Skip to main content

Table 2 KRT23 interacting proteins identified by TAP followed by LC-MS/MS

From: Keratin 23, a novel DPC4/Smad4 target gene which binds 14-3-3ε

Lane
no.
NCBI
accession no.
Protein identified Peptides Mascot
Score
1 gi|40849944 plectin 1 isoform 11 ELYQQLQR 59
    LSVAAQEAAR 56
    FAEQTLR 46
    LAAIGEATR 46
    LTVDEAVR 44
    DLSELGSVR 41
    GLVEDTLR 41
    VSIYEAM*R 33
    DVAEVDTVR 32
2 gi|5729877 HSP70 NQVAM*NPTNTVFDAK 76
    VEIIANDQGNR 74
    DAGTIAGLNVLR 73
    LLQDFFNGK 45
    EIAEAYLGK 43
    NSLESYAFNM*K 38
    LIGDAAK 35
    ITITNDK 33
3 gi|31542947 HSP60 NAGVEGSLIVEK 85
    VTDALNATR 75
    VGGTSDVEVNEK 63
    VGLQVVAVK 62
    TVIIEQSWGSPK 59
    LSDGVAVLK 52
    DDAM*LLK 47
    EIGNIISDAM*K 45
    APGFGDNR 43
    IGIEIIK 41
    VGEVIVTK 41
    NAGVEGSLIVEK 33
4 gi|181573 cytokeratin 8 YEELQSLAGK 73
    LSELEAALQR 71
    SLDM*DSIIAEVK 65
    ASLEAAIADAEQR 59
    KLLEGEESR 57
    LESGM*QNM*SIHTK 56
    TEM*ENEFVLIK 55
    LQAEIEGLK 55
    ISSSSFSR 55
    SLDM*DSIIAEVK 52
    ELQSQISDTSVVLSM*DNSR 48
    TEISEM*NR 46
    LLEGEESR 45
    SRAEAESM*YQIK 44
    FASFIDK 44
    NKYEDEINKR 40
    DVDEAYM*NK 38
    SYTSGPGSR 36
    GELAIK 35
    AEAESM*YQIK 34
    YEDEINKR 33
    QLYEEEIR 33
    FLEQQNK 33
5 gi|20306864 cytokeratin 23 SALENM*LSETQSR 106
    EQSAAM*SQEAASPATVQSR 59
    DLEIEVEGLR 58
    LLEGESEGTR 57
    ATM*QNLNDR 56
    AITQETINGR 49
    MAVDDFNLK 47
    M*AVDDFNLK 47
    ISLSFTTR 44
    YENEHSFK 42
    LASYVEK 40
    APTVHGGAGGAR 38
    ALEEANM*K 35
6 gi|30311 cytokeratin 18 AQIFANTVDNAR 80
    LEAEIATYR 70
    TVQSLEIDLDSM*R 67
    ETM*QSLNDR 53
    LASYLDR 51
    LAADDFR 50
    KVIDDTNITR 46
    VIDDTNITR 45
    STFSTNYR 43
    SLETENR 42
    AQYDELAR 40
    YETELAM*R 38
    DWSHYFK 36
7 gi|67464424 14-3-3 ε VAGM*DVELTVEER 95
    EAAENSLVAYK 84
    YLAEFATGNDR 72
    HLIPAANTGESK 54
    LAEQAER 50
    DSTLIM*QLLR 48
    YDEM*VESM*K 47
    IISSIEQK 44
    QM*VETELK 36
    NLLSVAYK 33
8 gi|21464101 14-3-3 γ NVTELNEPLSNEER 71
    YLAEVATGEK 66
    LAEQAER 62
    DSTLIM*QLLR 58
    YDDM*AAAM*K 56
    NLLSVAYK 55
    VISSIEQK 42
    ATVVESSEK 40
    AYSEAHEISK 35