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Table 1 PTEN/PI3K biomarkers in 116 unselected breast cancers

From: Integrated molecular pathway analysis informs a synergistic combination therapy targeting PTEN/PI3K and EGFR pathways for basal-like breast cancer

Variable

n

%

Total

Breast tumors

116

100.0 %

116

Median age (range)

53 years

(30–89)

 

ER+

82

70.7 %

116

ER–

34

29.3 %

 

PgR+

71

61.2 %

116

PgR–

45

38.8 %

 

Size <20

36

31.3 %

115

20–49

64

55.7 %

 

50+

15

13.0 %

 

Grade 1

8

7.0 %

115

Grade 2

32

27.8 %

 

Grade 3

75

65.2 %

 

Node+

56

53.3 %

105

Node–

49

46.7 %

 

HER2+

23

20.4 %

113

HER2–

90

79.6 %

 

Ki67 IHC+

35

38.0 %

92

Ki67 IHC–

57

62.0 %

 

S–phase ≤6 %

31

33.3 %

93

S–phase >6 %,<10 %

17

18.3 %

 

S–phase ≥10 %

45

48.4 %

 

CK5/14 IHC+

19

17.4 %

109

CK5/14 IHC–

90

82.6 %

 

p53 mut

44

38.3 %

115

p53 wt

71

61.7 %

 

EGFR IHC+

27

24.1 %

112

EGFR IHC–

85

75.9 %

 

PTEN abrogated (PTEN IHC- or mut)

26

24.3 %

107

PTEN norm

81

75.7 %

 

PTEN IHC–

25

23.4 %

107

PTEN IHC+

82

76.6 %

 

PTEN mut

4

3.6 %

112

PTEN wt

108

96.4 %

 

PIK3CA mut

29

25.0 %

116

PIK3CA wt

87

75.0 %

 

INPP4B mRNA low

20

21.3 %

94

INPP4B mRNA norm

74

78.7 %

 

Any PTEN/PI3K/INPP4B

64

64.0 %

100

None PTEN/PI3K/INPP4B

36

36.0 %

 

Any PTEN/PI3K/INPP4B/EGFR/HER2

80

75.5 %

106

None PTEN/PI3K/INPP4B/EGFR/HER2

26

24.5 %