2017// TI - Order matters: the order of somatic mutations influences cancer evolution JO - Cold Spring Harb Perspect Med VL - 7 UR - https://doi.org/10.1101/cshperspect.a027060 DO - 10.1101/cshperspect.a027060 ID - Kent2017 ER - TY - JOUR AU - Herbet, M. AU - Salomon, A. AU - Feige, J. J. AU - Thomas, M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Acquisition order of Ras and p53 gene alterations defines distinct adrenocortical tumor phenotypes JO - PLoS Genet VL - 8 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1002700 DO - 10.1371/journal.pgen.1002700 ID - Herbet2012 ER - TY - JOUR AU - Zhao, Y. AU - Pan, Y. AU - Cheng, C. AU - Zheng, D. AU - Zhang, Y. AU - Gao, Z. PY - 2020 DA - 2020// TI - EGFR-mutant lung adenocarcinoma harboring co-mutational tumor suppressor genes predicts poor prognosis JO - J Cancer Res Clin Oncol VL - 146 UR - https://doi.org/10.1007/s00432-020-03237-3 DO - 10.1007/s00432-020-03237-3 ID - Zhao2020 ER - TY - JOUR AU - Arbour, K. C. AU - Jordan, E. AU - Kim, H. R. AU - Dienstag, J. AU - Yu, H. A. AU - Sanchez-Vega, F. PY - 2018 DA - 2018// TI - Effects of co-occurring genomic alterations on outcomes in patients with KRAS-mutant non-small cell lung cancer JO - Clin Cancer Res VL - 24 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-17-1841 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-17-1841 ID - Arbour2018 ER - TY - JOUR AU - Knijnenburg, T. A. AU - Wang, L. AU - Zimmermann, M. T. AU - Chambwe, N. AU - Gao, G. F. AU - Cherniack, A. D. PY - 2018 DA - 2018// TI - Genomic and Molecular Landscape of DNA Damage Repair Deficiency across The Cancer Genome Atlas JO - Cell Rep VL - 23 UR - https://doi.org/10.1016/j.celrep.2018.03.076 DO - 10.1016/j.celrep.2018.03.076 ID - Knijnenburg2018 ER - TY - JOUR AU - Lin, P. C. AU - Yeh, Y. M. AU - Wu, P. Y. AU - Hsu, K. F. AU - Chang, J. Y. AU - Shen, M. R. PY - 2019 DA - 2019// TI - Germline susceptibility variants impact clinical outcome and therapeutic strategies for stage III colorectal cancer JO - Sci Rep VL - 9 UR - https://doi.org/10.1038/s41598-019-40571-0 DO - 10.1038/s41598-019-40571-0 ID - Lin2019 ER - TY - JOUR AU - Reilly, N. M. AU - Novara, L. AU - DiNicolantonio, F. AU - Bardelli, A. PY - 2019 DA - 2019// TI - Exploiting DNA repair defects in colorectal cancer JO - Mol Oncol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1002/1878-0261.12467 DO - 10.1002/1878-0261.12467 ID - Reilly2019 ER - TY - JOUR AU - Miller, C. A. AU - White, B. S. AU - Dees, N. D. AU - Griffith, M. AU - Welch, J. S. AU - Griffith, O. L. PY - 2014 DA - 2014// TI - SciClone: inferring clonal architecture and tracking the spatial and temporal patterns of tumor evolution JO - PLoS Comput Biol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1003665 DO - 10.1371/journal.pcbi.1003665 ID - Miller2014 ER - TY - JOUR AU - Caravagna, G. AU - Giarratano, Y. AU - Ramazzotti, D. AU - Tomlinson, I. AU - Graham, T. A. AU - Sanguinetti, G. PY - 2018 DA - 2018// TI - Detecting repeated cancer evolution from multi-region tumor sequencing data JO - Nat Methods VL - 15 UR - https://doi.org/10.1038/s41592-018-0108-x DO - 10.1038/s41592-018-0108-x ID - Caravagna2018 ER - TY - JOUR AU - Atkinson, E. J. AU - Therneau, T. M. PY - 2000 DA - 2000// TI - An introduction to recursive partitioning using the RPART routines JO - Mayo Clin Sect Biostat Tech Rep VL - 61 ID - Atkinson2000 ER - TY - JOUR AU - Hothorn, T. AU - Zeileis, A. PY - 2015 DA - 2015// TI - Partykit: a modular toolkit for recursive partytioning in R JO - J Mach Learn Res VL - 16 ID - Hothorn2015 ER - TY - JOUR AU - Lin, P. C. AU - Yeh, Y. M. AU - Lin, B. W. AU - Lin, S. C. AU - Chen, P. C. AU - Shen, M. R. PY - 2020 DA - 2020// TI - Intratumor heterogeneity of MYO18A and FBXW7 variants impact the clinical outcome of stage III colorectal cancer JO - Front Oncol VL - 10 ID - Lin2020 ER - TY - JOUR AU - Roger, E. AU - Gout, J. AU - Arnold, F. AU - Beutel, A. K. AU - Müller, M. AU - Abaei, A. AU - Barth, T. F. E. AU - Rasche, V. AU - Seufferlein, T. AU - Perkhofer, L. AU - Kleger, A. PY - 2020 DA - 2020// TI - Maintenance therapy for ATM-deficient pancreatic Cancer by multiple DNA damage response interferences after platinum-based chemotherapy JO - Cells VL - 9 UR - https://doi.org/10.3390/cells9092110 DO - 10.3390/cells9092110 ID - Roger2020 ER - TY - JOUR AU - Longley, D. B. AU - Harkin, D. P. AU - Johnston, P. G. PY - 2003 DA - 2003// TI - 5-fluorouracil: mechanisms of action and clinical strategies JO - Nat Rev Cancer VL - 3 UR - https://doi.org/10.1038/nrc1074 DO - 10.1038/nrc1074 ID - Longley2003 ER - TY - JOUR AU - Iwaizumi, M. AU - Stephanie, T. R. AU - Carethers, J. M. PY - 2011 DA - 2011// TI - DNA mismatch repair proficiency executing 5-fluorouracil cytotoxicity in colorectal cancer cells JO - Cancer Biol Ther VL - 12 UR - https://doi.org/10.4161/cbt.12.8.17169 DO - 10.4161/cbt.12.8.17169 ID - Iwaizumi2011 ER - TY - JOUR AU - Bruno, P. M. AU - Liu, Y. AU - Park, G. Y. AU - Murai, J. AU - Koch, C. E. AU - Eisen, T. J. PY - 2017 DA - 2017// TI - A subset of platinum-containing chemotherapeutic agents kills cells by inducing ribosome biogenesis stress JO - Nat Med VL - 23 UR - https://doi.org/10.1038/nm.4291 DO - 10.1038/nm.4291 ID - Bruno2017 ER - TY - JOUR AU - Ceccaldi, R. AU - Sarangi, P. AU - D’Andrea, A. D. PY - 2016 DA - 2016// TI - The Fanconi anaemia pathway: new players and new functions JO - Nat Rev Mol Cell Biol VL - 17 UR - https://doi.org/10.1038/nrm.2016.48 DO - 10.1038/nrm.2016.48 ID - Ceccaldi2016 ER - TY - JOUR AU - Sinicrope, F. A. AU - Shi, Q. AU - Smyrk, T. C. AU - Thibodeau, S. N. AU - Dienstmann, R. AU - Guinney, J. PY - 2015 DA - 2015// TI - Molecular markers identify subtypes of stage III colon cancer associated with patient outcomes JO - Gastroenterology. VL - 148 UR - https://doi.org/10.1053/j.gastro.2014.09.041 DO - 10.1053/j.gastro.2014.09.041 ID - Sinicrope2015 ER - TY - JOUR AU - Jackson, S. P. AU - Bartek, J. PY - 2009 DA - 2009// TI - The DNA-damage response in human biology and disease JO - Nature. VL - 461 UR - https://doi.org/10.1038/nature08467 DO - 10.1038/nature08467 ID - Jackson2009 ER - TY - JOUR AU - Randon, G. AU - Fucà, G. AU - Rossini, D. AU - Raimondi, A. AU - Pagani, F. AU - Perrone, F. PY - 2019 DA - 2019// TI - Prognostic impact of ATM mutations in patients with metastatic colorectal cancer JO - Sci Rep VL - 9 UR - https://doi.org/10.1038/s41598-019-39525-3 DO - 10.1038/s41598-019-39525-3 ID - Randon2019 ER - TY - JOUR AU - Arena, S. AU - Corti, G. AU - Durinikova, E. AU - Montone, M. AU - Reilly, N. M. AU - Russo, M. PY - 2020 DA - 2020// TI - A subset of colorectal cancers with cross-sensitivity to olaparib and oxaliplatin JO - Clin Cancer Res VL - 26 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-19-2409 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-19-2409 ID - Arena2020 ER - TY - JOUR AU - Ortmann, C. A. AU - Kent, D. G. AU - Nangalia, J. AU - Silber, Y. AU - Wedge, D. C. AU - Grinfeld, J. PY - 2015 DA - 2015// TI - Effect of mutation order on Myeloproliferative neoplasms JO - N Engl J Med VL - 372 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa1412098 DO - 10.1056/NEJMoa1412098 ID - Ortmann2015 ER -