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Table 3 Detailed results of KRAS codon 12/13 mutation testing in 120 CRC samples

From: A rational two-step approach to KRAS mutation testing in colorectal cancer using high resolution melting analysis and pyrosequencing

  

HRM

Pyrosequencing

    

Run 1

Run 2

 

Sample

cDNA [ng/μl]

Run 1

Run 2

Result

% mut. Alleles

Result

% mut. Alleles

Final result

62

541

WT a

 

WT

   

WT

63

29

WT a

 

WT

   

WT

64

378

WT

     

WT

65

342

WT a

WT

    

WT

66

176

failed

WT a

G12V

3.2

G12V

5.2

WT

67

139

mut

     

mut

68

520

WT

     

WT

69

42

WT

     

WT

70

202

WT

     

WT

71

157

mut

     

mut

72

259

mut

     

mut

73

145

WT

     

WT

74

21

failed

failed

WT

   

WT

75

22

failed

 

WT

   

WT

76

66

mut

     

mut

77

55

mut

     

mut

78

199

mut

     

mut

79

197

WT

     

WT

80

171

WT

     

WT

81

55

failed

 

G12V

41.1

  

mut

82

231

failed

 

WT

   

WT

83

250

failed

 

WT

   

WT

84

57

failed

WT a

    

WT

85

21

mut

     

mut

86

248

WT

     

WT

87

258

WT

     

WT

88

83

failed

 

failed

 

failed

 

N/A

89

38

failed

 

WT

   

WT

90

279

WT

     

WT

91

122

failed

 

WT

   

WT

92

129

failed

 

Low Mut.

5.2

Low Mut.

8.2

mut

93

58

WT

     

WT

94

129

WT

     

WT

95

254

WT

     

WT

96

373

WT

     

WT

97

158

WT

     

WT

98

96

mut

     

mut

99

22

WT

     

WT

100

30

mut

     

mut

101

26

muta

muta

G13D

7.3

  

mut

102

49

WT

     

WT

103

47

WT

     

WT

104

43

WT

     

WT

105

54

WT

     

WT

106

363

failed

mut

    

mut

107

521

failed

WT

    

WT

108

199

mut

     

mut

109

260

WT

     

WT

110

67

WT

     

WT

111

103

WT

     

WT

112

24

mut

     

mut

113

150

WT

     

WT

114

5

WT

     

WT

115

25

WT

     

WT

116

33

WT

     

WT

117

26

mut

     

mut

118

72

WT

     

WT

119

16

failed

 

G12V

12.8

  

mut

120

33

failed

 

WT

   

WT

121

48

WT

     

WT

122

74

WT

     

WT

123

474

mut

     

mut

124

431

mut

     

mut

125

66

mut

     

mut

126

143

mut

     

mut

127

49

failed

WT

    

WT

128

143

WT

     

WT

129

122

mut

     

mut

130

139

WT

     

WT

131

21

failed

 

WT

   

WT

132

39

failed

 

WT

   

WT

133

128

failed

 

G12D

26.7

  

mut

134

60

mut

     

mut

135

330

failed

mut

    

mut

136

165

mut

     

mut

137

213

mut

     

mut

138

31

failed

mut

    

mut

139

156

mut

     

mut

140

59

WT

     

WT

141

68

WT

     

WT

142

164

WT

     

WT

143

238

mut

     

mut

144

12

mut

     

mut

145

33

failed

WT

    

WT

146

81

WT

     

WT

147

11

WT

     

WT

148

13

mut

     

mut

149

71

WT

     

WT

150

11

mut

     

mut

151

40

failed

WT

    

WT

152

50

WT

     

WT

153

128

mut

     

mut

154

146

WT

     

WT

155

69

WT

     

WT

156

182

WT

     

WT

157

32

failed

WT

    

WT

158

142

WT

     

WT

159

53

WT

     

WT

160

91

failed

WT

    

WT

161

334

WT

     

WT

162

86

failed

WT

    

WT

163

61

WT

     

WT

164

64

WT

     

WT

165

141

WT

     

WT

166

271

WT

     

WT

167

40

WT

     

WT

168

34

failed

WT

    

WT

169

29

failed

failed

WT

   

WT

170

354

WT

     

WT

171

66

WT

     

WT

172

43

failed

WT

    

WT

173

114

WT

     

WT

174

268

WT

     

WT

175

107

WT

     

WT

176

170

mut

     

mut

177

65

failed

mut

    

mut

178

31

failed

mut

    

mut

179

61

WT

     

WT

180

659

mut

     

mut

181

34

WT

     

WT

  1. aSkewed HRM curve