Table 1 Real time RT-PCR primers
Genes | Forward and reverse primer | Product length (bp) |
|---|---|---|
SPARC | F: 5′-ACATAAGCCCAGTTCATCACCA-3′ | 278 |
|  | R: 5′-ACAACCGATTCACCAACTCCA-3′ |  |
E-cadherin | F: 5′-GGATTGCAAATTCCTGCCATTC-3′ | 147 |
|  | R: 5′-AACGTTGTCCCGGGTGTCA-3′ |  |
β-catenin | F: 5′-GCTGATCTTGGACTTGATATTGGTG -3′ | 117 |
|  | R: 5′- GTCCATACCCAAGGCATCCTG -3′ |  |
α-catenin | F: 5′- CTCTACTGCCACCAGCTGAACATC -3′ | 154 |
|  | R: 5′- ATGCCTTCACTGTCTGCACCAC -3′ |  |
Integrin β3 | F: 5′-TTCAATGCCACCTGCCTCAA-3′ | 98 |
|  | R: 5′-TTGGCCTCAATGCTGAAGCTC-3′ |  |
Integrin β1 | F: 5′-CAAGCAGGGCCAAATTGTGG-3′ | 185 |
|  | R: 5′-CCTTTGCTACGGTTGGTTACATT-3′ |  |
ILK | F: 5′- CCAATGTCCTGGTCGCATGTA -3′ | 132 |
|  | R: 5′- CGTGTCACCAGTTCCCACAGA -3′ |  |
FAK | F: 5′-CTGGCAGCATCTATCCAGGTCA-3′ | 144 |
|  | R: 5′-TTGGCAACACTTGCCCAATC-3′ |  |
P53 | F: 5′- AACGGTACTCCGCCACC-3′ | 94 |
|  | R: 5′- CGTGTCACCGTCGTGGA-3′ |  |
P21 | F: 5′- CACTCAGAGGAGGAAAATCCAGT −3′ | 90 |
|  | R: 5′- TTCTGACATGGCGCCTGCCT −3′ |  |
Cyclin D1 | F: 5′-CCGAGAAGCTGTGCATCTACAC-3′ | 94 |
|  | R: 5′-AGGTTCCACTTGAGCTTGTTCAC-3′ |  |
PCNA | F: 5′- CTGTAGCGGCGTTGT -3′ | 133 |
|  | R: 5′- ACTTTCTCCTGGTTTGG -3′ |  |
Bcl-2 | F: 5′- TCAGGGACGGGGTGAACT -3′ | 143 |
|  | R: 5′- CAGGTGCCGGTTCAGGTACTC -3′ |  |
Bax | F: 5′- CGCCGTGGACACAGACTC -3′ | 108 |
|  | R: 5′- GCAAAGTAGAAAAGGGCGACAAC -3′ |  |
u-PA | F: 5′-TCTGCCTGCCCTCGATGTATAAC-3′ | 179 |
|  | R: 5′-GGTGGTGACTTCAGAGCCGTAGTAG-3′ |  |
PAI-1 | F: 5′-GGTCTCCAAACCAGACGGTGA-3′ | 188 |
|  | R: 5′-TGGCAATGTGACTGGAACAGAAATA-3′ |  |
uPAR | F: 5′- ATCACCAGCCTTACCGAGGTTG -3′ | 87 |
|  | F: 5′- ACGGCTTCGGGAATAGGTGAC -3′ |  |
MMP2 | F: 5′-TGACATCAAGGGCATTCAGGAG-3′ | 134 |
|  | R: 5′-TCTGAGCGATGCCATCAAATACA-3′ |  |
MMP9 | F: 5′- CGCCCATTTCGACGATGAC -3′ | 80 |
|  | R: 5′- CGCCATCTGCGTTTCCAA -3′ |  |
TIMP1 | F: 5′- ACAGACGGCCTTCTGCAATTC-3′ | 166 |
|  | R: 5′- GGTGTAGACGAACCGGATGTCA -3′ |  |
TIMP2 | F: 5′- GTTCAAAGGGCCTGAGAAGGA -3′ | 166 |
|  | R: 5′- CCAGGGCACGATGAAGTCA-3′ |  |
GAPDH | F: 5- GGGAAACTGTGGCGTGAT -3′ | 299 |
|  | R: 5′- GAGTGGGTGTCGCTGTTGA -3′ |  |