TY - JOUR AU - Frohling, S. AU - Dohner, H. PY - 2008 DA - 2008// TI - Chromosomal abnormalities in cancer JO - N Engl J Med VL - 359 ID - Frohling2008 ER - TY - JOUR AU - Ritz, A. AU - Paris, P. L. AU - Ittmann, M. M. AU - Collins, C. AU - Raphael, B. J. PY - 2011 DA - 2011// TI - Detection of recurrent rearrangement breakpoints from copy number data JO - BMC Bioinformatics VL - 12 ID - Ritz2011 ER - TY - JOUR AU - Mitelman, F. AU - Johansson, B. AU - Mertens, F. PY - 2007 DA - 2007// TI - The impact of translocations and gene fusions on cancer causation JO - Nat Rev Cancer VL - 7 ID - Mitelman2007 ER - TY - JOUR AU - Edwards, P. A. PY - 2010 DA - 2010// TI - Fusion genes and chromosome translocations in the common epithelial cancers JO - J Pathol VL - 220 ID - Edwards2010 ER - TY - JOUR AU - Clark, J. P. AU - Cooper, C. S. PY - 2009 DA - 2009// TI - ETS gene fusions in prostate cancer JO - Nat Rev Urol VL - 6 ID - Clark2009 ER - TY - JOUR AU - Berger, M. F. AU - Lawrence, M. S. AU - Demichelis, F. AU - Drier, Y. AU - Cibulskis, K. AU - Sivachenko, A. Y. AU - Sboner, A. AU - Esgueva, R. AU - Pflueger, D. AU - Sougnez, C. PY - 2011 DA - 2011// TI - The genomic complexity of primary human prostate cancer JO - Nature VL - 470 ID - Berger2011 ER - TY - JOUR AU - Stephens, P. J. AU - McBride, D. J. AU - Lin, M. L. AU - Varela, I. AU - Pleasance, E. D. AU - Simpson, J. T. AU - Stebbings, L. A. AU - Leroy, C. AU - Edkins, S. AU - Mudie, L. J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Complex landscapes of somatic rearrangement in human breast cancer genomes JO - Nature VL - 462 ID - Stephens2009 ER - TY - JOUR AU - Inaki, K. AU - Hillmer, A. M. AU - Ukil, L. AU - Yao, F. AU - Woo, X. Y. AU - Vardy, L. A. AU - Zawack, K. F. AU - Lee, C. W. AU - Ariyaratne, P. N. AU - Chan, Y. S. PY - 2011 DA - 2011// TI - Transcriptional consequences of genomic structural aberrations in breast cancer JO - Genome Res VL - 21 ID - Inaki2011 ER - TY - JOUR AU - Kohno, T. AU - Ichikawa, H. AU - Totoki, Y. AU - Yasuda, K. AU - Hiramoto, M. AU - Nammo, T. AU - Sakamoto, H. AU - Tsuta, K. AU - Furuta, K. AU - Shimada, Y. PY - 2012 DA - 2012// TI - KIF5B-RET fusions in lung adenocarcinoma JO - Nat Med VL - 18 ID - Kohno2012 ER - TY - JOUR AU - Ju, Y. S. AU - Lee, W. C. AU - Shin, J. Y. AU - Lee, S. AU - Bleazard, T. AU - Won, J. K. AU - Kim, Y. T. AU - Kim, J. I. AU - Kang, J. H. AU - Seo, J. S. PY - 2012 DA - 2012// TI - A transforming KIF5B and RET gene fusion in lung adenocarcinoma revealed from whole-genome and transcriptome sequencing JO - Genome Res VL - 22 ID - Ju2012 ER - TY - JOUR AU - Bass, A. J. AU - Lawrence, M. S. AU - Brace, L. E. AU - Ramos, A. H. AU - Drier, Y. AU - Cibulskis, K. AU - Sougnez, C. AU - Voet, D. AU - Saksena, G. AU - Sivachenko, A. PY - 2011 DA - 2011// TI - Genomic sequencing of colorectal adenocarcinomas identifies a recurrent VTI1A-TCF7L2 fusion JO - Nat Genet VL - 43 ID - Bass2011 ER - TY - JOUR AU - Palanisamy, N. AU - Ateeq, B. AU - Kalyana-Sundaram, S. AU - Pflueger, D. AU - Ramnarayanan, K. AU - Shankar, S. AU - Han, B. AU - Cao, Q. AU - Cao, X. AU - Suleman, K. PY - 2010 DA - 2010// TI - Rearrangements of the RAF kinase pathway in prostate cancer, gastric cancer and melanoma JO - Nat Med VL - 16 ID - Palanisamy2010 ER - TY - JOUR AU - Stransky, N. AU - Egloff, A. M. AU - Tward, A. D. AU - Kostic, A. D. AU - Cibulskis, K. AU - Sivachenko, A. AU - Kryukov, G. V. AU - Lawrence, M. S. AU - Sougnez, C. AU - McKenna, A. PY - 2011 DA - 2011// TI - The mutational landscape of head and neck squamous cell carcinoma JO - Science VL - 333 ID - Stransky2011 ER - TY - JOUR AU - Totoki, Y. AU - Tatsuno, K. AU - Yamamoto, S. AU - Arai, Y. AU - Hosoda, F. AU - Ishikawa, S. AU - Tsutsumi, S. AU - Sonoda, K. AU - Totsuka, H. AU - Shirakihara, T. PY - 2011 DA - 2011// TI - High-resolution characterization of a hepatocellular carcinoma genome JO - Nat Genet VL - 43 ID - Totoki2011 ER - TY - JOUR AU - Tomlins, S. A. AU - Rhodes, D. R. AU - Perner, S. AU - Dhanasekaran, S. M. AU - Mehra, R. AU - Sun, X. W. AU - Varambally, S. AU - Cao, X. AU - Tchinda, J. AU - Kuefer, R. PY - 2005 DA - 2005// TI - Recurrent fusion of TMPRSS2 and ETS transcription factor genes in prostate cancer JO - Science VL - 310 ID - Tomlins2005 ER - TY - JOUR AU - Speicher, M. R. PY - 1996 DA - 1996// TI - Gwyn Ballard S, Ward DC: Karyotyping human chromosomes by combinatorial multi-fluor FISH JO - Nat Genet VL - 12 ID - Speicher1996 ER - TY - JOUR AU - Schrock, E. AU - du Manoir, S. AU - Veldman, T. AU - Schoell, B. AU - Wienberg, J. AU - Ferguson-Smith, M. A. AU - Ning, Y. AU - Ledbetter, D. H. AU - Bar-Am, I. AU - Soenksen, D. PY - 1996 DA - 1996// TI - Multicolor spectral karyotyping of human chromosomes JO - Science VL - 273 ID - Schrock1996 ER - TY - JOUR AU - Pinkel, D. AU - Segraves, R. AU - Sudar, D. AU - Clark, S. AU - Poole, I. AU - Kowbel, D. AU - Collins, C. AU - Kuo, W. L. AU - Chen, C. AU - Zhai, Y. PY - 1998 DA - 1998// TI - High resolution analysis of DNA copy number variation using comparative genomic hybridization to microarrays JO - Nat Genet VL - 20 ID - Pinkel1998 ER - TY - JOUR AU - Speicher, M. R. AU - Carter, N. P. PY - 2005 DA - 2005// TI - The new cytogenetics: blurring the boundaries with molecular biology JO - Nat Rev Genet VL - 6 ID - Speicher2005 ER - TY - JOUR AU - Camps, J. AU - Grade, M. AU - Nguyen, Q. T. AU - Hormann, P. AU - Becker, S. AU - Hummon, A. B. AU - Rodriguez, V. AU - Chandrasekharappa, S. AU - Chen, Y. AU - Difilippantonio, M. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Chromosomal breakpoints in primary colon cancer cluster at sites of structural variants in the genome JO - Cancer Res VL - 68 ID - Camps2008 ER - TY - JOUR AU - Mao, X. AU - James, S. Y. AU - Yanez-Munoz, R. J. AU - Chaplin, T. AU - Molloy, G. AU - Oliver, R. T. AU - Young, B. D. AU - Lu, Y. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Rapid high-resolution karyotyping with precise identification of chromosome breakpoints JO - Genes Chromosomes Cancer VL - 46 ID - Mao2007 ER - TY - JOUR AU - Watson, S. K. AU - DeLeeuw, R. J. AU - Horsman, D. E. AU - Squire, J. A. AU - Lam, W. L. PY - 2007 DA - 2007// TI - Cytogenetically balanced translocations are associated with focal copy number alterations JO - Hum Genet VL - 120 ID - Watson2007 ER - TY - JOUR AU - Kawamata, N. AU - Ogawa, S. AU - Zimmermann, M. AU - Niebuhr, B. AU - Stocking, C. AU - Sanada, M. AU - Hemminki, K. AU - Yamatomo, G. AU - Nannya, Y. AU - Koehler, R. PY - 2008 DA - 2008// TI - Cloning of genes involved in chromosomal translocations by high-resolution single nucleotide polymorphism genomic microarray JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 105 ID - Kawamata2008 ER - TY - JOUR AU - Persson, F. AU - Winnes, M. AU - Andren, Y. AU - Wedell, B. AU - Dahlenfors, R. AU - Asp, J. AU - Mark, J. AU - Enlund, F. AU - Stenman, G. PY - 2008 DA - 2008// TI - High-resolution array CGH analysis of salivary gland tumors reveals fusion and amplification of the FGFR1 and PLAG1 genes in ring chromosomes JO - Oncogene VL - 27 ID - Persson2008 ER - TY - JOUR AU - Howarth, K. D. AU - Blood, K. A. AU - Ng, B. L. AU - Beavis, J. C. AU - Chua, Y. AU - Cooke, S. L. AU - Raby, S. AU - Ichimura, K. AU - Collins, V. P. AU - Carter, N. P. PY - 2008 DA - 2008// TI - Array painting reveals a high frequency of balanced translocations in breast cancer cell lines that break in cancer-relevant genes JO - Oncogene VL - 27 ID - Howarth2008 ER - TY - JOUR AU - Jemal, A. AU - Bray, F. AU - Center, M. M. AU - Ferlay, J. AU - Ward, E. AU - Forman, D. PY - 2011 DA - 2011// TI - Global cancer statistics JO - CA Cancer J Clin VL - 61 ID - Jemal2011 ER - TY - JOUR AU - Parkin, D. M. AU - Bray, F. I. AU - Devesa, S. S. PY - 2001 DA - 2001// TI - Cancer burden in the year 2000. The global picture JO - Eur J Cancer VL - 37 ID - Parkin2001 ER - TY - JOUR AU - Wu, Y. P. AU - Yang, Y. L. AU - Yang, G. Z. AU - Wang, X. Y. AU - Luo, M. L. AU - Zhang, Y. AU - Feng, Y. B. AU - Xu, X. AU - Han, Y. L. AU - Cai, Y. PY - 2006 DA - 2006// TI - Identification of chromosome aberrations in esophageal cancer cell line KYSE180 by multicolor fluorescence in situ hybridization JO - Cancer Genet Cytogenet VL - 170 ID - Wu2006 ER - TY - JOUR AU - Wu, Y. P. AU - Yang, Y. L. AU - Han, Y. L. AU - Xu, X. AU - Cai, Y. AU - Yang, G. Z. AU - Wang, X. Y. AU - Zhan, Q. M. AU - Wu, M. AU - Wang, M. R. PY - 2006 DA - 2006// TI - Identification of complex chromosome abnormalities in esophageal carcinoma cells KYSE450 by multicolor fluorescence in situ hybridization JO - Shijie Huaren Xiaohua Zazhi VL - 14 ID - Wu2006 ER - TY - JOUR AU - Yang, Y. AU - Chu, J. AU - Wu, Y. AU - Luo, M. AU - Xu, X. AU - Han, Y. AU - Cai, Y. AU - Zhan, Q. AU - Wang, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Chromosome analysis of esophageal squamous cell carcinoma cell line KYSE 410-4 by repetitive multicolor fluorescence in situ hybridization JO - J Genet Genomics VL - 35 ID - Yang2008 ER - TY - JOUR AU - Pimkhaokham, A. AU - Shimada, Y. AU - Fukuda, Y. AU - Kurihara, N. AU - Imoto, I. AU - Yang, Z. Q. AU - Imamura, M. AU - Nakamura, Y. AU - Amagasa, T. AU - Inazawa, J. PY - 2000 DA - 2000// TI - Nonrandom chromosomal imbalances in esophageal squamous cell carcinoma cell lines: