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Table 3 Chromosomal structural aberrations analyzed by a combination of M-FISH and array-CGH

From: Characterization of genetic rearrangements in esophageal squamous carcinoma cell lines by a combination of M-FISH and array-CGH: further confirmation of some split genomic regions in primary tumors

Cell line Chromosomal structural aberrations
KYSE30 der(1)t(1;8)(p10;q?), der(1;9)(p10;p10), der(1)(3qter → 3q?::5p11 → 5p14.1::1p35.3 → 1q23.2::17p10 → 17p13.1:), der(2;4)(4pter → 4p10::2pter → 2q31.2::4q10 → 4qter), der(2)t(2;9)(p10;q22.3), der(2)t(2;X)(p10;p11), der(2)(5pter → 5p14.1::2p16.2 → 2q31.2::8q10 → 8qter), der(3)t(3;9)(3q10 → qter::9q22.1 → q22.33:), der(4)t(4;5)(q10;p11), der(4)t(4;7)(q13.3;p15.1), der(4)(4pter → 4p10::3q26.33 → 3qter::7p12.1 → 7p11::14q?), der(5)t(1;5)(p36.13;p10), der(5;11)(q10;p10), der(5)(3q? → 3qter::5q10 → 5q15::1q23.2 → 1qter), der(5)(3q26.33 → 3qter::5p14.1 → 5p10::9q22.1 → 9qter), der(5)(5pter → 5p10::11q13.3 → 11q13.4::20q11 → 20q11.23:), der(5)(:5p14.1 → 5p10::13q?::18q11:), der(6)t(4;6)(q?;p24.1), der(7)t(6;7)(p22.3;p14.3), der(5;7)(:5p14.1 → 5p10::7p14.3 → 7q22.1::12p10 → 12pter), der(7)(16pter → 16p11;14q?;7p12.1 → 7q22.1:), der(15)(9q22.3 → 9qter::15q10 → 15qter), der(11)t(6;11)(p10;p12), der(11;18)(p10;p10), der(7;11)(:11q10 → 11q13.3::7q10 → 7q22.1::12q11 → 12q14.1:), der(12;19)(p10;p10), der(12)(12pter → 12q14.1::19p?::18p?), der(13;19)(q10;q10), der(17)(:13q21.32 → 13q31.3::17p13.1 → 17p10::13q21.32 → 13q31.3::17p13.1 → 17p10:), der(14;20)(q10;p10), der(?)(14q?::16p?::7p11 → 7p12.1:), der(14)(18pter → 18p10::13q?::14q10 → 14q31.1:), der(15)t(5;15)(q15;q10), der(16;20)(q10;p10), der(16)(16pter → 16p10::10pter → 10p11.21::2q11 → 2q33.1::?), der(17)(:7p12.1 → 7p11::17q10 → 17qter::17q10 → 17qter), der(17;20)(:17p13.1 → 17p10::22q10 → 22q11.21::10q26.3 → 10qter), der(17)(:18q11::9q22.1 → 9q22.33::17p? → 17p10::22q12.1 → 22q12.3::10p11.21 → 10pter), der(21)t(5;21)(q15;q10), der(21)t(9;21)(q22;q10), der(21)(:9q22.1 → 9q22.33::11q13.3 → 11q13.4::21q10 → 21qter), der(22)t(7;22)(p12.1;q10)
KYSE150 der(1)t(1;14)(q31.1;q1?), der(2)(2pter → 2p24.3::1q32.2 → 1q41::2p24.1 → 2q35:), der(3)t(3;12)(p14.2;q14.1), der(5;11)(q10;p10), der(6)t(6;X)(q?;q27.1), t(15;6;15;6;15)(:15q11::6p22.2 → 6p21.33::15q10 → 15q11::6p12.2 → 6p12.1::15q11:), der(7)t(7;11)(p10;q?), der(7)t(7;15)(q22.1;q11), der(5;7)(1pter → 1p22.2::7q10 → 7q22.1::18q21.1 → 18q21.1::5p10 → 5pter), der(6;8)(p10;q10), der(8)t(8;18)(p22;p11), der(9)(:9p24.1 → 9p23::1q32.3 → 1q41::9p21.1 → 9qter), der(9)(9pter → 9q?::15q11 → 15qter::7q? → 7qter), der(11;19)(q10;p10), der(11)t(11;X)(p14.1;q10), der(11)(:2q35::11p14.1 → 11p10::6p22.2 → 6p21.33:), der(12)t(1;12)(?;q14.1), der(12)(1pter → 1q31.1::9p2? → 9p2?::12p10 → 12pter), t(21;11;12)(?::q?::q? → qter), der(13)t(5;13)(?;q10), der(?)(7q?::14q23.2 → 14qter::15q10 → 15q11:), der(14)(2qter → 2q35::11p1? → 11p1?::14q10 → 14qter), der(15;22)(15q10 → 15qter::22q10 → 22qter::15q10 → 15qter), der(16)t(12;16)(?;pter), der(17;20)(p10;q10), der(18)t(3;18)(p14.2;q10), der(6;19)(q10;p10), der(X)t(11;X)(p14.1;p10), t(X;15;X)(?::15q?::?)
