vp | Primers | Sequence (5'-3') | Product size | Annealing Temp.(°C) | Cycles |
---|---|---|---|---|---|
RT-PCR | BZLF1F | GGGAGAAGCACCTCAACCTG | 255-bp | 55 | 35 |
 | BZLF1R | TTGCTTAAACTTGGCCCGGC |  |  |  |
 | BRLF1F | CAAACAGACGCAGATGAGGC | 443-bp | 55 | 35 |
 | BRLF1R | GCGGTGCCTATGGTGGCAGG |  |  |  |
 | BHRF1H2 | GTCAAGGTTTCGTCTGTGTG | 213-bp | 55 | 35 |
 | BHRF1H3 | TTCTCTTGCTGCTAGCTCCA |  |  |  |
 | BLLF1F | GTGGATGTGGAACTGTTTCCAG | 230-bp | 55 | 35 |
 | BLLF1R | CTGTATCCACCGCGGATGTCAC |  |  |  |
 | BARTA3 | AGAGACCAGGCTGCTAAACA | 232-bp | 55 | 35 |
 | BARTA4 | AACCAGCTTTCCTTTCCGAG |  |  |  |
 | GAPDHF | GATGACCTTGCCCACAGCCT | 303-bp | 55 | 23 |
 | GAPDHR | ATCTCTGCCCCCTCTGCTGA |  |  |  |
MSP | Zpm1 | TCGGATTTTCGTGGGTTAATC | 101-bp | 64 | 42 |
 | Zpm2 | CGAAACTAACGTTAAAAATCCG |  |  |  |
 | Zpu1 | ATTTGGATTTTTGTGGGTTAATT | 101-bp | 62 | 40 |
 | Zpu2 | CCAAAACTAACATTAAAAATCCA |  |  |  |
 | Rpm1 | TAGGTATTTTGGATATTCGTAC | 172-bp | 64 | 42 |
 | Rpm3 | GATTTAATCCCAACCGCCG |  |  |  |
 | Rpu1 | TGTAGGTATTTTGGATATTTGTAT | 78-bp | 62 | 40 |
 | Rpu2 | CAAATCATTACTCCAAACTATCA |  |  |  |
BGS | ZpMZP1 | AAAAAACACCTAATATAAATCAAA | 814-bp | 62 | 42 |
 | ZpSC22 | GTTAAAGAGGATTAGGTTTTTTT |  |  |  |
 | RpMRP1 | TCTTTTATAAACCATTAACATAAA | 599-bp | 60 | 42 |
 | RpMRP2 | GAGATTGATAGGATTATATTGT |  |  |  |