TY - CHAP PY - 2006 DA - 2006// BT - Cancer facts and figures, 2006 PB - Atlanta CY - American Cancer Society ID - ref1 ER - TY - JOUR AU - Logothetis, C. J. AU - Lin, S. H. PY - 2005 DA - 2005// TI - Osteoblasts in prostate cancer metastasis to bone JO - Nat Rev Cancer VL - 5 UR - https://doi.org/10.1038/nrc1528 DO - 10.1038/nrc1528 ID - Logothetis2005 ER - TY - JOUR AU - Stewart, D. A. AU - Cooper, C. R. AU - Sikes, R. A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Changes in extracellular matrix (ECM) and ECM-associated proteins in the metastatic progression of prostate cancer JO - Reprod Biol Endocrinol VL - 2 UR - https://doi.org/10.1186/1477-7827-2-2 DO - 10.1186/1477-7827-2-2 ID - Stewart2004 ER - TY - JOUR AU - Dhanasekaran, S. M. AU - Barrette, T. R. AU - Ghosh, D. AU - Shah, R. AU - Varambally, S. AU - Kurachi, K. AU - Pienta, K. J. AU - Rubin, M. A. AU - Chinnaiyan, A. M. PY - 2001 DA - 2001// TI - Delineation of prognostic biomarkers in prostate cancer JO - Nature VL - 412 UR - https://doi.org/10.1038/35090585 DO - 10.1038/35090585 ID - Dhanasekaran2001 ER - TY - JOUR AU - Luo, J. H. AU - Yu, Y. P. AU - Cieply, K. AU - Lin, F. AU - Deflavia, P. AU - Dhir, R. AU - Finkelstein, S. AU - Michalopoulos, G. AU - Becich, M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Gene expression analysis of prostate cancers JO - Mol Carcinog VL - 33 UR - https://doi.org/10.1002/mc.10018 DO - 10.1002/mc.10018 ID - Luo2002 ER - TY - JOUR AU - Yu, Y. P. AU - Landsittel, D. AU - Jing, L. AU - Nelson, J. AU - Ren, B. AU - Liu, L. AU - McDonald, C. AU - Thomas, R. AU - Dhir, R. AU - Finkelstein, S. AU - Michalopoulos, G. AU - Becich, M. AU - Luo, J. H. PY - 2004 DA - 2004// TI - Gene expression alterations in prostate cancer predicting tumor aggression and preceding development of malignancy JO - J Clin Oncol VL - 22 UR - https://doi.org/10.1200/JCO.2004.05.158 DO - 10.1200/JCO.2004.05.158 ID - Yu2004 ER - TY - JOUR AU - Chandran, U. R. AU - Dhir, R. AU - Ma, C. AU - Michalopoulos, G. AU - Becich, M. AU - Gilbertson, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Differences in gene expression in prostate cancer, normal appearing prostate tissue adjacent to cancer and prostate tissue from cancer free organ donors JO - BMC Cancer VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2407-5-45 DO - 10.1186/1471-2407-5-45 ID - Chandran2005 ER - TY - JOUR AU - Chetcuti, A. AU - Margan, S. AU - Mann, S. AU - Russell, P. AU - Handelsman, D. AU - Rogers, J. AU - Dong, Q. PY - 2001 DA - 2001// TI - Identification of differentially expressed genes in organ-confined prostate cancer by gene expression array JO - Prostate VL - 47 UR - https://doi.org/10.1002/pros.1056 DO - 10.1002/pros.1056 ID - Chetcuti2001 ER - TY - JOUR AU - Singh, D. AU - Febbo, P. G. AU - Ross, K. AU - Jackson, D. G. AU - Manola, J. AU - Ladd, C. AU - Tamayo, P. AU - Renshaw, A. A. AU - D'Amico, A. V. AU - Richie, J. P. AU - Lander, E. S. AU - Loda, M. AU - Kantoff, P. W. AU - Golub, T. R. AU - Sellers, W. R. PY - 2002 DA - 2002// TI - Gene expression correlates of clinical prostate cancer behavior JO - Cancer Cell VL - 1 UR - https://doi.org/10.1016/S1535-6108(02)00030-2 DO - 10.1016/S1535-6108(02)00030-2 ID - Singh2002 ER - TY - JOUR AU - LaTulippe, E. AU - Satagopan, J. AU - Smith, A. AU - Scher, H. AU - Scardino, P. AU - Reuter, V. AU - Gerald, W. L. PY - 2002 DA - 2002// TI - Comprehensive gene expression analysis of prostate cancer reveals distinct transcriptional programs associated with metastatic disease JO - Cancer Res VL - 62 