Table 3 HER2 and STARD3 FISH pattern and complex Chr17 rearrangements in nine breast cancer cell lines and one primary culture raised from a triple negative breast carcinoma
Cell line | CEP 17 signals (green) | HER2signals (red) | Chr17 | Complex abnormalities encompassing HER2Amplification | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
Cluster | Individual | Normal | Derivatives | |||
MCF7 | 4 | 0 | 2 | 2* | der(17)t(8;17)t(1;8) | |
der(17)t(17;19)(p11.1;p12) | ||||||
T47D | 4 | 0 | 4 | 2* | dic(9;17)(p12;p13)*x2 | |
ZR-75-1 | 3 | 0 | 3 | 2* | der(17)t(6;17)(p12;p11.2)* | |
BT474 | 6 | 9 | 6 | 4* | der(17)t(6;17)(?;p13)t(15;17)(q11.2;q25)hsr(17)(q11q12**)x2 | der(X)t(X;17)(q13;q11q12)del(X)(p21)hsr(17)(q11q12**)x2 |
der(11)t(8;17)(q21.1;q11q12*)t(11;17)(p15;q11q12)x2 | ||||||
der(11)t(11;17)(q?14;q?11.2)hsr(17)(q11q12**) | ||||||
der(11)t(11;17)(q?14;?)t(8;17)(?;q?11.2)hsr(17)(q11q12**)x2 | ||||||
der(13)t(13;17)(q10;q11q12)t(13;17)(q10;q11q12)hsr(17)(q11q12**)x2 | ||||||
der(17)t(6;17)(?;p13)t(15;17)(q11.2;q25)hsr(17)(q11q12**)x2 | ||||||
MDA-MB361 | 4 | 1 | 4 | 0 | der(17)t(6;17)(?;q21)* | der(8)t(8;17)(p21;q11q12)t(5;17)(?;q11q12)hsr(17)(q11q12**) |
der(17)t(7;17)(?;p13)* | der(8)t(8;17)(p21;q25)t(8;17)(q13;q11.2*) | |||||
der(17)t(17;20)(p11.1;?)t(9;20)(?;q13.1)t(5;9)(q14;?) | ||||||
der(17)t(17;21)(q21;q22)* | ||||||
SKBR3 | 7 | 16 | 4 | 0 | der(17)t(8;17)(q12;?)dup(17)(?)hsr(17)(q11q12**/**/**/**/**/**) hsr(17)(q21)x2 | der(X)t(X;17)(q21;q?21)hsr(17)(q11q12**)x2 |
der(17)t(8;17)(?;q25)dup(17)(q22q25)* | der(17)t(8;17)(q12;?)dup(17)(?)hsr(17)(q11q12**/**/**/**/**/**)hsr(17)(q21)x2 | |||||
der(17)t(8;13;14;17;21)(?;q?;q?;q11q12;?) hsr(17)(q11q21**/**) | der(17)t(8;13;14;17;21)(?;q?;q?;q11q12;?)hsr(17)(q11q21**/**) | |||||
der(17)t(3;8;13;17;17;20)(?;?;q12*;q12*;?p;?) | ||||||
der(17;17)t(17;17)(q25;?)dup(17)(q22q25)t(17;20)(?;?)* | ||||||
JIMT-1 | 2 | 2 | 2 | 0 | der(17)t(8;17)(?;p13)* | der(3)t(3;12)(p21;?)t(2;3)(?;q12)t(2;17)(?;q11q12)hsr(17)(q11q12**) |
der(17)t(17;22)(p13;?)t(17;22)(q11.1;?) | der(8)t(8;17)(q13;q11q12)t(8;17)(q11.1;q12)hsr(17)(q11q12**) | |||||
KPL4 | 3 | 2 | 3 | 2* | der(6)t(6;17)(p12;q11.2*)t(8;17)(q25;?) | der(1)t(1;17)(p36.3;q11q12)hsr(17)(q11q12**) |
der(17)t(3;17)(q13;q11)t(6;17)(?;q11) | der(9;13)t(9;17)(p24;q11q12)t(13;17)(p11.2;q11.2)hsr(17)(q11q12**) | |||||
MDA-MB231 | 3 | 0 | 3 | 3* | 0 | 0 |
TNBC CASE | 4 | 0 | 2 | 0 | der(17)t(8;17)(q21;p12)*x2 | |
der(17)del(17)(p11.2)del(17)(q11.2) | ||||||
der(17)t(17;22)(p11.1;q11.2) | ||||||