TY - JOUR AU - Baylin, S. B. AU - Ohm, J. E. PY - 2006 DA - 2006// TI - Epigenetic gene silencing in cancer - a mechanism for early oncogenic pathway addiction? JO - Nature reviews VL - 6 ID - Baylin2006 ER - TY - JOUR AU - Esteller, M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Epigenetics provides a new generation of oncogenes and tumour-suppressor genes JO - British journal of cancer VL - 94 UR - https://doi.org/10.1038/sj.bjc.6602918 DO - 10.1038/sj.bjc.6602918 ID - Esteller2006 ER - TY - JOUR AU - Esteller, M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Cancer epigenomics: DNA methylomes and histone-modification maps JO - Nat Rev Genet VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/nrg2005 DO - 10.1038/nrg2005 ID - Esteller2007 ER - TY - JOUR AU - Fraga, M. F. AU - Ballestar, E. AU - Villar-Garea, A. AU - Boix-Chornet, M. AU - Espada, J. AU - Schotta, G. AU - Bonaldi, T. AU - Haydon, C. AU - Ropero, S. AU - Petrie, K. AU - Iyer, N. G. AU - Perez-Rosado, A. AU - Calvo, E. AU - Lopez, J. A. AU - Cano, A. AU - Calasanz, M. J. AU - Colomer, D. AU - Piris, M. A. AU - Ahn, N. AU - Imhof, A. AU - Caldas, C. AU - Jenuwein, T. AU - Esteller, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Loss of acetylation at Lys16 and trimethylation at Lys20 of histone H4 is a common hallmark of human cancer JO - Nature genetics VL - 37 UR - https://doi.org/10.1038/ng1531 DO - 10.1038/ng1531 ID - Fraga2005 ER - TY - JOUR AU - Seligson, D. B. AU - Horvath, S. AU - Shi, T. AU - Yu, H. AU - Tze, S. AU - Grunstein, M. AU - Kurdistani, S. K. PY - 2005 DA - 2005// TI - Global histone modification patterns predict risk of prostate cancer recurrence JO - Nature VL - 435 UR - https://doi.org/10.1038/nature03672 DO - 10.1038/nature03672 ID - Seligson2005 ER - TY - JOUR AU - Kouzarides, T. PY - 2007 DA - 2007// TI - Chromatin modifications and their function JO - Cell VL - 128 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2007.02.005 DO - 10.1016/j.cell.2007.02.005 ID - Kouzarides2007 ER - TY - JOUR AU - Hamamoto, R. AU - Furukawa, Y. AU - Morita, M. AU - Iimura, Y. AU - Silva, F. P. AU - Li, M. AU - Yagyu, R. AU - Nakamura, Y. PY - 2004 DA - 2004// TI - SMYD3 encodes a histone methyltransferase involved in the proliferation of cancer cells JO - Nature cell biology VL - 6 UR - https://doi.org/10.1038/ncb1151 DO - 10.1038/ncb1151 ID - Hamamoto2004 ER - TY - JOUR AU - Krivtsov, A. V. AU - Armstrong, S. A. PY - 2007 DA - 2007// TI - MLL translocations, histone modifications and leukaemia stem-cell development JO - Nature reviews VL - 7 ID - Krivtsov2007 ER - TY - JOUR AU - Simon, J. A. AU - Lange, C. A. PY - 2008 DA - 2008// TI - Roles of the EZH2 histone methyltransferase in cancer epigenetics JO - Mutat Res VL - 647 UR - https://doi.org/10.1016/j.mrfmmm.2008.07.010 DO - 10.1016/j.mrfmmm.2008.07.010 ID - Simon2008 ER - TY - JOUR AU - Kondo, Y. AU - Shen, L. AU - Cheng, A. S. AU - Ahmed, S. AU - Boumber, Y. AU - Charo, C. AU - Yamochi, T. AU - Urano, T. AU - Furukawa, K. AU - Kwabi-Addo, B. AU - Gold, D. L. AU - Sekido, Y. AU - Huang, T. H. AU - Issa, J. P. PY - 2008 DA - 2008// TI - Gene silencing in cancer by histone H3 lysine 27 trimethylation independent of promoter DNA methylation JO - Nature genetics VL - 40 UR - https://doi.org/10.1038/ng.159 DO - 10.1038/ng.159 ID - Kondo2008 ER - TY - JOUR AU - Yu, J. AU - Rhodes, D. R. AU - Tomlins, S. A. AU - Cao, X. AU - Chen, G. AU - Mehra, R. AU - Wang, X. AU - Ghosh, D. AU - Shah, R. B. AU - Varambally, S. AU - Pienta, K. J. AU - Chinnaiyan, A. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - A polycomb repression signature in metastatic prostate cancer predicts cancer outcome JO - Cancer Res VL - 67 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-07-2498 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-07-2498 ID - Yu2007 ER - TY - JOUR AU - Gal-Yam, E. N. AU - Egger, G. AU - Iniguez, L. AU - Holster, H. AU - Einarsson, S. AU - Zhang, X. AU - Lin, J. C. AU - Liang, G. AU - Jones, P. A. AU - Tanay, A. PY - 2008 DA - 2008// TI - Frequent switching of Polycomb repressive marks and DNA hypermethylation in the PC3 prostate cancer cell line JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 105 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0806437105 DO - 10.1073/pnas.0806437105 ID - Gal-Yam2008 ER - TY - JOUR AU - Rada-Iglesias, A. AU - Enroth, S. AU - Andersson, R. AU - Wanders, A. AU - Pahlman, L. AU - Komorowski, J. AU - Wadelius, C. PY - 2009 DA - 2009// TI - Histone H3 lysine 27 trimethylation in adult differentiated colon associated to cancer DNA hypermethylation JO - Epigenetics VL - 4 UR - https://doi.org/10.4161/epi.4.2.8038 DO - 10.4161/epi.4.2.8038 ID - Rada-Iglesias2009 ER - TY - JOUR AU - Meissner, A. AU - Mikkelsen, T. S. AU - Gu, H. AU - Wernig, M. AU - Hanna, J. AU - Sivachenko, A. AU - Zhang, X. AU - Bernstein, B. E. AU - Nusbaum, C. AU - Jaffe, D. B. AU - Gnirke, A. AU - Jaenisch, R. AU - Lander, E. S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Genome-scale DNA methylation maps of pluripotent and differentiated cells JO - Nature VL - 454 ID - Meissner2008 ER - TY - JOUR AU - Acevedo, L. G. AU - Bieda, M. AU - Green, R. AU - Farnham, P. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Analysis of the mechanisms mediating tumor-specific changes in gene expression in human liver tumors JO - Cancer Res VL - 68 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-07-5590 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-07-5590 ID - Acevedo2008 ER - TY - JOUR AU - Sandgren, J. AU - Andersson, R. AU - Rada-Iglesias, A. AU - Enroth, S. AU - Akerstrom, G. AU - Dumanski, J. P. AU - Komorowski, J. AU - Westin, G. AU - Wadelius, C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Integrative epigenomic and genomic analysis of malignant pheochromocytoma JO - Exp Mol Med VL - 42 UR - https://doi.org/10.3858/emm.2010.42.7.050 DO - 10.3858/emm.2010.42.7.050 ID - Sandgren2010 ER - TY - JOUR AU - Wong, J. J. AU - Hawkins, N. J. AU - Ward, R. L. PY - 2007 DA - 2007// TI - Colorectal cancer: a model for epigenetic tumorigenesis JO - Gut VL - 56 UR - https://doi.org/10.1136/gut.2005.088799 DO - 10.1136/gut.2005.088799 ID - Wong2007 ER - TY - JOUR AU - Fraga, M. F. AU - Agrelo, R. AU - Esteller, M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Cross-talk between aging and cancer: the epigenetic language JO - Annals of the New York Academy of Sciences VL - 1100 UR - https://doi.org/10.1196/annals.1395.005 DO - 10.1196/annals.1395.005 ID - Fraga2007 ER - TY - STD TI - Karolchik D, Kuhn RM, Baertsch R, Barber GP, Clawson H, Diekhans M, Giardine B, Harte RA, Hinrichs AS, Hsu F, Kober KM, Miller W, Pedersen JS, Pohl A, Raney BJ, Rhead B, Rosenbloom KR, Smith KE, Stanke M, Thakkapallayil A, Trumbower H, Wang T, Zweig AS, Haussler D, Kent WJ: The UCSC Genome Browser Database: 2008 update. Nucleic acids research. 2008, D773-779. 36 Database ID - ref19 ER - TY - JOUR AU - Barski, A. AU - Cuddapah, S. AU - Cui, K. AU - Roh, T. Y. AU - Schones, D. E. AU - Wang, Z. AU - Wei, G. AU - Chepelev, I. AU - Zhao, K. PY - 2007 DA - 2007// TI - High-resolution profiling of histone methylations in the human genome JO - Cell VL - 129 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2007.05.009 DO - 10.1016/j.cell.2007.05.009 ID - Barski2007 ER - TY - JOUR AU - Birney, E. AU - Stamatoyannopoulos, J. A. AU - Dutta, A. AU - Guigo, R. AU - Gingeras, T. R. AU - Margulies, E. H. AU - Weng, Z. P. AU - Snyder, M. AU - Dermitzakis, E. T. AU - Stamatoyannopoulos, J. A. AU - Thurman, R. E. AU - Kuehn, M. S. AU - Taylor, C. M. AU - Neph, S. AU - Koch, C. M. AU - Asthana, S. AU - Malhotra, A. AU - Adzhubei, I. AU - Greenbaum, J. A. AU - Andrews, R. M. AU - Flicek, P. AU - Boyle, P. J. AU - Cao, H. AU - Carter, N. P. AU - Clelland, G. K. AU - Davis, S. AU - Day, N. AU - Dhami, P. AU - Dillon, S. C. AU - Dorschner, M. O. PY - 2007 DA - 2007// TI - Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project JO - Nature VL - 447 UR - https://doi.org/10.1038/nature05874 DO - 10.1038/nature05874 ID - Birney2007 ER - TY - JOUR AU - Pan, G. AU - Tian, S. AU - Nie, J. AU - Yang, C. AU - Ruotti, V. AU - Wei, H. AU - Jonsdottir, G. A. AU - Stewart, R. AU - Thomson, J. A. PY - 2007 DA - 2007// TI - Whole-genome analysis of histone H3 lysine 4 and lysine 27 methylation in human embryonic stem cells JO - Cell stem cell VL - 1 UR - https://doi.org/10.1016/j.stem.2007.08.003 DO - 10.1016/j.stem.2007.08.003 ID - Pan2007 ER - TY - JOUR AU - Jiang, X. AU - Tan, J. AU - Li, J. AU - Kivimae, S. AU - Yang, X. AU - Zhuang, L. AU - Lee, P. L. AU - Chan, M. T. AU - Stanton, L. W. AU - Liu, E. T. AU - Cheyette, B. N. AU - Yu, Q. PY - 2008 DA - 2008// TI - DACT3 is an epigenetic regulator of Wnt/beta-catenin signaling in colorectal cancer and is a therapeutic target of histone modifications JO - Cancer cell VL - 13 UR - https://doi.org/10.1016/j.ccr.2008.04.019 DO - 10.1016/j.ccr.2008.04.019 ID - Jiang2008 ER - TY - JOUR AU - Squazzo, S. L. AU - O'Geen, H. AU - Komashko, V. M. AU - Krig, S. R. AU - Jin, V. X. AU - Jang, S. W. AU - Margueron, R. AU - Reinberg, D. AU - Green, R. AU - Farnham, P. J. PY - 2006 DA - 2006// TI - DACT3 is an epigenetic regulator of Wnt/beta-catenin signaling in colorectal cancer and is a therapeutic target of histone modifications JO - Genome Res VL - 16 UR - https://doi.org/10.1101/gr.5306606 DO - 10.1101/gr.5306606 ID - Squazzo2006 ER - TY - JOUR AU - Cui, K. AU - Zang, C. AU - Roh, T. Y. AU - Schones, D. E. AU - Childs, R. W. AU - Peng, W. AU - Zhao, K. PY - 2009 DA - 2009// TI - Chromatin signatures in multipotent human hematopoietic stem cells indicate the fate of bivalent genes during differentiation JO - Cell stem cell VL - 4 UR - https://doi.org/10.1016/j.stem.2008.11.011 DO - 10.1016/j.stem.2008.11.011 ID - Cui2009 ER - TY - JOUR AU - McConnell, B. B. AU - Yang, V. W. PY - 2010 DA - 2010// TI - Mammalian Kruppel-Like Factors in Health and Diseases JO - Physiol Rev VL - 90 UR - https://doi.org/10.1152/physrev.00058.2009 DO - 10.1152/physrev.00058.2009 ID - McConnell2010 ER - TY - JOUR AU - Zhao, L. Y. AU - Niu, Y. AU - Santiago, A. AU - Liu, J. AU - Albert, S. H. AU - Robertson, K. D. AU - Liao, D. PY - 2006 DA - 2006// TI - An EBF3-mediated transcriptional program that induces cell cycle arrest and apoptosis JO - Cancer Res VL - 66 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-06-1713 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-06-1713 ID - Zhao2006 ER - TY - JOUR AU - Nomura, J. AU - Matsumoto, K. AU - Iguchi-Ariga, S. M. M. AU - Ariga, H. PY - 2005 DA - 2005// TI - Positive regulation of Fas gene expression by MSSP and abrogation of Fas-mediated apoptosis induction in MSSP-deficient mice JO - Exp Cell Res VL - 305 UR - https://doi.org/10.1016/j.yexcr.2005.01.006 DO - 10.1016/j.yexcr.2005.01.006 ID - Nomura2005 ER - TY - JOUR AU - Reeve, A. E. AU - Lin, Y. H. AU - Friederichs, J. AU - Black, M. A. AU - Mages, J. AU - Rosenberg, R. AU - Guilford, P. J. AU - Phillips, V. AU - Thompson-Fawcett, M. AU - Kasabov, N. AU - Toro, T. AU - Merrie, A. E. AU - van Rij, A. AU - Yoon, H. S. AU - McCall, J. L. AU - Siewert, J. R. AU - Holzmann, B. PY - 2007 DA - 2007// TI - Multiple gene expression classifiers from different array platforms predict poor prognosis of colorectal cancer JO - Clinical Cancer Research VL - 13 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-05-2734 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-05-2734 ID - Reeve2007 ER - TY - JOUR AU - Jung, C. AU - Kim, R. S. AU - Zhang, H. AU - Lee, S. J. AU - Sheng, H. AU - Loehrer, P. J. AU - Gardner, T. A. AU - Jeng, M. H. AU - Kao, C. PY - 2005 DA - 2005// TI - HOXB13 is downregulated in colorectal cancer to confer TCF4-mediated transactivation JO - British journal of cancer VL - 92 UR - https://doi.org/10.1038/sj.bjc.6602631 DO - 10.1038/sj.bjc.6602631 ID - Jung2005 ER - TY - JOUR AU - Maehata, T. AU - Taniguchi, H. AU - Yamamoto, H. AU - Nosho, K. AU - Adachi, Y. AU - Miyamoto, N. AU - Miyamoto, C. AU - Akutsu, N. AU - Yamaoka, S. AU - Itoh, F. PY - 2008 DA - 2008// TI - Transcriptional silencing of Dickkopf gene family by CpG island hypermethylation in human gastrointestinal cancer JO - World J Gastroenterol VL - 14 UR - https://doi.org/10.3748/wjg.14.2702 DO - 10.3748/wjg.14.2702 ID - Maehata2008 ER - TY - JOUR AU - Ohmachi, T. AU - Tanaka, F. AU - Mimori, K. AU - Inoue, H. AU - Yanaga, K. AU - Mori, M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Clinical significance of TROP2 expression in colorectal cancer JO - Clin Cancer Res VL - 12 