ID - LaTulippe2002 ER - TY - JOUR AU - True, L. AU - Coleman, I. AU - Hawley, S. AU - Huang, C. Y. AU - Gifford, D. AU - Coleman, R. AU - Beer, T. M. AU - Gelmann, E. AU - Datta, M. AU - Mostaghel, E. AU - Knudsen, B. AU - Lange, P. AU - Vessella, R. AU - Lin, D. AU - Hood, L. AU - Nelson, P. S. PY - 2006 DA - 2006// TI - A molecular correlate to the Gleason grading system for prostate adenocarcinoma JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 103 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0603678103 DO - 10.1073/pnas.0603678103 ID - True2006 ER - TY - JOUR AU - Holzbeierlein, J. AU - Lal, P. AU - LaTulippe, E. AU - Smith, A. AU - Satagopan, J. AU - Zhang, L. AU - Ryan, C. AU - Smith, S. AU - Scher, H. AU - Scardino, P. AU - Reuter, V. AU - Gerald, W. L. PY - 2004 DA - 2004// TI - Gene expression analysis of human prostate carcinoma during hormonal therapy identifies androgen-responsive genes and mechanisms of therapy resistance JO - Am J Pathol VL - 164 UR - https://doi.org/10.1016/S0002-9440(10)63112-4 DO - 10.1016/S0002-9440(10)63112-4 ID - Holzbeierlein2004 ER - TY - JOUR AU - Bismar, T. A. AU - Demichelis, F. AU - Riva, A. AU - Kim, R. AU - Varambally, S. AU - He, L. AU - Kutok, J. AU - Aster, J. C. AU - Tang, J. AU - Kuefer, R. AU - Hofer, M. D. AU - Febbo, P. G. AU - Chinnaiyan, A. M. AU - Rubin, M. A. PY - 2006 DA - 2006// TI - Defining aggressive prostate cancer using a 12-gene model JO - Neoplasia VL - 8 UR - https://doi.org/10.1593/neo.05664 DO - 10.1593/neo.05664 ID - Bismar2006 ER - TY - JOUR AU - Stanbrough, M. AU - Bubley, G. J. AU - Ross, K. AU - Golub, T. R. AU - Rubin, M. A. AU - Penning, T. M. AU - Febbo, P. G. AU - Balk, S. P. PY - 2006 DA - 2006// TI - Increased Expression of Genes Converting Adrenal Androgens to Testosterone in Androgen-Independent Prostate Cancer JO - Cancer Res VL - 66 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-05-4000 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-05-4000 ID - Stanbrough2006 ER - TY - JOUR AU - Stuart, R. O. AU - Wachsman, W. AU - Berry, C. C. AU - Wang-Rodriguez, J. AU - Wasserman, L. AU - Klacansky, I. AU - Masys, D. AU - Arden, K. AU - Goodison, S. AU - McClelland, M. AU - Wang, Y. AU - Sawyers, A. AU - Kalcheva, I. AU - Tarin, D. AU - Mercola, D. PY - 2004 DA - 2004// TI - In silico dissection of cell-type-associated patterns of gene expression in prostate cancer JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 101 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.2536479100 DO - 10.1073/pnas.2536479100 ID - Stuart2004 ER - TY - JOUR AU - Ma, C. AU - Lyons-Weiler, M. AU - Liang, W. AU - LaFramboise, W. AU - Gilbertson, J. R. AU - Becich, M. J. AU - Monzon, F. A. PY - 2006 DA - 2006// TI - In Vitro Transcription Amplification and Labeling Methods Contribute to the Variability of Gene Expression Profiling with DNA Microarrays JO - J Mol Diagn VL - 8 UR - https://doi.org/10.2353/jmoldx.2006.050077 DO - 10.2353/jmoldx.2006.050077 ID - Ma2006 ER - TY - JOUR AU - Tusher, V. G. AU - Tibshirani, R. AU - Chu, G. PY - 2001 DA - 2001// TI - Significance analysis of microarrays applied to the ionizing radiation response JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 98 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.091062498 DO - 10.1073/pnas.091062498 ID - Tusher2001 ER - TY - STD TI - [http://david.abcc.ncifcrf.gov/] UR - http://david.abcc.ncifcrf.gov/ ID - ref18 ER - TY - JOUR AU - Eisen, M. B. AU - Spellman, P. T. AU - Brown, P. O. AU - Botstein, D. PY - 1998 DA - 1998// TI - Cluster