TY - JOUR AU - Comings, D. PY - 1971 DA - 1971// TI - A general theory of carcinogenesis JO - Proc Natl Acad Sci VL - 70 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.70.12.3324 DO - 10.1073/pnas.70.12.3324 ID - Comings1971 ER - TY - JOUR AU - Knudson, A. PY - 2001 DA - 2001// TI - Two genetic hits (more or less) to cancer JO - Nat Rev Cancer VL - 1 UR - https://doi.org/10.1038/35101031 DO - 10.1038/35101031 ID - Knudson2001 ER - TY - JOUR AU - Thiagalingam, S. AU - Foy, R. AU - Cheng, K. AU - Lee, H. AU - Thigalingam, A. AU - Ponte, J. PY - 2002 DA - 2002// TI - Loss of heterozygosity as a predictor to map tumor suppressor genes in cancer: molecular basis of its occurrence JO - Curr Opin Oncol VL - 14 UR - https://doi.org/10.1097/00001622-200201000-00012 DO - 10.1097/00001622-200201000-00012 ID - Thiagalingam2002 ER - TY - JOUR AU - Lipshutz, R. AU - Fodor, S. AU - Gingeras, T. AU - Lockhart, D. PY - 1999 DA - 1999// TI - High density synthetic oligonucleotide arrays JO - Nat Genet VL - 21 UR - https://doi.org/10.1038/4447 DO - 10.1038/4447 ID - Lipshutz1999 ER - TY - JOUR AU - Collela, S. AU - Yau, C. AU - Taylor, J. AU - Mirza, G. AU - Butler, H. AU - Clouston, P. AU - Bassett, A. AU - Seller, A. AU - Holmes, C. AU - Ragoussis, J. PY - 2007 DA - 2007// TI - QuantiSNP: an objective Bayes Hidden-Markov Model to detect and accurately map copy number variation using SNP genotyping data JO - Nuceic Acids Res VL - 35 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm076 DO - 10.1093/nar/gkm076 ID - Collela2007 ER - TY - STD TI - Wang K, Li M, Hadley D, Liu R, Glessner J, Grant S, Hakonarson H, Bucan M: PennCNV: an integrated Hidden-Markov Model designed for high-resolution copy number variation detection in whole-genome SNP genotyping data. Genome Res. 17: 1665-1674. 10.1101/gr.6861907. ID - ref6 ER - TY - JOUR AU - Beroukhim, R. AU - Lin, M. AU - Park, Y. AU - Hao, K. AU - Zhao, X. AU - Garraway, L. AU - Fox, E. AU - Hochberg, E. AU - Mellinghoff, I. AU - Hofer, M. AU - Descazeaud, A. AU - Rubin, M. AU - Meyerson, M. AU - Wong, W. AU - Sellers, W. AU - Li, C. PY - 2009 DA - 2009// TI - Inferring loss-of-heterozygosity from unpaired tumors using high-density oligonucleotide SNP arrays JO - PLOS Comput Biol VL - 2 ID - Beroukhim2009 ER - TY - JOUR AU - Lin, M. AU - Wei, L. AU - Sellers, W. AU - Lieberfarb, M. AU - Wong, W. AU - Li, C. PY - 2004 DA - 2004// TI - dChipSNP: significance curve and clustering of SNP-array-based loss-of-heterozygosity data JO - Bioinformatics VL - 20 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bth069 DO - 10.1093/bioinformatics/bth069 ID - Lin2004 ER - TY - JOUR AU - Tsuzuki, S. AU - Karnan, S. AU - Horibe, K. AU - Matsumoto, K. AU - Kato, K. AU - Inukai, T. AU - Goi, K. AU - Sugita, K. AU - Nakazawa, S. AU - Kasugai, Y. AU - Ueda, R. AU - Seto, M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Genetic abnormalities involved in t(12;21) TEL-AML1acute lymphoblastic leukemia: Analysis by means of array-based comparative genomic hybridization JO - Cancer Sci VL - 98 UR - https://doi.org/10.1111/j.1349-7006.2007.00443.x DO - 10.1111/j.1349-7006.2007.00443.x ID - Tsuzuki2007 ER - TY - JOUR AU - Wlodarska, I. AU - Pittaluga, S. AU - Hagemeijer, H. AU - De Wolf-Peeters, C. AU - Berghe, H. V. a. n. D. e. n. PY - 1999 DA - 1999// TI - Secondary chromosomal changes in mantle cell lymphoma JO - Haematologica VL - 84 ID - Wlodarska1999 ER - TY - JOUR AU - Tran, H. AU - Nourse, J. AU - Hall, S. AU - Green, M. AU - Griffiths, L. AU - Gandhi, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Immunodeficiency-associated lymphomas JO - Blood Rev VL - 22 UR - https://doi.org/10.1016/j.blre.2008.03.009 DO - 10.1016/j.blre.2008.03.009 ID - Tran2008 ER - TY - JOUR AU - Hill, D. AU - Wang, S. AU - Cerhan, J. AU - Davis, S. AU - Cozen, W. AU - Severson, R. AU - Hartge, P. AU - Wacholder, S. AU - Yeager, M. AU - Chanock, S. AU - Rothman, N. PY - 2006 DA - 2006// TI - Risk of non-Hodgkin's lymphoma (NHL) in relation to germline variation in DNA repair and related genes JO - Blood VL - 108 UR - https://doi.org/10.1182/blood-2005-01-026690 DO - 10.1182/blood-2005-01-026690 ID - Hill2006 ER - TY - JOUR AU - Shen, M. AU - Zheng, T. AU - Lan, Q. AU - Zhang, Y. AU - Zahm, S. AU - Wang, S. AU - Holford, T. AU - Leaderer, B. AU - Yeager, M. AU - Welch, R. AU - Kang, D. AU - Boyle, P. AU - Zhang, B. AU - Zou, K. AU - Zhu, Y. AU - Chanock, S. AU - Rothman, N. PY - 2006 DA - 2006// TI - Polymorphisms in DNA repair genes and risk of non- Hodgkin's lymphoma among women in Connecticut JO - Hum Genet VL - 119 UR - https://doi.org/10.1007/s00439-006-0177-2 DO - 10.1007/s00439-006-0177-2 ID - Shen2006 ER - TY - JOUR AU - Ekstrom-Smedby, K. AU - Lindgren, C. AU - Hjalgrim, H. AU - Humphreys, K. AU - Schollkopf, C. AU - Chang, E. AU - Roos, G. AU - Ryder, L. AU - Falk, K. AU - Palmgren, J. AU - Kere, J. AU - Melbye, M. AU - Glimelius, B. AU - Adami, H. PY - 2006 DA - 2006// TI - Variation in DNA repair genes ERCC2, XRCC1, and XRCC3 and risk of Follicular Lymphoma JO - Cancer Epidemiol Biomarkers Prev VL - 15 UR - https://doi.org/10.1158/1055-9965.EPI-05-0583 DO - 10.1158/1055-9965.EPI-05-0583 ID - Ekstrom-Smedby2006 ER - TY - JOUR AU - Taniguchi, T. AU - Garcia-Higuera, I. AU - Andreassen, P. AU - Gregory, R. AU - Grompe, M. AU - D'Andrea, A. PY - 2002 DA - 2002// TI - S-phase-specific interaction of the Fanconi anemia protein, FANCD2, with BRCA1 and RAD51 JO - Blood VL - 100 UR - https://doi.org/10.1182/blood-2002-01-0278 DO - 10.1182/blood-2002-01-0278 ID - Taniguchi2002 ER - TY - JOUR AU - Freie, B. AU - Ciccone, S. AU - Li, X. AU - Plett, P. AU - Orschell, C. AU - Srour, E. AU - Hanenberg, H. AU - Shindler, D. AU - Lee, S. AU - Clapp, W. PY - 2004 DA - 2004// TI - A role for the Fanconi anemia C protein in maintaining the DNA damage-induced G2 checkpoint JO - J Biol Chem VL - 279 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M407160200 DO - 10.1074/jbc.M407160200 ID - Freie2004 ER - TY - JOUR AU - Hakem, R. PY - 2008 DA - 2008// TI - DNA-damage repair; the good, the bad, and the ugly JO - EMBO J VL - 27 UR - https://doi.org/10.1038/emboj.2008.15 DO - 10.1038/emboj.2008.15 ID - Hakem2008 ER - TY - JOUR AU - Bai, J. AU - Brody, J. AU - Kadkol, S. AU - Pasternack, G. PY - 2001 DA - 2001// TI - Tumor suppression and potentiation by manipulation of pp32 expression JO - Oncogene VL - 20 UR - https://doi.org/10.1038/sj.onc.1204294 DO - 10.1038/sj.onc.1204294 ID - Bai2001 ER - TY - JOUR AU - El Kasmi, K. AU - Smith, A. AU - Williams, L. AU - Neale, G. AU - Panopolous, A. AU - Watowich, S. AU - Haker, H. AU - Foxwell, B. AU - Murray, P. PY - 2007 DA - 2007// TI - A transcriptional repressor and corepressor induced by the STAT3-regulated anti-inflammatory signaling pathway JO - J Immunol VL - 179 UR - https://doi.org/10.4049/jimmunol.179.11.7215 DO - 10.4049/jimmunol.179.11.7215 ID - El Kasmi2007 ER - TY - JOUR AU - Pfiefer, D. AU - Pantic, M. AU - Skatulla, I. AU - Rawluk, J. AU - Kreutz, C. AU - Martenz, U. AU - Fisch, P. AU - Timmer, J. AU - Veelken, H. PY - 2007 DA - 2007// TI - Genome-wide analysis of DNA copy number and LOH in CLL using high-density SNP arrays JO - Blood VL - 109 UR - https://doi.org/10.1182/blood-2006-07-034256 DO - 10.1182/blood-2006-07-034256 ID - Pfiefer2007 ER - TY - JOUR AU - Baeuerle, P. AU - Henkle, T. PY - 1994 DA - 1994// TI - Function and activation of NFkappa-B in the immune system JO - Ann Rev Immunol VL - 12 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.iy.12.040194.001041 DO - 10.1146/annurev.iy.12.040194.001041 ID - Baeuerle1994 ER - TY - STD TI - The pre-publication history for this paper can be accessed here:http://www.biomedcentral.com/1471-2407/10/195/prepub UR - http://www.biomedcentral.com/1471-2407/10/195/prepub ID - ref22 ER -