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Table 1 KRAS codon 12/13 status by HRM and pyrosequencing in 61 CRC samples

From: A rational two-step approach to KRAS mutation testing in colorectal cancer using high resolution melting analysis and pyrosequencing

   HRM Pyrosequencing
     Run 1 Run 2  
Sample cDNA [ng/μl] Run 1 Run 2 Result % mut. Alleles Result % mut. Alleles Final result
1 11 failed WT a WT     WT
2 31 WT a   WT     WT
3 10 WT a   G12C 13.4    mut
4 93 WT a   WT     WT
5 26 WT a   WT     WT
6 27 WT a   WT     WT
7 10 WT a   WT     WT
8 43 mut   G13D 73.9    mut
9 85 failed WT WT     WT
10 N/A mut   G13D 44.3    mut
11 N/A failed   G12V 2.6    WT b
12 N/A WT   WT     WT
13 N/A mut   G12V 41.9    mut
14 126 mut   failed   G12D 65.7 mut
15 133 mut   G12D 74.1    mut
16 97 mut   G13D 52.8    mut
17 47 failed WT WT     WT
18 14 failed WT WT     WT
19 44 WT a   WT     WT
20 20 failed WT a WT     WT
21 N/A failed   WT     WT
22 138 mut   G12V 12.9    mut
23 325 mut   G12D 56.1    mut
24 140 WT a   WT     WT
25 7 mut   G12C 61.2    mut
26 4 WT a   WT     WT
27 27 WT a   WT     WT
28 13 WT a   WT     WT
29 207 mut   G12D 54.5    mut
30 10 failed WT G12V 1.5    WT b
31 54 WT a   WT     WT
32 120 mut   G12V 29.2    mut
33 33 failed mut G12C 33.5    mut
34 N/A mut   G12C 71.4    mut
35 N/A WT   WT     WT
36 N/A failed   WT     WT
37 67 WT a   WT     WT
38 137 mut   G12C 76.7    mut
39 63 mut   G12A 56    mut
40 13 WT a   WT     WT
41 113 WT a   WT     WT
42 82 mut   G12C 75.4    mut
43 39 WT   WT     WT
44 7 WT a   G12S 2    WT b
45 23 WT a   WT     WT
46 24 faileda   G13D 3.5    WT b
47 9 WT a   WT     WT
48 34 WT a   G12S 2    WT b
49 25 WT a   WT     WT
50 17 WT   WT     WT
51 5 WT a   WT     WT
52 29 WT a   WT     WT
53 31 mut   G12D 71.3    mut
54 68 WT   WT     WT
55 93 mut   G12D 74.2    mut
56 221 WT   WT     WT
57 83 WT   WT     WT
58 N/A WT a   G12V 1.2    WT b
59 35 mut   G12D 83.3    mut
60 N/A WT   WT     WT
61 37 WT a   WT     WT
  1. aSkewed HRM curve
  2. bLOD/threshold for potential low level mutation (cf. Therascreen KRAS Pyro Kit handbook version 1, July 2011): G12D 2.2 %/5.2 %, G12V 1.0 %/4.0 %, G12C 2.1 %/5.1 %, G12S 1.9 %/4.9 %, G13D 1.9 %/4.9 %