analysis and display of genome-wide expression patterns JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 95 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.95.25.14863 DO - 10.1073/pnas.95.25.14863 ID - Eisen1998 ER - TY - JOUR AU - Livak, K. J. AU - Schmittgen, T. D. PY - 2001 DA - 2001// TI - Analysis of Relative Gene Expression Data Using Real-Time Quantitative PCR and the 2-[Delta][Delta]CT Method JO - Methods VL - 25 UR - https://doi.org/10.1006/meth.2001.1262 DO - 10.1006/meth.2001.1262 ID - Livak2001 ER - TY - JOUR AU - Shah, R. B. AU - Mehra, R. AU - Chinnaiyan, A. M. AU - Shen, R. AU - Ghosh, D. AU - Zhou, M. AU - Macvicar, G. R. AU - Varambally, S. AU - Harwood, J. AU - Bismar, T. A. AU - Kim, R. AU - Rubin, M. A. AU - Pienta, K. J. PY - 2004 DA - 2004// TI - Androgen-independent prostate cancer is a heterogeneous group of diseases: lessons from a rapid autopsy program JO - Cancer Res VL - 64 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-04-2442 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-04-2442 ID - Shah2004 ER - TY - JOUR AU - Zhou, M. AU - Chinnaiyan, A. M. AU - Kleer, C. G. AU - Lucas, P. C. AU - Rubin, M. A. PY - 2002 DA - 2002// TI - Alpha-Methylacyl-CoA racemase: a novel tumor marker over-expressed in several human cancers and their precursor lesions JO - Am J Surg Pathol VL - 26 UR - https://doi.org/10.1097/00000478-200207000-00012 DO - 10.1097/00000478-200207000-00012 ID - Zhou2002 ER - TY - JOUR AU - Weber, G. F. PY - 2001 DA - 2001// TI - The metastasis gene osteopontin: a candidate target for cancer therapy JO - Biochim Biophys Acta VL - 1552 UR - https://doi.org/10.1016/S0005-2728(01)00198-0 DO - 10.1016/S0005-2728(01)00198-0 ID - Weber2001 ER - TY - JOUR AU - Reinholz, M. M. AU - Iturria, S. J. AU - Ingle, J. N. AU - Roche, P. C. PY - 2002 DA - 2002// TI - Differential gene expression of TGF-beta family members and osteopontin in breast tumor tissue: analysis by real-time quantitative PCR JO - Breast Cancer Res Treat VL - 74 UR - https://doi.org/10.1023/A:1016339120506 DO - 10.1023/A:1016339120506 ID - Reinholz2002 ER - TY - JOUR AU - Hotte, S. J. AU - Winquist, E. W. AU - Stitt, L. AU - Wilson, S. M. AU - Chambers, A. F. PY - 2002 DA - 2002// TI - Plasma osteopontin: associations with survival and metastasis to bone in men with hormone-refractory prostate carcinoma JO - Cancer VL - 95 UR - https://doi.org/10.1002/cncr.10709 DO - 10.1002/cncr.10709 ID - Hotte2002 ER - TY - JOUR AU - Wai, P. Y. AU - Kuo, P. C. PY - 2004 DA - 2004// TI - The role of Osteopontin in tumor metastasis JO - J Surg Res VL - 121 UR - https://doi.org/10.1016/j.jss.2004.03.028 DO - 10.1016/j.jss.2004.03.028 ID - Wai2004 ER - TY - JOUR AU - Furger, K. A. AU - Menon, R. K. AU - Tuck, A. B. AU - Bramwell, V. H. AU - Chambers, A. F. PY - 2001 DA - 2001// TI - The functional and clinical roles of osteopontin in cancer and metastasis JO - Curr Mol Med VL - 1 UR - https://doi.org/10.2174/1566524013363339 DO - 10.2174/1566524013363339 ID - Furger2001 ER - TY - JOUR AU - Forootan, S. S. AU - Foster, C. S. AU - Aachi, V. R. AU - Adamson, J. AU - Smith, P. H. AU - Lin, K. AU - Ke, Y. PY - 2006 DA - 2006// TI - Prognostic significance of osteopontin expression in human prostate cancer JO - Int J Cancer VL - 118 UR - https://doi.org/10.1002/ijc.21619 DO - 10.1002/ijc.21619 ID - Forootan2006 ER - TY - JOUR AU - Kalin, T. V. AU - Wang, I. C. AU - Ackerson, T. J. AU - Major, M. L. AU - Detrisac, C. J. AU - Kalinichenko, V. V. AU - Lyubimov, A. AU - Costa, R. H. PY - 2006 DA - 2006// TI - Increased