Table 2 Correlation of KIT/PDGFRA genotype between tissue and plasma
cfDNA genotype (%AF) | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
Patient ID | Cohort | Tissue genotype | Primary mut. | Resistance mut. | ||
NGS | ddPCR | NGS | ddPCR | |||
1 | A | KIT W557R | 0 | 0 | N.A. | N.A. |
2 | A | KIT L576P | 0 | 0 | N.A. | N.A. |
3 | A | PDGFRA D842V | 0 | 0 | N.A. | N.A. |
4 | A | PDGFRA D842_D846 | 0 | 0 | N.A. | N.A. |
5 | A | PDGFRA V561D | 0 | 0 | N.A. | N.A. |
6 | A | KIT Y568_L576 | 0 | 0 | N.A. | N.A. |
7 | A | KIT K550_K558 | 0 | 1.5 | N.A. | N.A. |
8 | A | KIT Q556_K558 | 12.3 | 15.2 | N.A. | N.A. |
9 | A | KIT W557_K558 + N822K | 0 | 0 | 0 | 0 |
10 | A + B | KIT M552_E554 + D820Y | 0 | 0 | 0 | 0 |
11 | A + B | KIT V559del + D816V | 1.2 | 0.5 | 1 | 0 |
12 | A + B | KIT V555_V560 | 0 | 0.9 | N.A. | N.A. |
13 | A + B | KIT T557_D572 | 0 | 1.2 | N.A. | N.A. |
14 | B | KIT p.W557R | 0 | 0.3 | N.A. | N.A. |
15 | B | KIT V555_K558 | 0 | 0 | N.A. | N.A. |
16 | B | KIT V559_L576 | 1.9 | 9.5 | N.A. | N.A. |
17 | B | PDGFRA V561D | 1.3 | 0.4 | N.A. | N.A. |
18 | B | KIT Q556_E561 | 6 | 4.9 | N.A. | N.A. |