possible involvement of the ATF3 and CENPF genes in the 1q32 amplicon JO - Jpn J Cancer Res VL - 91 ID - Pimkhaokham2000 ER - TY - JOUR AU - Wei, F. AU - Ni, J. AU - Wu, S. S. AU - Liu, H. AU - Xu, X. AU - Han, Y. L. AU - Cai, Y. AU - Zhang, J. W. AU - Chen, X. J. AU - Pang, H. PY - 2002 DA - 2002// TI - Cytogenetic studies of esophageal squamous cell carcinomas in the northern Chinese population by comparative genomic hybridization JO - Cancer Genet Cytogenet VL - 138 ID - Wei2002 ER - TY - JOUR AU - Qin, Y. R. AU - Wang, L. D. AU - Fan, Z. M. AU - Kwong, D. AU - Guan, X. Y. PY - 2008 DA - 2008// TI - Comparative genomic hybridization analysis of genetic aberrations associated with development of esophageal squamous cell carcinoma in Henan, China JO - World J Gastroenterol VL - 14 ID - Qin2008 ER - TY - JOUR AU - Sakai, N. AU - Kajiyama, Y. AU - Iwanuma, Y. AU - Tomita, N. AU - Amano, T. AU - Isayama, F. AU - Ouchi, K. AU - Tsurumaru, M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Study of abnormal chromosome regions in esophageal squamous cell carcinoma by comparative genomic hybridization: relationship of lymph node metastasis and distant metastasis to selected abnormal regions JO - Dis Esophagus VL - 23 ID - Sakai2010 ER - TY - JOUR AU - Yen, C. C. AU - Chen, Y. J. AU - Lu, K. H. AU - Hsia, J. Y. AU - Chen, J. T. AU - Hu, C. P. AU - Chen, P. M. AU - Liu, J. H. AU - Chiou, T. J. AU - Wang, W. S. PY - 2003 DA - 2003// TI - Genotypic analysis of esophageal squamous cell carcinoma by molecular cytogenetics and real-time quantitative polymerase chain reaction JO - Int J Oncol VL - 23 ID - Yen2003 ER - TY - JOUR AU - Carneiro, A. AU - Isinger, A. AU - Karlsson, A. AU - Johansson, J. AU - Jonsson, G. AU - Bendahl, P. O. AU - Falkenback, D. AU - Halvarsson, B. AU - Nilbert, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Prognostic impact of array-based genomic profiles in esophageal squamous cell cancer JO - BMC Cancer VL - 8 ID - Carneiro2008 ER - TY - JOUR AU - Hu, N. AU - Wang, C. AU - Ng, D. AU - Clifford, R. AU - Yang, H. H. AU - Tang, Z. Z. AU - Wang, Q. H. AU - Han, X. Y. AU - Giffen, C. AU - Goldstein, A. M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Genomic characterization of esophageal squamous cell carcinoma from a high-risk population in China JO - Cancer Res VL - 69 ID - Hu2009 ER - TY - JOUR AU - Shi, Z. Z. AU - Liang, J. W. AU - Zhan, T. AU - Wang, B. S. AU - Lin, D. C. AU - Liu, S. G. AU - Hao, J. J. AU - Yang, H. AU - Zhang, Y. AU - Zhan, Q. M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Genomic alterations with impact on survival in esophageal squamous cell carcinoma identified by array comparative genomic hybridization JO - Genes Chromosomes Cancer VL - 50 ID - Shi2011 ER - TY - JOUR AU - Telenius, H. AU - Carter, N. P. AU - Bebb, C. E. AU - Nordenskjold, M. AU - Ponder, B. A. AU - Tunnacliffe, A. PY - 1992 DA - 1992// TI - Degenerate oligonucleotide-primed PCR: general amplification of target DNA by a single degenerate primer JO - Genomics VL - 13 ID - Telenius1992 ER - TY - JOUR AU - Albertson, D. G. AU - Collins, C. AU - McCormick, F. AU - Gray, J. W. PY - 2003 DA - 2003// TI - Chromosome aberrations in solid tumors JO - Nat Genet VL - 34 ID - Albertson2003 ER - TY - JOUR AU - Nambiar, M. AU - Kari, V. AU - Raghavan, S. C. PY - 2008 DA - 2008// TI - Chromosomal translocations in cancer JO - Biochim Biophys Acta VL - 1786 ID - Nambiar2008 ER - TY - JOUR AU - Reshmi, S. C. AU - Huang, X. AU - Schoppy, D. W. AU - Black, R. C. AU - Saunders, W. S. AU - Smith, D. I. AU - Gollin, S. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Relationship between FRA11F and 11q13 gene amplification in oral cancer JO - Genes Chromosomes Cancer VL - 46 ID - Reshmi2007 ER - TY - JOUR AU - Ueno, T. AU - Tangoku, A. AU - Yoshino, S. AU - Abe, T. AU - Toshimitsu, H. AU - Furuya, T. AU - Kawauchi, S. AU - Oga, A. AU - Oka, M. AU - Sasaki, K. PY - 2002 DA - 2002// TI - Gain of 5p15 detected by comparative genomic hybridization as an independent marker of poor prognosis in patients with esophageal squamous cell carcinoma JO - Clin Cancer Res VL - 8 ID - Ueno2002 ER - TY - JOUR AU - Tada, K. AU - Oka, M. AU - Hayashi, H. AU - Tangoku, A. AU - Oga, A. AU - Sasaki, K. PY - 2000 DA - 2000// TI - Cytogenetic analysis of esophageal squamous cell carcinoma cell lines by comparative genomic hybridization: relationship of cytogenetic aberrations to in vitro cell growth JO - Cancer Genet Cytogenet VL - 117 ID - Tada2000 ER - TY - JOUR AU - Akagi, I. AU - Miyashita, M. AU - Makino, H. AU - Nomura, T. AU - Hagiwara, N. AU - Takahashi, K. AU - Cho, K. AU - Mishima, T. AU - Ishibashi, O. AU - Ushijima, T. PY - 2009 DA - 2009// TI - Overexpression of PIK3CA is associated with lymph node metastasis in esophageal squamous cell carcinoma JO - Int J Oncol VL - 34 ID - Akagi2009 ER - TY - JOUR AU - Yang, Y. L. AU - Chu, J. Y. AU - Luo, M. L. AU - Wu, Y. P. AU - Zhang, Y. AU - Feng, Y. B. AU - Shi, Z. Z. AU - Xu, X. AU - Han, Y. L. AU - Cai, Y. PY - 2008 DA - 2008// TI - Amplification of PRKCI, located in 3q26, is associated with lymph node metastasis in esophageal squamous cell carcinoma JO - Genes Chromosomes Cancer VL - 47 ID - Yang2008 ER - TY - JOUR AU - Imoto, I. AU - Yuki, Y. AU - Sonoda, I. AU - Ito, T. AU - Shimada, Y. AU - Imamura, M. AU - Inazawa, J. PY - 2003 DA - 2003// TI - Identification of ZASC1 encoding a Kruppel-like zinc finger protein as a novel target for 3q26 amplification in esophageal squamous cell carcinomas JO - Cancer Res VL - 63 ID - Imoto2003 ER - TY - JOUR AU - Wada, S. AU - Noguchi, T. AU - Takeno, S. AU - Kawahara, K. PY - 2006 DA - 2006// TI - PIK3CA and TFRC located in 3q are new prognostic factors in esophageal squamous cell carcinoma JO - Ann Surg Oncol VL - 13 ID - Wada2006 ER - TY - JOUR AU - Wang, X. C. AU - Wu, Y. P. AU - Ye, B. AU - Lin, D. C. AU - Feng, Y. B. AU - Zhang, Z. Q. AU - Xu, X. AU - Han, Y. L. AU - Cai, Y. AU - Dong, J. T. PY - 2009 DA - 2009// TI - Suppression of anoikis by SKP2 amplification and overexpression promotes metastasis of esophageal squamous cell carcinoma JO - Mol Cancer Res VL - 7 ID - Wang2009 ER - TY - JOUR AU - Nakakuki, K. AU - Imoto, I. AU - Pimkhaokham, A. AU - Fukuda, Y. AU - Shimada, Y. AU - Imamura, M. AU - Amagasa, T. AU - Inazawa, J. PY - 2002 DA - 2002// TI - Novel targets for the 18p11.3 amplification frequently observed in esophageal squamous cell carcinomas JO - Carcinogenesis VL - 23 ID - Nakakuki2002 ER - TY - JOUR AU - Yang, S. B. AU - Zhou, X. B. AU - Zhu, H. X. AU - Quan, L. P. AU - Bai, J. F. AU - He, J. AU - Gao, Y. N. AU - Cheng, S. J. AU - Xu, N. Z. PY - 2007 DA - 2007// TI - Amplification and overexpression of Aurora-A in esophageal squamous cell carcinoma JO - Oncol Rep VL - 17 ID - Yang2007 ER - TY - JOUR AU - Furukawa, T. AU - Kanai, N. AU - Shiwaku, H. O. AU - Soga, N. AU - Uehara, A. AU - Horii, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - AURKA is one of the downstream targets of MAPK1/ERK2 in pancreatic cancer JO - Oncogene VL - 25 ID - Furukawa2006 ER - TY - JOUR AU - Baba, Y. AU - Nosho, K. AU - Shima, K. AU - Irahara, N. AU - Kure, S. AU - Toyoda, S. AU - Kirkner, G. J. AU - Goel, A. AU - Fuchs, C. S. AU - Ogino, S. PY - 2009 DA - 2009// TI - Aurora-A expression is independently associated with chromosomal instability in colorectal cancer JO - Neoplasia VL - 11 ID - Baba2009 ER - TY - JOUR AU - Mendiola, M. AU - Barriuso, J. AU - Marino-Enriquez, A. AU - Redondo, A. AU - Dominguez-Caceres, A. AU - Hernandez-Cortes, G. AU - Perez-Fernandez, E. AU - Sanchez-Navarro, I. AU - Vara, J. A. AU - Suarez, A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Aurora kinases as prognostic biomarkers in ovarian carcinoma JO - Hum Pathol VL - 40 ID - Mendiola2009 ER - TY - JOUR AU - Miyai, K. AU - Yamamoto, S. AU - Asano, T. AU - Tamai, S. AU - Matsubara, O. AU - Tsuda, H. PY - 2010 DA - 2010// TI - Protein overexpression and gene amplification of epidermal growth factor receptor in adult testicular germ cell tumors: potential role in tumor progression JO - Cancer Sci VL - 101 ID - Miyai2010 ER - TY - JOUR AU - Rubin Grandis, J. AU - Melhem, M. F. AU - Gooding, W. E. AU - Day, R. AU - Holst, V. A. AU - Wagener, M. M. AU - Drenning, S. D. AU - Tweardy, D. J. PY - 1998 DA - 1998// TI - Levels of TGF-alpha and EGFR protein in head and neck squamous cell carcinoma and patient survival JO - J Natl Cancer Inst VL - 90 ID - Rubin Grandis1998 ER - TY - JOUR AU - Singhi, A. D. AU - Cimino-Mathews, A. AU - Jenkins, R. B. AU - Lan, F. AU - Fink, S. R. AU - Nassar, H. AU - Vang, R. AU - Fetting, J. H. AU - Hicks, J. AU - Sukumar, S. PY - 2012 DA - 2012// TI - MYC gene amplification is often acquired in lethal distant breast cancer metastases of unamplified primary tumors JO - Mod Pathol VL - 25 ID - Singhi2012 ER - TY - JOUR AU - Maesawa, C. AU - Tamura, G. AU - Nishizuka, S. AU - Ogasawara, S. AU - Ishida, K. AU - Terashima, M. AU - Sakata, K. AU - Sato, N. AU - Saito, K. AU - Satodate, R. PY - 1996 DA - 1996// TI - Inactivation of the CDKN2 gene by homozygous deletion and de novo methylation is associated with advanced stage esophageal squamous cell carcinoma JO - Cancer Res VL - 56 ID - Maesawa1996 ER - TY - JOUR AU - Kim, D. H. AU - Muto, M. AU - Kuwahara, Y. AU - Nakanishi, Y. AU - Watanabe, H. AU - Aoyagi, K. AU - Ogawa, K. AU - Yoshida, T. AU - Sasaki, H. PY - 2006 DA - 2006// TI - Array-based comparative genomic hybridization of circulating esophageal tumor cells JO - Oncol Rep VL - 16 ID - Kim2006 ER - TY - JOUR AU - Urashima, M. AU - Hoshi, Y. AU - Sugimoto, Y. AU - Kaihara, C. AU - Matsuzaki, M. AU - Chauhan, D. AU - Ogata, A. AU - Teoh, G. AU - DeCaprio, J. A. AU - Anderson, K. C. PY - 1996 DA - 1996// TI - A novel pre-B acute lymphoblastic leukemia cell line with chromosomal translocation between p16(INK4A)/p15(INK4B) tumor suppressor and immunoglobulin heavy chain genes: TGFbeta/IL-7 inhibitory signaling mechanism JO - Leukemia VL - 10 ID - Urashima1996 ER - TY - JOUR AU - Burrow, A. A. AU - Williams, L. E. AU - Pierce, L. C. AU - Wang, Y. H. PY - 2009 DA - 2009// TI - Over half of breakpoints in gene pairs involved in cancer-specific recurrent translocations are mapped to human chromosomal fragile sites JO - BMC Genomics VL - 10 ID - Burrow2009 ER - TY - JOUR AU - Arai, H. AU - Ueno, T. AU - Tangoku, A. AU - Yoshino, S. AU - Abe, T. AU - Kawauchi, S. AU - Oga, A. AU - Furuya, T. AU - Oka, M. AU - Sasaki, K. PY - 2003 DA - 2003// TI - Detection of amplified oncogenes by genome DNA microarrays in human primary esophageal squamous cell carcinoma: comparison with conventional comparative genomic hybridization analysis JO - Cancer Genet Cytogenet VL - 146 ID - Arai2003 ER - TY - JOUR AU - Hirasaki, S. AU - Noguchi, T. AU - Mimori, K. AU - Onuki, J. AU - Morita, K. AU - Inoue, H. AU - Sugihara, K. AU - Mori, M. AU - Hirano, T. PY - 2007 DA - 2007// TI - BAC clones related to prognosis in patients with esophageal squamous carcinoma: an array comparative genomic hybridization study JO - Oncologist VL - 12 ID - Hirasaki2007 ER - TY - JOUR AU - Kuroda, A. AU - Tsukamoto, Y. AU - Nguyen, L. T. AU - Noguchi, T. AU - Takeuchi, I. AU - Uchida, M. AU - Uchida, T. AU - Hijiya, N. AU - Nakada, C. AU - Okimoto, T. PY - 2011 DA - 2011// TI - Genomic profiling of submucosal-invasive gastric cancer by array-based comparative genomic hybridization JO - PLoS One VL - 6 ID - Kuroda2011 ER - TY - JOUR AU - Letessier, A. AU - Sircoulomb, F. AU - Ginestier, C. AU - Cervera, N. AU - Monville, F. AU - Gelsi-Boyer, V. AU - Esterni, B. AU - Geneix, J. AU - Finetti, P. AU - Zemmour, C. PY - 2006 DA - 2006// TI - Frequency, prognostic impact, and subtype association of 8p12, 8q24, 11q13, 12p13, 17q12, and 20q13 amplifications in breast cancers JO - BMC Cancer VL - 6 ID - Letessier2006 ER - TY - JOUR AU - Kwek, S. S. AU - Roy, R. AU - Zhou, H. AU - Climent, J. AU - Martinez-Climent, J. A. AU - Fridlyand, J. AU - Albertson, D. G. PY - 2009 DA - 2009// TI - Co-amplified genes at 8p12 and 11q13 in breast tumors cooperate with two major pathways in oncogenesis JO - Oncogene VL - 28 ID - Kwek2009 ER - TY - JOUR AU - Dancau, A. M. AU - Wuth, L. AU - Waschow, M. AU - Holst, F. AU - Krohn, A. AU - Choschzick, M. AU - Terracciano, L. AU - Politis, S. AU - Kurtz, S. AU - Lebeau, A. PY - 2010 DA - 2010// TI - PPFIA1 and CCND1 are frequently coamplified in breast cancer JO - Genes Chromosomes Cancer VL - 49 ID - Dancau2010 ER - TY - JOUR AU - Tan, D. S. AU - Lambros, M. B. AU - Rayter, S. AU - Natrajan, R. AU - Vatcheva, R. AU - Gao, Q. AU - Marchio, C. AU - Geyer, F. C. AU - Savage, K. AU - Parry, S. PY - 2009 DA - 2009// TI - PPM1D is a potential therapeutic target in ovarian clear cell carcinomas JO - Clin Cancer Res VL - 15 ID - Tan2009 ER - TY - JOUR AU - Das, K. AU - Lau, W. AU - Sivaswaren, C. AU - Ph, T. AU - Fook-Chong, S. AU - Sl, T. AU - Cheng, C. PY - 2005 DA - 2005// TI - Chromosomal changes in prostate cancer: a fluorescence in situ hybridization study JO - Clin Genet VL - 68 ID - Das2005 ER - TY - JOUR AU - Zaharieva, B. M. AU - Simon, R. AU - Diener, P. A. AU - Ackermann, D. AU - Maurer, R. AU - Alund, G. AU - Knonagel, H. AU - Rist, M. AU - Wilber, K. AU - Hering, F. PY - 2003 DA - 2003// TI - High-throughput tissue microarray analysis of 11q13 gene amplification (CCND1, FGF3, FGF4, EMS1) in urinary bladder cancer JO - J Pathol VL - 201 ID - Zaharieva2003 ER - TY - JOUR AU - Jarmuz, M. AU - Grenman, R. AU - Golusinski, W. AU - Szyfter, K. PY - 2005 DA - 2005// TI - Aberrations of 11q13 in laryngeal squamous cell lines and their prognostic significance JO - Cancer Genet Cytogenet VL - 160 ID - Jarmuz2005 ER - TY - JOUR AU - Hui, A. B. AU - Or, Y. Y. AU - Takano, H. AU - Tsang, R. K. AU - To, K. F. AU - Guan, X. Y. AU - Sham, J. S. AU - Hung, K. W. AU - Lam, C. N. AU - van Hasselt, C. A. PY - 2005 DA - 2005// TI - Array-based comparative genomic hybridization analysis