levels of the FoxM1 transcription factor accelerate development and progression of prostate carcinomas in both TRAMP and LADY transgenic mice JO - Cancer Res VL - 66 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-05-3138 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-05-3138 ID - Kalin2006 ER - TY - JOUR AU - Shimada, K. AU - Nakamura, M. AU - Ishida, E. AU - Konishi, N. PY - 2006 DA - 2006// TI - Molecular roles of MAP kinases and FADD phosphorylation in prostate cancer JO - Histol Histopathol VL - 21 ID - Shimada2006 ER - TY - JOUR AU - Hollingshead, D. AU - Lewis, D. A. AU - Mirnics, K. PY - 2005 DA - 2005// TI - Platform influence on DNA microarray data in postmortem brain research JO - Neurobiol Dis VL - 18 UR - https://doi.org/10.1016/j.nbd.2004.10.020 DO - 10.1016/j.nbd.2004.10.020 ID - Hollingshead2005 ER - TY - JOUR AU - Barnes, M. AU - Freudenberg, J. AU - Thompson, S. AU - Aronow, B. AU - Pavlidis, P. PY - 2005 DA - 2005// TI - Experimental comparison and cross-validation of the Affymetrix and Illumina gene expression analysis platforms JO - Nucleic Acids Res VL - 33 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gki890 DO - 10.1093/nar/gki890 ID - Barnes2005 ER - TY - JOUR AU - Setlur, S. R. AU - Rubin, M. A. PY - 2005 DA - 2005// TI - Current thoughts on the role of the androgen receptor and prostate cancer progression JO - Adv Anat Pathol VL - 12 UR - https://doi.org/10.1097/01.pap.0000184179.50672.f7 DO - 10.1097/01.pap.0000184179.50672.f7 ID - Setlur2005 ER - TY - JOUR AU - Chen, C. D. AU - Welsbie, D. S. AU - Tran, C. AU - Baek, S. H. AU - Chen, R. AU - Vessella, R. AU - Rosenfeld, M. G. AU - Sawyers, C. L. PY - 2004 DA - 2004// TI - Molecular determinants of resistance to antiandrogen therapy JO - Nat Med VL - 10 UR - https://doi.org/10.1038/nm972 DO - 10.1038/nm972 ID - Chen2004 ER - TY - JOUR AU - Sirotnak, F. M. AU - She, Y. AU - Khokhar, N. Z. AU - Hayes, P. AU - Gerald, W. AU - Scher, H. I. PY - 2004 DA - 2004// TI - Microarray analysis of prostate cancer progression to reduced androgen dependence: studies in unique models contrasts early and late molecular events JO - Mol Carcinog VL - 41 UR - https://doi.org/10.1002/mc.20051 DO - 10.1002/mc.20051 ID - Sirotnak2004 ER - TY - JOUR AU - Amler, L. C. AU - Agus, D. B. AU - LeDuc, C. AU - Sapinoso, M. L. AU - Fox, W. D. AU - Kern, S. AU - Lee, D. AU - Wang, V. AU - Leysens, M. AU - Higgins, B. AU - Martin, J. AU - Gerald, W. AU - Dracopoli, N. AU - Cordon-Cardo, C. AU - Scher, H. I. AU - Hampton, G. M. PY - 2000 DA - 2000// TI - Dysregulated expression of androgen-responsive and nonresponsive genes in the androgen-independent prostate cancer xenograft model CWR22-R1 JO - Cancer Res VL - 60 ID - Amler2000 ER - TY - JOUR AU - Mousses, S. AU - Bubendorf, L. AU - Wagner, U. AU - Hostetter, G. AU - Kononen, J. AU - Cornelison, R. AU - Goldberger, N. AU - Elkahloun, A. G. AU - Willi, N. AU - Koivisto, P. AU - Ferhle, W. AU - Raffeld, M. AU - Sauter, G. AU - Kallioniemi, O. P. PY - 2002 DA - 2002// TI - Clinical validation of candidate genes associated with prostate cancer progression in the CWR22 model system using tissue microarrays JO - Cancer Res VL - 62 ID - Mousses2002 ER - TY - JOUR AU - Kang, Y. AU - Siegel, P. M. AU - Shu, W. AU - Drobnjak, M. AU - Kakonen, S. M. AU - Cordon-Cardo, C. AU - Guise, T. A. AU - Massague, J. PY - 2003 DA - 2003// TI - A multigenic program mediating breast cancer metastasis to bone JO - Cancer Cell VL - 3 UR - https://doi.org/10.1016/S1535-6108(03)00132-6 DO - 10.1016/S1535-6108(03)00132-6 