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-05-1961 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-05-1961 ID - Ohmachi2006 ER - TY - JOUR AU - Chan, S. W. AU - Lim, C. J. AU - Guo, K. AU - Ng, C. P. AU - Lee, I. AU - Hunziker, W. AU - Zeng, Q. AU - Hong, W. PY - 2008 DA - 2008// TI - A role for TAZ in migration, invasion, and tumorigenesis of breast cancer cells JO - Cancer Res VL - 68 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-07-2696 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-07-2696 ID - Chan2008 ER - TY - JOUR AU - Truong, A. H. AU - Ben-David, Y. PY - 2000 DA - 2000// TI - The role of Fli-1 in normal cell function and malignant transformation JO - Oncogene VL - 19 UR - https://doi.org/10.1038/sj.onc.1204042 DO - 10.1038/sj.onc.1204042 ID - Truong2000 ER - TY - CHAP AU - Valdes-Mora, F. AU - Gomez Del Pulgar, T. AU - Bandres, E. AU - Cejas, P. AU - Ramirez de Molina, A. AU - Perez-Palacios, R. AU - Gallego-Ortega, D. AU - Garcia-Cabezas, M. A. AU - Casado, E. AU - Larrauri, J. AU - Nistal, M. AU - Gonzalez-Baron, M. AU - Garcia-Foncillas, J. AU - Lacal, J. C. PY - 2008 DA - 2008// TI - TWIST1 Overexpression is Associated with Nodal Invasion and Male Sex in Primary Colorectal Cancer BT - Ann Surg Oncol ID - Valdes-Mora2008 ER - TY - JOUR AU - Comijn, J. AU - Berx, G. AU - Vermassen, P. AU - Verschueren, K. AU - van Grunsven, L. AU - Bruyneel, E. AU - Mareel, M. AU - Huylebroeck, D. AU - van Roy, F. PY - 2001 DA - 2001// TI - The two-handed E box binding zinc finger protein SIP1 downregulates E-cadherin and induces invasion JO - Mol Cell VL - 7 UR - https://doi.org/10.1016/S1097-2765(01)00260-X DO - 10.1016/S1097-2765(01)00260-X ID - Comijn2001 ER - TY - JOUR AU - Gustafsson, A. AU - Hansson, E. AU - Kressner, U. AU - Nordgren, S. AU - Andersson, M. AU - Wang, W. AU - Lonnroth, C. AU - Lundholm, K. PY - 2007 DA - 2007// TI - EP1-4 subtype, COX and PPAR gamma receptor expression in colorectal cancer in prediction of disease-specific mortality JO - International journal of cancer VL - 121 UR - https://doi.org/10.1002/ijc.22582 DO - 10.1002/ijc.22582 ID - Gustafsson2007 ER - TY - JOUR AU - Kanehisa, M. AU - Goto, S. PY - 2000 DA - 2000// TI - KEGG: kyoto encyclopedia of genes and genomes JO - Nucleic acids research VL - 28 UR - https://doi.org/10.1093/nar/28.1.27 DO - 10.1093/nar/28.1.27 ID - Kanehisa2000 ER - TY - JOUR AU - Huang, H. AU - He, X. PY - 2008 DA - 2008// TI - Wnt/beta-catenin signaling: new (and old) players and new insights JO - Current opinion in cell biology VL - 20 UR - https://doi.org/10.1016/j.ceb.2008.01.009 DO - 10.1016/j.ceb.2008.01.009 ID - Huang2008 ER - TY - JOUR AU - Segditsas, S. AU - Tomlinson, I. PY - 2006 DA - 2006// TI - Colorectal cancer and genetic alterations in the Wnt pathway JO - Oncogene VL - 25 UR - https://doi.org/10.1038/sj.onc.1210059 DO - 10.1038/sj.onc.1210059 ID - Segditsas2006 ER - TY - JOUR AU - Polakis, P. PY - 2000 DA - 2000// TI - Wnt signaling and cancer JO - Genes & development VL - 14 ID - Polakis2000 ER - TY - JOUR AU - Aoki, M. AU - Hecht, A. AU - Kruse, U. AU - Kemler, R. AU - Vogt, P. K. PY - 1999 DA - 1999// TI - Nuclear endpoint of Wnt signaling: neoplastic transformation induced by transactivating lymphoid-enhancing factor 1 JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 96 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.96.1.139 DO - 10.1073/pnas.96.1.139 ID - Aoki1999 ER - TY - JOUR AU - Giles, R. H. AU - van Es, J. H. AU - Clevers, H. PY - 2003 DA - 2003// TI - Caught up in a Wnt storm: Wnt signaling in cancer JO - Biochimica et biophysica acta VL - 1653 ID - Giles2003 ER - TY - JOUR AU - Takacs, C. M. AU - Baird, J. R. AU - Hughes, E. G. AU - Kent, S. S. AU - Benchabane, H. AU - Paik, R. AU - Ahmed, Y. PY - 2008 DA - 2008// TI - Dual Positive and Negative Regulation of Wingless Signaling by Adenomatous Polyposis Coli JO - Science VL - 319 UR - https://doi.org/10.1126/science.1151232 DO - 10.1126/science.1151232 ID - Takacs2008 ER - TY - JOUR AU - Chinnadurai, G. PY - 2009 DA - 2009// TI - The Transcriptional Corepressor CtBP: A Foe of Multiple Tumor Suppressors JO - Cancer Research VL - 69 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-08-3349 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-08-3349 ID - Chinnadurai2009 ER - TY - JOUR AU - Lee, J. AU - Zhou, P. PY - 2010 DA - 2010// TI - Cullins and Cancer JO - Genes & Cancer VL - 1 UR - https://doi.org/10.1177/1947601910382899 DO - 10.1177/1947601910382899 ID - Lee2010 ER - TY - JOUR AU - Yu, K. AU - Ganesan, K. AU - Tan, L. K. AU - Laban, M. AU - Wu, J. AU - Zhao, X. D. AU - Li, H. AU - Leung, C. H. AU - Zhu, Y. AU - Wei, C. L. AU - Hooi, S. C. AU - Miller, L. AU - Tan, P. PY - 2008 DA - 2008// TI - A precisely regulated gene expression cassette potently modulates metastasis and survival in multiple solid cancers JO - PLoS genetics VL - 4 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1000129 DO - 10.1371/journal.pgen.1000129 ID - Yu2008 ER - TY - JOUR AU - Keshet, I. AU - Schlesinger, Y. AU - Farkash, S. AU - Rand, E. AU - Hecht, M. AU - Segal, E. AU - Pikarski, E. AU - Young, R. A. AU - Niveleau, A. AU - Cedar, H. AU - Simon, I. PY - 2006 DA - 2006// TI - Evidence for an instructive mechanism of de novo methylation in cancer cells JO - Nature genetics VL - 38 UR - https://doi.org/10.1038/ng1719 DO - 10.1038/ng1719 ID - Keshet2006 ER - TY - JOUR AU - Sjoblom, T. AU - Jones, S. AU - Wood, L. D. AU - Parsons, D. W. AU - Lin, J. AU - Barber, T. D. AU - Mandelker, D. AU - Leary, R. J. AU - Ptak, J. AU - Silliman, N. AU - Szabo, S. AU - Buckhaults, P. AU - Farrell, C. AU - Meeh, P. AU - Markowitz, S. D. AU - Willis, J. AU - Dawson, D. AU - Willson, J. K. AU - Gazdar, A. F. AU - Hartigan, J. AU - Wu, L. AU - Liu, C. AU - Parmigiani, G. AU - Park, B. H. AU - Bachman, K. E. AU - Papadopoulos, N. AU - Vogelstein, B. AU - Kinzler, K. W. AU - Velculescu, V. E. PY - 2006 DA - 2006// TI - The consensus coding sequences of human breast and colorectal cancers JO - Science VL - 314 UR - https://doi.org/10.1126/science.1133427 DO - 10.1126/science.1133427 ID - Sjoblom2006 ER - TY - JOUR AU - Jin, S. AU - DiPaola, R. S. AU - Mathew, R. AU - White, E. PY - 2007 DA - 2007// TI - Metabolic catastrophe as a means to cancer cell death JO - J