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Table 3 Loss of heterozygosity of the myxofibrosarcoma cell line MUG-Myx1

From: The novel myxofibrosarcoma cell line MUG-Myx1 expresses a tumourigenic stem-like cell population with high aldehyde dehydrogenase 1 activity

Type

Chromosome

Cytoband start

Cytoband end

Associated cancer genes

LOH

1

p36.22

p36.21

 

LOH

1

p33

p32.3

CDKN2C

LOH

2

p23.1

p22.3

 

LOH

2

q21.3

q22.1

 

LOH

2

q24.3

q24.3

 

LOH

2

q32.3

q32.3

 

LOH

2

p16.1

p16.1

 

LOH

2

q12.3

q13

 

LOH

3

q13.13

q13.13

 

LOH

3

q13.12

q13.13

 

LOH

3

p21.2

p21.1

BAP1

LOH

4

q22.3

q23

RAP1GDS1

LOH

4

p15.1

p15.1

 

LOH

4

q31.3

q31.3

 

LOH

5

p13.1

p13.1

 

LOH

5

q23.1

q23.1

 

LOH

5

q23.3

q31.1

ACSL6

LOH

5

q21.1

q21.1

 

LOH

6

q24.3

q24.3

 

LOH

6

p22.2

p22.1

 

LOH

6

p21.31

p21.31

FANCE

LOH

7

p11.2

p11.2

EGFR

LOH

7

q32.1

q32.1

 

LOH

7

q11.22

q11.22

 

LOH

7

q31.1

q31.1

 

LOH

7

q31.31

q31.31

 

LOH

8

p11.21

p11.1

HOOK3

LOH

9

p24.3

p21.1

JAK2;CD274;CD273;NFIB;PSIP2;MLLT3;CDKN2a(p14)

LOH

10

q22.1

q22.2

 

LOH

10

q26.3

q26.3

 

LOH

10

q24.32

q24.32

NFKB2

LOH

11

p15.4

p15.4

 

LOH

11

q13.4

q13.4

 

LOH

11

p11.2

p11.12

 

LOH

12

q24.33

q24.33

 

LOH

12

p11.1

p11.1

 

LOH

12

q21.2

q21.31

 

LOH

12

q24.11

q24.13

ALDH2

LOH

13

q21.1

q21.1

 

LOH

13

q31.1

q31.1

 

LOH

14

q21.1

q21.2

 

LOH

15

q15.1

q15.3

 

LOH

15

q21.1

q21.1

 

LOH

15

q24.3

q24.3

 

LOH

15

q21.1

q21.2

 

LOH

16

q11.2

q12.1

 

LOH

16

p11.2

p11.2

 

LOH

17

q22

q23.2

CLTC

LOH

19

q13.12

q13.13

 

LOH

20

q11.22

q11.22

 

LOH

20

p11.21

p11.1

Â