Skip to main content

Advertisement

Table 3 Significant p-values from univariate survival analysis of immune metagenes

From: Conservation of immune gene signatures in solid tumors and prognostic implications

   Immune metagenes  
Cancer type Clinical characteristics T/NK 1 T/NK 2 T/NK 3 B/P/T/NK B/P B/M/D M/D/N 1 M/D/N 2 D (LPS)
Breast (DMFS) All (n=1954) ** ** ** ** *** ***    
  P (high) (n=651) *** *** *** *** *** *** *** *** **
  HER2-E (n=281) *** *** *** *** *** ** ** * **
  Basal (n=334) *** *** *** *** *** ** **   
  LN- (n=1498) ** ** ** ** *** ***    
  ER- (n=401) *** *** *** *** *** **    
  ER+ (n=1343)    *   ** ***    *
  Luminal B (n=399)   * *   * ***   *  
  Luminal A (n=565)          *
  Normal (n=257)      *     
  40<Age≤50(n=404)    * * ** **    
  Age>50(n=986)    *   * *    
Colon (OAS) All (n=232)     **      
  Grade - MD (n=166) *    *      
  Age <60(n=79) *    *      
  P (low) (n=78)     *      
  Gender - M (n=122) * * * **      
  Gender - F (n=110)          *
  Stage II (n=72)   *    * * ** ** **
Lung (OAS) All (n=757)   * ** * **     
  Stage I (n=490)   ** ** * **     
  Sub-stage IB (n=313) * ** ** * **    *  
  Adj. Chemo - No (n=503)   * ** * *     
  Histology - S (n=183)   * *   **     
  Histology - A (n=574)    *       
  60≤Age<70(n=273)   * **    *    
  P (med) (n=253)    *   *     
  Gender - F (n=333)    *       
  Gender - M (n=424)      *     
TCGA OV (OAS) All (n=566) * * * *      
  P (med) (n=189) ** ** ** * * * *   
  P (low) (n=188)       *   *  
  Grade 3 (n=477) ** * ** *      
  Stage III (n=436) *   * *      
  60≤Age<70(n=136)     *      
TCGA GBM (OAS) All (n=524)        * * *
  Age <60(n=273)        * * **
  Gender - F (n=205) * *    * * ** **  
  P (high) (n=174)   *     ** ** ** *
TCGA SKCM (OAS) All (n=456) *** *** *** *** *** *** *** *** ***
  Stage ≤ II (n=229) *** *** *** *** *** *** *** *** ***
  Stage > II (n=191) *** *** ** ** ** *** ** *** ***
  Gender - F (n=175) *** *** *** ** *** *** *** *** ***
  Gender - M (n=281) ** ** * ** * ** ** ** **
  P (low) (n=152) ** ** ** * ** ** ** *** ***
  P (med) (n=152) * *     ** * * **
  P (high) (n=152) ** ** * ** ** ** ** ** **
  Age<50(n=136) ** ** * * * *    **
  50≤Age<70(n=190) ** ** * * ** *** *** *** **
  Age≥70(n=130) ** ** * ** * ** * * **
  Breslow dv ≤1.5(n=105) *** ** ** * * *** ** *** **
  Breslow dv >1.5(n=246) *     * *   * *
  Primary Tumor (n=102)          *
  Regional Tumor (n=288) *** *** *** *** *** *** *** *** ***
  1. p-value codes: p≤0.001 (***); 0.001<p≤0.01 (**); 0.01<p≤0.05 (*); Poor outcome ()
  2. P (low, med, high) = low, intermediate and high proliferation tertiles. Breslow dv (depth value)
  3. Grade - MD = Moderately Differentiated. Histology - S/A = Squamous Cell Carcinoma/Adenocarcinoma