ID - Kang2003 ER - TY - JOUR AU - Segal, E. AU - Friedman, N. AU - Koller, D. AU - Regev, A. PY - 2004 DA - 2004// TI - A module map showing conditional activity of expression modules in cancer JO - Nat Genet VL - 36 UR - https://doi.org/10.1038/ng1434 DO - 10.1038/ng1434 ID - Segal2004 ER - TY - JOUR AU - Hulboy, D. L. AU - Matrisian, L. M. AU - Crawford, H. C. PY - 2001 DA - 2001// TI - Loss of JunB activity enhances stromelysin 1 expression in a model of the epithelial-to-mesenchymal transition of mouse skin tumors JO - Mol Cell Biol VL - 21 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.21.16.5478-5487.2001 DO - 10.1128/MCB.21.16.5478-5487.2001 ID - Hulboy2001 ER - TY - JOUR AU - Hermani, A. AU - De Servi, B. AU - Medunjanin, S. AU - Tessier, P. A. AU - Mayer, D. PY - 2006 DA - 2006// TI - S100A8 and S100A9 activate MAP kinase and NF-kappaB signaling pathways and trigger translocation of RAGE in human prostate cancer cells JO - Exp Cell Res VL - 312 UR - https://doi.org/10.1016/j.yexcr.2005.10.013 DO - 10.1016/j.yexcr.2005.10.013 ID - Hermani2006 ER - TY - JOUR AU - Hermani, A. AU - Hess, J. AU - De Servi, B. AU - Medunjanin, S. AU - Grobholz, R. AU - Trojan, L. AU - Angel, P. AU - Mayer, D. PY - 2005 DA - 2005// TI - Calcium-binding proteins S100A8 and S100A9 as novel diagnostic markers in human prostate cancer JO - Clin Cancer Res VL - 11 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-05-0352 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-05-0352 ID - Hermani2005 ER - TY - JOUR AU - Zlot, C. AU - Ingle, G. AU - Hongo, J. AU - Yang, S. AU - Sheng, Z. AU - Schwall, R. AU - Paoni, N. AU - Wang, F. AU - Peale, F. V. AU - Gerritsen, M. E. PY - 2003 DA - 2003// TI - Stanniocalcin 1 is an autocrine modulator of endothelial angiogenic responses to hepatocyte growth factor JO - J Biol Chem VL - 278 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M301353200 DO - 10.1074/jbc.M301353200 ID - Zlot2003 ER - TY - JOUR AU - McCudden, C. R. AU - Majewski, A. AU - Chakrabarti, S. AU - Wagner, G. F. PY - 2004 DA - 2004// TI - Co-localization of stanniocalcin-1 ligand and receptor in human breast carcinomas JO - Mol Cell Endocrinol VL - 213 UR - https://doi.org/10.1016/j.mce.2003.10.042 DO - 10.1016/j.mce.2003.10.042 ID - McCudden2004 ER - TY - JOUR AU - Chirgwin, J. M. AU - Mohammad, K. S. AU - Guise, T. A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Tumor-bone cellular interactions in skeletal metastases JO - J Musculoskelet Neuronal Interact VL - 4 ID - Chirgwin2004 ER - TY - JOUR AU - Stavropoulou, P. AU - Gregorakis, A. K. AU - Plebani, M. AU - Scorilas, A. PY - 2005 DA - 2005// TI - Expression analysis and prognostic significance of human kallikrein 11 in prostate cancer JO - Clin Chim Acta VL - 357 UR - https://doi.org/10.1016/j.cccn.2005.03.026 DO - 10.1016/j.cccn.2005.03.026 ID - Stavropoulou2005 ER - TY - JOUR AU - Lin, D. W. AU - Coleman, I. M. AU - Hawley, S. AU - Dumpit, R. AU - Gifford, D. AU - Kezele, P. AU - Hung, H. AU - Knudsen, B. S. AU - Kristal, A. R. AU - Nelson, P. S. PY - 2006 DA - 2006// TI - Influence of surgical manipulation on prostate gene expression: implications for molecular correlates of treatment effects and disease prognosis JO - J Clin Oncol VL - 24 UR - https://doi.org/10.1200/JCO.2005.05.1458 DO - 10.1200/JCO.2005.05.1458 ID - Lin2006 ER - TY - STD TI - The pre-publication history for this paper can be accessed here:http://www.biomedcentral.com/1471-2407/7/64/prepub UR - http://www.biomedcentral.com/1471-2407/7/64/prepub ID - ref48 ER -