identified cyclin D1 as a target oncogene at 11q13.3 in nasopharyngeal carcinoma JO - Cancer Res VL - 65 ID - Hui2005 ER - TY - JOUR AU - Wen, J. M. AU - Huang, J. F. AU - Hu, L. AU - Wang, W. S. AU - Zhang, M. AU - Sham, J. S. AU - Xu, J. M. AU - Zeng, W. F. AU - Xie, D. AU - Liang, L. J. PY - 2002 DA - 2002// TI - Establishment and characterization of human metastatic hepatocellular carcinoma cell line JO - Cancer Genet Cytogenet VL - 135 ID - Wen2002 ER - TY - JOUR AU - Jin, C. AU - Jin, Y. AU - Gisselsson, D. AU - Wennerberg, J. AU - Wah, T. S. AU - Stromback, B. AU - Kwong, Y. L. AU - Mertens, F. PY - 2006 DA - 2006// TI - Molecular cytogenetic characterization of the 11q13 amplicon in head and neck squamous cell carcinoma JO - Cytogenet Genome Res VL - 115 ID - Jin2006 ER - TY - JOUR AU - Gibcus, J. H. AU - Kok, K. AU - Menkema, L. AU - Hermsen, M. A. AU - Mastik, M. AU - Kluin, P. M. AU - van der Wal, J. E. AU - Schuuring, E. PY - 2007 DA - 2007// TI - High-resolution mapping identifies a commonly amplified 11q13.3 region containing multiple genes flanked by segmental duplications JO - Hum Genet VL - 121 ID - Gibcus2007 ER - TY - JOUR AU - Luo, M. L. AU - Shen, X. M. AU - Zhang, Y. AU - Wei, F. AU - Xu, X. AU - Cai, Y. AU - Zhang, X. AU - Sun, Y. T. AU - Zhan, Q. M. AU - Wu, M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Amplification and overexpression of CTTN (EMS1) contribute to the metastasis of esophageal squamous cell carcinoma by promoting cell migration and anoikis resistance JO - Cancer Res VL - 66 ID - Luo2006 ER - TY - JOUR AU - Jin, Y. AU - Jin, C. AU - Law, S. AU - Chu, K. M. AU - Zhang, H. AU - Strombeck, B. AU - Yuen, A. P. AU - Kwong, Y. L. PY - 2004 DA - 2004// TI - Cytogenetic and fluorescence in situ hybridization characterization of clonal chromosomal aberrations and CCND1 amplification in esophageal carcinomas JO - Cancer Genet Cytogenet VL - 148 ID - Jin2004 ER - TY - JOUR AU - Ishizuka, T. AU - Tanabe, C. AU - Sakamoto, H. AU - Aoyagi, K. AU - Maekawa, M. AU - Matsukura, N. AU - Tokunaga, A. AU - Tajiri, T. AU - Yoshida, T. AU - Terada, M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Gene amplification profiling of esophageal squamous cell carcinomas by DNA array CGH JO - Biochem Biophys Res Commun VL - 296 ID - Ishizuka2002 ER - TY - JOUR AU - Komatsu, Y. AU - Hibi, K. AU - Kodera, Y. AU - Akiyama, S. AU - Ito, K. AU - Nakao, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - TAOS1, a novel marker for advanced esophageal squamous cell carcinoma JO - Anticancer Res VL - 26 ID - Komatsu2006 ER - TY - JOUR AU - Kohlhammer, H. AU - Schwaenen, C. AU - Wessendorf, S. AU - Holzmann, K. AU - Kestler, H. A. AU - Kienle, D. AU - Barth, T. F. AU - Moller, P. AU - Ott, G. AU - Kalla, J. PY - 2004 DA - 2004// TI - Genomic DNA-chip hybridization in t(11;14)-positive mantle cell lymphomas shows a high frequency of aberrations and allows a refined characterization of consensus regions JO - Blood VL - 104 ID - Kohlhammer2004 ER - TY - JOUR AU - Ronchetti, D. AU - Finelli, P. AU - Richelda, R. AU - Baldini, L. AU - Rocchi, M. AU - Viggiano, L. AU - Cuneo, A. AU - Bogni, S. AU - Fabris, S. AU - Lombardi, L. PY - 1999 DA - 1999// TI - Molecular analysis of 11q13 breakpoints in multiple myeloma JO - Blood VL - 93 ID - Ronchetti1999 ER - TY - JOUR AU - Fenton, J. A. AU - Pratt, G. AU - Rothwell, D. G. AU - Rawstron, A. C. AU - Morgan, G. J. PY - 2004 DA - 2004// TI - Translocation t(11;14) in multiple myeloma: Analysis of translocation breakpoints on der(11) and der(14) chromosomes suggests complex molecular mechanisms of recombination JO - Genes Chromosomes Cancer VL - 39 ID - Fenton2004 ER - TY - JOUR AU - Tarsitano, M. AU - Palmieri, S. AU - Ferrara, F. AU - Riccardi, C. AU - Cavaliere, M. L. AU - Vicari, L. PY - 2009 DA - 2009// TI - Detection of the t(11;14)(q13;q32) without CCND1/IGH fusion in a case of acute myeloid leukemia JO - Cancer Genet Cytogenet VL - 195 ID - Tarsitano2009 ER - TY - JOUR AU - Medeiros, L. J. AU - Carr, J. PY - 1999 DA - 1999// TI - Overview of the role of molecular methods in the diagnosis of malignant lymphomas JO - Arch Pathol Lab Med VL - 123 ID - Medeiros1999 ER - TY - JOUR AU - Janssen, J. W. AU - Vaandrager, J. W. AU - Heuser, T. AU - Jauch, A. AU - Kluin, P. M. AU - Geelen, E. AU - Bergsagel, P. L. AU - Kuehl, W. M. AU - Drexler, H. G. AU - Otsuki, T. PY - 2000 DA - 2000// TI - Concurrent activation of a novel putative transforming gene, myeov, and cyclin D1 in a subset of multiple myeloma cell lines with t(11;14)(q13;q32) JO - Blood VL - 95 ID - Janssen2000 ER - TY - JOUR AU - Wlodarska, I. AU - Meeus, P. AU - Stul, M. AU - Thienpont, L. AU - Wouters, E. AU - Marcelis, L. AU - Demuynck, H. AU - Rummens, J. L. AU - Madoe, V. AU - Hagemeijer, A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Variant t(2;11)(p11;q13) associated with the IgK-CCND1 rearrangement is a recurrent translocation in leukemic small-cell B-non-Hodgkin lymphoma JO - Leukemia VL - 18 ID - Wlodarska2004 ER - TY - JOUR AU - de Oliveira, F. M. AU - Tone, L. G. AU - Simoes, B. P. AU - Falcao, R. P. AU - Brassesco, M. S. AU - Sakamoto-Hojo, E. T. AU - dos Santos, G. A. AU - Marinato, A. F. AU - Jacomo, R. H. AU - Rego, E. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Acute myeloid leukemia (AML-M2) with t(5;11)(q35;q13) and normal expression of cyclin D1 JO - Cancer Genet Cytogenet VL - 172 ID - de Oliveira2007 ER - TY - JOUR AU - Jhang, J. S. AU - Narayan, G. AU - Murty, V. V. AU - Mansukhani, M. M. PY - 2004 DA - 2004// TI - Renal oncocytomas with 11q13 rearrangements: cytogenetic, molecular, and immunohistochemical analysis of cyclin D1 JO - Cancer Genet Cytogenet VL - 149 ID - Jhang2004 ER - TY - JOUR AU - Wells, R. A. AU - Hummel, J. L. AU - De Koven, A. AU - Zipursky, A. AU - Kirby, M. AU - Dube, I. AU - Kamel-Reid, S. PY - 1996 DA - 1996// TI - A new variant translocation in acute promyelocytic leukaemia: molecular characterization and clinical correlation JO - Leukemia VL - 10 ID - Wells1996 ER - TY - JOUR AU - Wells, R. A. AU - Catzavelos, C. AU - Kamel-Reid, S. PY - 1997 DA - 1997// TI - Fusion of retinoic acid receptor alpha to NuMA, the nuclear mitotic apparatus protein, by a variant translocation in acute promyelocytic leukaemia JO - Nat Genet VL - 17 ID - Wells1997 ER - TY - JOUR AU - Sukhai, M. A. AU - Wu, X. AU - Xuan, Y. AU - Zhang, T. AU - Reis, P. P. AU - Dube, K. AU - Rego, E. M. AU - Bhaumik, M. AU - Bailey, D. J. AU - Wells, R. A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Myeloid leukemia with promyelocytic features in transgenic mice expressing hCG-NuMA-RARalpha JO - Oncogene VL - 23 ID - Sukhai2004 ER - TY - JOUR AU - Imagama, S. AU - Abe, A. AU - Suzuki, M. AU - Hayakawa, F. AU - Katsumi, A. AU - Emi, N. AU - Kiyoi, H. AU - Naoe, T. PY - 2007 DA - 2007// TI - LRP16 is fused to RUNX1 in monocytic leukemia cell line with t(11;21)(q13;q22) JO - Eur J Haematol VL - 79 ID - Imagama2007 ER - TY - JOUR AU - Sarova, I. AU - Brezinova, J. AU - Zemanova, Z. AU - Gancarcikova, M. AU - Vydra, J. AU - Cermak, J. AU - Michalova, K. PY - 2011 DA - 2011// TI - A novel gene LRP5 on 11q13.2 is rearranged in two patients with acute myeloid leukemia JO - Leuk Res VL - 35 ID - Sarova2011 ER - TY - JOUR AU - Jesudasan, R. A. AU - Rahman, R. A. AU - Chandrashekharappa, S. AU - Evans, G. A. AU - Srivatsan, E. S. PY - 1995 DA - 1995// TI - Deletion and translocation of chromosome 11q13 sequences in cervical carcinoma cell lines JO - Am J Hum Genet VL - 56 ID - Jesudasan1995 ER - TY - JOUR AU - Rao, P. H. AU - Harris, C. P. AU - Yan Lu, X. AU - Li, X. N. AU - Mok, S. C. AU - Lau, C. C. PY - 2002 DA - 2002// TI - Multicolor spectral karyotyping of serous ovarian adenocarcinoma JO - Genes Chromosomes Cancer VL - 33 ID - Rao2002 ER - TY - JOUR AU - Wong, N. AU - Lai, P. AU - Pang, E. AU - Leung, T. W. AU - Lau, J. W. AU - Johnson, P. J. PY - 2000 DA - 2000// TI - A comprehensive karyotypic study on human hepatocellular carcinoma by spectral karyotyping JO - Hepatology VL - 32 ID - Wong2000 ER - TY - JOUR AU - Yamashita, Y. AU - Nishida, K. AU - Okuda, T. AU - Nomura, K. AU - Matsumoto, Y. AU - Mitsufuji, S. AU - Horiike, S. AU - Hata, H. AU - Sakakura, C. AU - Hagiwara, A. PY - 2005 DA - 2005// TI - Recurrent chromosomal rearrangements at bands 8q24 and 11q13 in gastric cancer as detected by multicolor spectral karyotyping JO - World J Gastroenterol VL - 11 ID - Yamashita2005 ER - TY - JOUR AU - Shuster, M. I. AU - Han, L. AU - Le Beau, M. M. AU - Davis, E. AU - Sawicki, M. AU - Lese, C. M. AU - Park, N. H. AU - Colicelli, J. AU - Gollin, S. M. PY - 2000 DA - 2000// TI - A consistent pattern of RIN1 rearrangements in oral squamous cell carcinoma cell lines supports a breakage-fusion-bridge cycle model for 11q13 amplification JO - Genes Chromosomes Cancer VL - 28 ID - Shuster2000 ER - TY - JOUR AU - Martin, C. L. AU - Reshmi, S. C. AU - Ried, T. AU - Gottberg, W. AU - Wilson, J. W. AU - Reddy, J. K. AU - Khanna, P. AU - Johnson, J. T. AU - Myers, E. N. AU - Gollin, S. