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Table 3 Loss of heterozygosity of the myxofibrosarcoma cell line MUG-Myx1

From: The novel myxofibrosarcoma cell line MUG-Myx1 expresses a tumourigenic stem-like cell population with high aldehyde dehydrogenase 1 activity

Type Chromosome Cytoband start Cytoband end Associated cancer genes
LOH 1 p36.22 p36.21  
LOH 1 p33 p32.3 CDKN2C
LOH 2 p23.1 p22.3  
LOH 2 q21.3 q22.1  
LOH 2 q24.3 q24.3  
LOH 2 q32.3 q32.3  
LOH 2 p16.1 p16.1  
LOH 2 q12.3 q13  
LOH 3 q13.13 q13.13  
LOH 3 q13.12 q13.13  
LOH 3 p21.2 p21.1 BAP1
LOH 4 q22.3 q23 RAP1GDS1
LOH 4 p15.1 p15.1  
LOH 4 q31.3 q31.3  
LOH 5 p13.1 p13.1  
LOH 5 q23.1 q23.1  
LOH 5 q23.3 q31.1 ACSL6
LOH 5 q21.1 q21.1  
LOH 6 q24.3 q24.3  
LOH 6 p22.2 p22.1  
LOH 6 p21.31 p21.31 FANCE
LOH 7 p11.2 p11.2 EGFR
LOH 7 q32.1 q32.1  
LOH 7 q11.22 q11.22  
LOH 7 q31.1 q31.1  
LOH 7 q31.31 q31.31  
LOH 8 p11.21 p11.1 HOOK3
LOH 9 p24.3 p21.1 JAK2;CD274;CD273;NFIB;PSIP2;MLLT3;CDKN2a(p14)
LOH 10 q22.1 q22.2  
LOH 10 q26.3 q26.3  
LOH 10 q24.32 q24.32 NFKB2
LOH 11 p15.4 p15.4  
LOH 11 q13.4 q13.4  
LOH 11 p11.2 p11.12  
LOH 12 q24.33 q24.33  
LOH 12 p11.1 p11.1  
LOH 12 q21.2 q21.31  
LOH 12 q24.11 q24.13 ALDH2
LOH 13 q21.1 q21.1  
LOH 13 q31.1 q31.1  
LOH 14 q21.1 q21.2  
LOH 15 q15.1 q15.3  
LOH 15 q21.1 q21.1  
LOH 15 q24.3 q24.3  
LOH 15 q21.1 q21.2  
LOH 16 q11.2 q12.1  
LOH 16 p11.2 p11.2  
LOH 17 q22 q23.2 CLTC
LOH 19 q13.12 q13.13  
LOH 20 q11.22 q11.22  
LOH 20 p11.21 p11.1