|  |  | DALS | WHI | Combined |  | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SNP | Location | Allele* | MAF | Genotype | Cases | Controls | OR (95% CI) | p | MAF | Genotype | Cases | Controls | OR (95% CI) | p | OR (95% CI) | p | I2 |
rs16902148 | 128476181 | G→A | 0.05 | GG | 1328 | 1615 | 1 (Ref) |  | 0.05 | GG | 595 | 589 | 1 (Ref) |  |  |  |  |
 |  |  |  | GA | 128 | 184 | 0.86 (0.68-1.09) |  |  | GA | 46 | 57 | 0.81 (0.54-1.21) |  |  |  |  |
 |  |  |  | AA | 2 | 3 | 0.84 (0.14-5.05) |  |  | AA | 1 | 3 | 0.33 (0.03-3.18) |  |  |  |  |
 |  |  |  | log additive |  |  | 0.86 (0.68-1.08) | 0.203 |  | log additive |  |  | 0.75 (0.50-1.13) | 0.168 | 0.83 (0.68-1.02) | 0.073 | 0.0% |
rs10505477 | 128476625 | C→T | 0.49 | CC | 307 | 424 | 1 (Ref) |  | 0.50 | CC | 144 | 162 | 1 (Ref) |  |  |  |  |
 |  |  |  | CT | 741 | 912 | 1.13 (0.95-1.35) |  |  | CT | 323 | 328 | 1.10 (0.84-1.44) |  |  |  |  |
 |  |  |  | TT | 405 | 461 | 1.23 (1.01-1.50) |  |  | TT | 169 | 156 | 1.21 (0.88-1.65) |  |  |  |  |
 |  |  |  | log additive |  |  | 1.11 (1.00-1.22) | 0.045 |  | log additive |  |  | 1.08 (0.91-1.27) | 0.384 | 1.10 (1.01-1.20) | 0.026 | 0.0% |
rs10808555 | 128478693 | G→A | 0.33 | GG | 604 | 797 | 1 (Ref) |  | 0.33 | GG | 278 | 285 | 1 (Ref) |  |  |  |  |
 |  |  |  | GA | 671 | 804 | 1.10 (0.95-1.28) |  |  | GA | 279 | 293 | 0.97 (0.77-1.23) |  |  |  |  |
 |  |  |  | AA | 182 | 198 | 1.21 (0.97-1.52) |  |  | AA | 81 | 67 | 1.24 (0.86-1.79) |  |  |  |  |
 |  |  |  | log additive |  |  | 1.10 (0.99-1.22) | 0.067 |  | log additive |  |  | 1.08 (0.91-1.28) | 0.395 | 1.10 (1.00-1.20) | 0.047 | 0.0% |
rs6983267 | 128482487 | T→G | 0.48 | TT | 284 | 400 | 1 (Ref) |  | 0.49 | TT | 137 | 149 | 1 (Ref) |  |  |  |  |
 |  |  |  | TG | 740 | 899 | 1.17 (0.97-1.40) |  |  | TG | 303 | 326 | 1.00 (0.76-1.33) |  |  |  |  |
 |  |  |  | GG | 424 | 486 | 1.23 (1.00-1.51) |  |  | GG | 174 | 158 | 1.19 (0.87-1.63) |  |  |  |  |
 |  |  |  | log additive |  |  | 1.11 (1.00-1.22) | 0.048 |  | log additive |  |  | 1.09 (0.92-1.29) | 0.336 | 1.10 (1.01-1.20) | 0.023 | 0.0% |
rs10956368 | 128492832 | C→T | 0.41 | CC | 472 | 634 | 1 (Ref) |  | 0.39 | CC | 218 | 236 | 1 (Ref) |  |  |  |  |
 |  |  |  | CT | 718 | 859 | 1.13 (0.96-1.32) |  |  | CT | 295 | 316 | 1.00 (0.78-1.28) |  |  |  |  |
 |  |  |  | TT | 260 | 301 | 1.16 (0.95-1.43) |  |  | TT | 115 | 91 | 1.37 (0.98-1.91) |  |  |  |  |
 |  |  |  | log additive |  |  | 1.09 (0.98-1.20) | 0.100 |  | log additive |  |  | 1.12 (0.94-1.32) | 0.201 | 1.10 (1.01-1.20) | 0.035 | 0.0% |
rs7005829 | 128504126 | C→T | 0.29 | CC | 703 | 925 | 1 (Ref) |  | 0.28 | CC | 350 | 328 | 1 (Ref) |  |  |  |  |