Cell Sci VL - 120 UR - https://doi.org/10.1242/jcs.03349 DO - 10.1242/jcs.03349 ID - Jin2007 ER - TY - JOUR AU - Widschwendter, M. AU - Fiegl, H. AU - Egle, D. AU - Mueller-Holzner, E. AU - Spizzo, G. AU - Marth, C. AU - Weisenberger, D. J. AU - Campan, M. AU - Young, J. AU - Jacobs, I. AU - Laird, P. W. PY - 2007 DA - 2007// TI - Epigenetic stem cell signature in cancer JO - Nature genetics VL - 39 UR - https://doi.org/10.1038/ng1941 DO - 10.1038/ng1941 ID - Widschwendter2007 ER - TY - JOUR AU - Vire, E. AU - Brenner, C. AU - Deplus, R. AU - Blanchon, L. AU - Fraga, M. AU - Didelot, C. AU - Morey, L. AU - Van Eynde, A. AU - Bernard, D. AU - Vanderwinden, J. M. AU - Bollen, M. AU - Esteller, M. AU - Di Croce, L. AU - de Launoit, Y. AU - Fuks, F. PY - 2006 DA - 2006// TI - The Polycomb group protein EZH2 directly controls DNA methylation JO - Nature VL - 439 UR - https://doi.org/10.1038/nature04431 DO - 10.1038/nature04431 ID - Vire2006 ER - TY - JOUR AU - Mikkelsen, T. S. AU - Ku, M. AU - Jaffe, D. B. AU - Issac, B. AU - Lieberman, E. AU - Giannoukos, G. AU - Alvarez, P. AU - Brockman, W. AU - Kim, T. K. AU - Koche, R. P. AU - Lee, W. AU - Mendenhall, E. AU - O'Donovan, A. AU - Presser, A. AU - Russ, C. AU - Xie, X. AU - Meissner, A. AU - Wernig, M. AU - Jaenisch, R. AU - Nusbaum, C. AU - Lander, E. S. AU - Bernstein, B. E. PY - 2007 DA - 2007// TI - Genome-wide maps of chromatin state in pluripotent and lineage-committed cells JO - Nature VL - 448 UR - https://doi.org/10.1038/nature06008 DO - 10.1038/nature06008 ID - Mikkelsen2007 ER - TY - JOUR AU - Rada-Iglesias, A. AU - Wallerman, O. AU - Koch, C. AU - Ameur, A. AU - Enroth, S. AU - Clelland, G. AU - Wester, K. AU - Wilcox, S. AU - Dovey, O. M. AU - Ellis, P. D. AU - Wraight, V. L. AU - James, K. AU - Andrews, R. AU - Langford, C. AU - Dhami, P. AU - Carter, N. AU - Vetrie, D. AU - Ponten, F. AU - Komorowski, J. AU - Dunham, I. AU - Wadelius, C. PY - 2005 DA - 2005// TI - Binding sites for metabolic disease related transcription factors inferred at base pair resolution by chromatin immunoprecipitation and genomic microarrays JO - Hum Mol Genet VL - 14 UR - https://doi.org/10.1093/hmg/ddi378 DO - 10.1093/hmg/ddi378 ID - Rada-Iglesias2005 ER - TY - JOUR AU - Bolstad, B. M. AU - Irizarry, R. A. AU - Astrand, M. AU - Speed, T. P. PY - 2003 DA - 2003// TI - A comparison of normalization methods for high density oligonucleotide array data based on variance and bias JO - Bioinformatics VL - 19 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/19.2.185 DO - 10.1093/bioinformatics/19.2.185 ID - Bolstad2003 ER - TY - STD TI - Tiling Array Software. [http://www.affymetrix.com/partners_programs/programs/developer/TilingArrayTools/index.affx] UR - http://www.affymetrix.com/partners_programs/programs/developer/TilingArrayTools/index.affx ID - ref56 ER - TY - CHAP PY - 2011 DA - 2011// BT - R: A Language and Environment for Statistical Computing ID - ref57 ER - TY - STD TI - The pre-publication history for this paper can be accessed here:http://www.biomedcentral.com/1471-2407/11/450/prepub UR - http://www.biomedcentral.com/1471-2407/11/450/prepub ID - ref58 ER -