KYSE510 der(2)t(2;8)(q10;q23.3), der(2;9)(q10;q10), der(2)t(2;19)(p10;q1?), der(2)t(2;20)(q33.1;q?), der(2)(2pter → 2p10::18q12.1 → 18q12.2::16p?), der(3;6)(q10;p10), der(4)t(1;4)(p21.1;q10), der(4)t(4;17)(q34.3;?), der(5)(5pter → 5p10::19q13.11 → 19q13.42::11q22.2 → 11q22.3::15q25.3 → 15qter::7pter → 7p12.3), der(7;10)(10q10 → 10qter::7q10 → 7q21.2::14q22.1 → 14q31.1:), der(8)(8pter → 8q12.1::1q21.2 → 1q23.3::18q12.1 → 18q12.2::1q21.2 → 1q23.3:: 8pter → 8q12.1), der(9)(9q10 → 9qter::8q23.3 → 8q24.21::11q13.2 → 11q13.4::15q25.3 → 15qter::11q11 → 11q13.2:), der(10)t(10;19)(q10;q12), der(11)t(11;18)(p10;q11), der(11)(5pter → 5p11::11p13 → 11q14.3::18pter → 18p11.31), der(14)t(9;14)(p11;q10), der(14)(14q?::3q28 → 3qter::14q22.1 → 14q31.1::14q?), der(15)t(15;21)(q10;q?), der(17)t(14;17)(?;q10), der(18)(:1q21.1 → 1q23.3::18pter → 18p10::1q23.3 → 1qter), der(11)(9pter → 9p21.3::19q13.11 → 19q13.42::8pter → 8p21.3::11q13.2 → 11q13.4::15q25.3 → 15qter::11q10 → q?), der(20)t(2;20)(q33.1;q10), der(21)t(15;21)(q25.3;q10), der(21)(:11p13 → 11p11::2p11 → 2p11::21q10 → 21q?), der(X)t(3;X)(p14.1;p22.31)
YES2 der(3)t(3;12)(q29;?), der(3)(9pter → 9p21.3::3q10 → 3q13.31::?), der(4)t(4;16)(q?;p11), der(5)t(5;9)(q?;?), der(5)t(5;13)(p10;q32.1), der(6)t(6;20)(p12.3;q10), der(12)(16pter → 16p11::6p21.1 → 6p12.3::12q10 → 12q21.1:), der(7)t(7;12)(q11.21;q24.11), der(17)t(7;17)(q31.1;p10), der(22)t(7;22)(q11.21;q10), der(10)t(10;16)(p10;p11), der(11)t(11;13)(p10;q32.1), der(11)t(11;21)(pter;?), der(12)t(5;12)(q23.3;p10), der(12)t(12;20)(q21.1;q?), der(12)(12pter → 12p10::17q2?::8q23.3 → 8q24.1:), der(13)(9q21.32 → 9qter::13q10 → 13q32.1::?::4q?), der(14)(14pter → 14q12::X?::12q?::14q22.1 → 14qter), der(15)(15qter → q10::15q10 → 15qter), der(16)t(16;18)(p10;q11), der(16)t(16;X)(q11;?), der(17)(:17q10 → 17q24.3::20q11.21 → 20q?), der(20)(:16p11 → 16p11::11p13 → p11::20p10 → 20pter), der(21)t(5;21)(q10;q21.1), der(X)t(22;X)(q11;p10)