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Chromosomal imbalances in oral squamous cell carcinoma: examination of 31 cell lines and review of the literature JO - Oral Oncol VL - 44 ID - Martin2008 ER - TY - JOUR AU - Mishmar, D. AU - Rahat, A. AU - Scherer, S. W. AU - Nyakatura, G. AU - Hinzmann, B. AU - Kohwi, Y. AU - Mandel-Gutfroind, Y. AU - Lee, J. R. AU - Drescher, B. AU - Sas, D. E. PY - 1998 DA - 1998// TI - Molecular characterization of a common fragile site (FRA7H) on human chromosome 7 by the cloning of a simian virus 40 integration site JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 95 ID - Mishmar1998 ER - TY - JOUR AU - Albertson, D. G. PY - 2006 DA - 2006// TI - Gene amplification in cancer JO - Trends Genet VL - 22 ID - Albertson2006 ER - TY - JOUR AU - Reshmi, S. C. AU - Roychoudhury, S. AU - Yu, Z. AU - Feingold, E. AU - Potter, D. AU - Saunders, W. S. AU - Gollin, S. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Inverted duplication pattern in anaphase bridges confirms the breakage-fusion-bridge (BFB) cycle model for 11q13 amplification JO - Cytogenet Genome Res VL - 116 ID - Reshmi2007 ER - TY - JOUR AU - Gajduskova, P. AU - Snijders, A. M. AU - Kwek, S. AU - Roydasgupta, R. AU - Fridlyand, J. AU - Tokuyasu, T. AU - Pinkel, D. AU - Albertson, D. G. PY - 2007 DA - 2007// TI - Genome position and gene amplification JO - Genome Biol VL - 8 ID - Gajduskova2007 ER - TY - JOUR AU - Coquelle, A. AU - Pipiras, E. AU - Toledo, F. AU - Buttin, G. AU - Debatisse, M. PY - 1997 DA - 1997// TI - Expression of fragile sites triggers intrachromosomal mammalian gene amplification and sets boundaries to early amplicons JO - Cell VL - 89 ID - Coquelle1997 ER - TY - JOUR AU - Huang, X. AU - Gollin, S. M. AU - Raja, S. AU - Godfrey, T. E. PY - 2002 DA - 2002// TI - High-resolution mapping of the 11q13 amplicon and identification of a gene, TAOS1, that is amplified and overexpressed in oral cancer cells JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 99 ID - Huang2002 ER - TY - JOUR AU - Tada, K. AU - Oka, M. AU - Tangoku, A. AU - Hayashi, H. AU - Oga, A. AU - Sasaki, K. PY - 2000 DA - 2000// TI - Gains of 8q23-qter and 20q and loss of 11q22-qter in esophageal squamous cell carcinoma associated with lymph node metastasis JO - Cancer VL - 88 ID - Tada2000 ER - TY - JOUR AU - Takeshita, H. AU - Ichikawa, D. AU - Komatsu, S. AU - Tsujiura, M. AU - Kosuga, T. AU - Deguchi, K. AU - Konishi, H. AU - Morimura, R. AU - Shiozaki, A. AU - Fujiwara, H. PY - 2010 DA - 2010// TI - Prediction of CCND1 amplification using plasma DNA as a prognostic marker in oesophageal squamous cell carcinoma JO - Br J Cancer VL - 102 ID - Takeshita2010 ER - TY - JOUR AU - Muller, D. AU - Millon, R. AU - Velten, M. AU - Bronner, G. AU - Jung, G. AU - Engelmann, A. AU - Flesch, H. AU - Eber, M. AU - Methlin, G. AU - Abecassis, J. PY - 1997 DA - 1997// TI - Amplification of 11q13 DNA markers in head and neck squamous cell carcinomas: correlation with clinical outcome JO - Eur J Cancer VL - 33 ID - Muller1997 ER - TY - JOUR AU - Miyamoto, R. AU - Uzawa, N. AU - Nagaoka, S. AU - Nakakuki, K. AU - Hirata, Y. AU - Amagasa, T. PY - 2002 DA - 2002// TI - Potential marker of oral squamous cell carcinoma aggressiveness detected by fluorescence in situ hybridization in fine-needle aspiration biopsies JO - Cancer VL - 95 ID - Miyamoto2002 ER - TY - JOUR AU - Sugahara, K. AU - Michikawa, Y. AU - Ishikawa, K. AU - Shoji, Y. AU - Iwakawa, M. AU - Shibahara, T. AU - Imai, T. PY - 2011 DA - 2011// TI - Combination effects of distinct cores in 11q13 amplification region on cervical lymph node metastasis of oral squamous cell carcinoma JO - Int J Oncol VL - 39 ID - Sugahara2011 ER - TY - JOUR AU - Huang, X. AU - Godfrey, T. E. AU - Gooding, W. E. AU - McCarty, K. S. AU - Gollin, S. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Comprehensive genome and transcriptome analysis of the 11q13 amplicon in human oral cancer and synteny to the 7F5 amplicon in murine oral carcinoma JO - Genes Chromosomes Cancer VL - 45 ID - Huang2006 ER - TY - JOUR AU - Fortin, A. AU - Guerry, M. AU - Guerry, R. AU - Talbot, M. AU - Parise, O. AU - Schwaab, G. AU - Bosq, J. AU - Bourhis, J. AU - Salvatori, P. AU - Janot, F. PY - 1997 DA - 1997// TI - Chromosome 11q13 gene amplifications in oral and oropharyngeal carcinomas: no correlation with subclinical lymph node invasion and disease recurrence JO - Clin Cancer Res VL - 3 ID - Fortin1997 ER - TY - JOUR AU - Xia, J. AU - Chen, Q. AU - Li, B. AU - Zeng, X. PY - 2007 DA - 2007// TI - Amplifications of TAOS1 and EMS1 genes in oral carcinogenesis: association with clinicopathological features JO - Oral Oncol VL - 43 ID - Xia2007 ER - TY - STD TI - The pre-publication history for this paper can be accessed here:http://www.biomedcentral.com/1471-2407/12/367/prepub UR - http://www.biomedcentral.com/1471-2407/12/367/prepub ID - ref114 ER -