 |  |  |  | CT | 624 | 722 | 1.14 (0.99-1.32) |  |  | CT | 237 | 270 | 0.82 (0.65-1.03) |  |  |  |  |
 |  |  |  | TT | 129 | 152 | 1.12 (0.86-1.44) |  |  | TT | 51 | 48 | 1.00 (0.66-1.53) |  |  |  |  |
 |  |  |  | log additive |  |  | 1.09 (0.98-1.21) | 0.113 |  | log additive |  |  | 0.94 (0.78-1.13) | 0.523 | 1.03 (0.90-1.19) | 0.647 | 53.4% |
rs9297756 | 128509349 | C→T | 0.15 | CC | 980 | 1290 | 1 (Ref) |  | 0.16 | CC | 462 | 450 | 1 (Ref) |  |  |  |  |
 |  |  |  | CT | 428 | 458 | 1.23 (1.05-1.44) |  |  | CT | 158 | 181 | 0.84 (0.65-1.08) |  |  |  |  |
 |  |  |  | TT | 46 | 42 | 1.42 (0.92-2.17) |  |  | TT | 15 | 11 | 1.36 (0.62-3.01) |  |  |  |  |
 |  |  |  | log additive |  |  | 1.22 (1.07-1.39) | 0.004 |  | log additive |  |  | 0.93 (0.74-1.18) | 0.570 | 1.08 (0.83-1.41) | 0.547 | 78.4% |
rs12334695 | 128523110 | T→C | 0.38 | TT | 522 | 684 | 1 (Ref) |  | 0.38 | TT | 252 | 245 | 1 (Ref) |  |  |  |  |
 |  |  |  | TC | 678 | 833 | 1.08 (0.93-1.26) |  |  | TC | 286 | 304 | 0.90 (0.71-1.15) |  |  |  |  |
 |  |  |  | CC | 235 | 268 | 1.16 (0.94-1.43) |  |  | CC | 95 | 89 | 1.04 (0.74-1.46) |  |  |  |  |
 |  |  |  | log additive |  |  | 1.08 (0.97-1.19) | 0.148 |  | log additive |  |  | 1.01 (0.85-1.19) | 0.937 | 1.06 (0.97-1.16) | 0.186 | 0.0% |
rs10109622 | 128527333 | C→T | 0.23 | CC | 896 | 1077 | 1 (Ref) |  | 0.23 | CC | 393 | 388 | 1 (Ref) |  |  |  |  |
 |  |  |  | CT | 478 | 622 | 0.92 (0.79-1.07) |  |  | CT | 203 | 220 | 0.91 (0.72-1.15) |  |  |  |  |
 |  |  |  | TT | 83 | 99 | 1.02 (0.76-1.39) |  |  | TT | 39 | 38 | 1.01 (0.63-1.62) |  |  |  |  |
 |  |  |  | log additive |  |  | 0.96 (0.86-1.08) | 0.537 |  | log additive |  |  | 0.99 (0.82-1.20) | 0.954 | 0.97 (0.88-1.07) | 0.512 | 0.0% |
rs10094059 | 128530789 | G→C | 0.24 | GG | 847 | 1030 | 1 (Ref) |  | 0.25 | GG | 346 | 378 | 1 (Ref) |  |  |  |  |
 |  |  |  | GC | 523 | 677 | 0.94 (0.81-1.08) |  |  | GC | 258 | 221 | 1.28 (1.01-1.61) |  |  |  |  |
 |  |  |  | CC | 87 | 93 | 1.13 (0.83-1.53) |  |  | CC | 41 | 55 | 0.82 (0.53-1.26) |  |  |  |  |
 |  |  |  | log additive |  |  | 0.99 (0.88-1.11) | 0.908 |  | log additive |  |  | 1.01 (0.84-1.22) | 0.888 | 1.00 (0.90-1.10) | 0.929 | 0.0% |
rs7841264 | 128535996 | C→T | 0.18 | CC | 1009 | 1190 | 1 (Ref) |  | 0.17 | CC | 449 | 444 | 1 (Ref) |  |  |  |  |
 |  |  |  | CT | 395 | 546 | 0.85 (0.73-0.99) |  |  | CT | 166 | 174 | 0.95 (0.74-1.22) |  |  |  |  |
 |  |  |  | TT | 50 | 59 | 1.01 (0.68-1.48) |  |  | TT | 15 | 22 | 0.68 (0.34-1.33) |  |  |  |  |
 |  |  |  | log additive |  |  | 0.90 (0.79-1.03) | 0.118 | 0.17 | log additive |  |  | 0.93 (0.75-1.16) | 0.526 | 0.91 (0.81-1.02) | 0.095 | 0.0% |